RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482269.1

TTLL3-227, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 2

Gene TTLL3, Length 882 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-227ENST00000482269 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.81■■■□□ 2.04
TTLL3-227ENST00000482269 KDM6BO15054 1643 aa27.79■■■□□ 2.04
TTLL3-227ENST00000482269 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.79■■■□□ 2.04
TTLL3-227ENST00000482269 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.79■■■□□ 2.04
TTLL3-227ENST00000482269 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
TTLL3-227ENST00000482269 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.76■■■□□ 2.03
TTLL3-227ENST00000482269 AKNAQ7Z591 1439 aa27.75■■■□□ 2.03
TTLL3-227ENST00000482269 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.03
TTLL3-227ENST00000482269 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
TTLL3-227ENST00000482269 ADGRL1O94910 1474 aa27.68■■■□□ 2.02
TTLL3-227ENST00000482269 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.02
TTLL3-227ENST00000482269 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
TTLL3-227ENST00000482269 SCAPERQ9BY12 1400 aa27.63■■■□□ 2.01
TTLL3-227ENST00000482269 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.62■■■□□ 2.01
TTLL3-227ENST00000482269 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.62■■■□□ 2.01
TTLL3-227ENST00000482269 ABCC1P33527 1531 aa27.62■■■□□ 2.01
TTLL3-227ENST00000482269 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa27.6■■■□□ 2.01
TTLL3-227ENST00000482269 RICTORQ6R327 1708 aa27.6■■■□□ 2.01
TTLL3-227ENST00000482269 MIA2Q96PC5 1412 aa27.58■■■□□ 2.01
TTLL3-227ENST00000482269 RAPGEF3O95398 923 aa27.58■■■□□ 2.01
TTLL3-227ENST00000482269 POGZQ7Z3K3 1410 aa27.57■■■□□ 2
TTLL3-227ENST00000482269 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27.57■■■□□ 2
TTLL3-227ENST00000482269 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.56■■■□□ 2
TTLL3-227ENST00000482269 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
TTLL3-227ENST00000482269 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.53■■■□□ 2
TTLL3-227ENST00000482269 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.53■■■□□ 2
TTLL3-227ENST00000482269 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa27.53■■■□□ 2
TTLL3-227ENST00000482269 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
TTLL3-227ENST00000482269 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.52■■■□□ 2
TTLL3-227ENST00000482269 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.5■■□□□ 1.99
TTLL3-227ENST00000482269 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.49■■□□□ 1.99
TTLL3-227ENST00000482269 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa27.49■■□□□ 1.99
TTLL3-227ENST00000482269 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa27.49■■□□□ 1.99
TTLL3-227ENST00000482269 AFAP1Q8N556 730 aa27.47■■□□□ 1.99
TTLL3-227ENST00000482269 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.47■■□□□ 1.99
TTLL3-227ENST00000482269 KDM5CP41229 1560 aa27.47■■□□□ 1.99
TTLL3-227ENST00000482269 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.45■■□□□ 1.99
TTLL3-227ENST00000482269 MBD5Q9P267 1494 aa27.45■■□□□ 1.99
TTLL3-227ENST00000482269 RSPH4AQ5TD94 716 aa27.44■■□□□ 1.98
TTLL3-227ENST00000482269 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
TTLL3-227ENST00000482269 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.41■■□□□ 1.98
TTLL3-227ENST00000482269 HECW2Q9P2P5 1572 aa27.4■■□□□ 1.98
TTLL3-227ENST00000482269 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.39■■□□□ 1.98
TTLL3-227ENST00000482269 MLH3Q9UHC1 1453 aa27.39■■□□□ 1.98
TTLL3-227ENST00000482269 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27.39■■□□□ 1.98
TTLL3-227ENST00000482269 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.37■■□□□ 1.97
TTLL3-227ENST00000482269 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
TTLL3-227ENST00000482269 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.36■■□□□ 1.97
TTLL3-227ENST00000482269 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.33■■□□□ 1.97
TTLL3-227ENST00000482269 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa27.33■■□□□ 1.97
TTLL3-227ENST00000482269 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
TTLL3-227ENST00000482269 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
TTLL3-227ENST00000482269 TSPY4P0CV99 314 aa27.31■■□□□ 1.96
TTLL3-227ENST00000482269 TSPY10P0CW01 314 aa27.31■■□□□ 1.96
TTLL3-227ENST00000482269 ATP7AQ04656 1500 aa27.31■■□□□ 1.96
TTLL3-227ENST00000482269 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.3■■□□□ 1.96
TTLL3-227ENST00000482269 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
TTLL3-227ENST00000482269 ATP10AO60312 1499 aa27.28■■□□□ 1.96
TTLL3-227ENST00000482269 ABCA6Q8N139 1617 aa27.27■■□□□ 1.96
TTLL3-227ENST00000482269 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa27.27■■□□□ 1.96
TTLL3-227ENST00000482269 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
TTLL3-227ENST00000482269 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.27■■□□□ 1.96
TTLL3-227ENST00000482269 CROCC2H7BZ55 1655 aa27.27■■□□□ 1.96
TTLL3-227ENST00000482269 MAST1Q9Y2H9 1570 aa27.26■■□□□ 1.96
TTLL3-227ENST00000482269 ABCC5O15440 1437 aa27.26■■□□□ 1.95
TTLL3-227ENST00000482269 DAPK1P53355 1430 aa27.26■■□□□ 1.95
TTLL3-227ENST00000482269 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.24■■□□□ 1.95
TTLL3-227ENST00000482269 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27.24■■□□□ 1.95
TTLL3-227ENST00000482269 REREQ9P2R6 1566 aa27.22■■□□□ 1.95
TTLL3-227ENST00000482269 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.21■■□□□ 1.95
TTLL3-227ENST00000482269 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
TTLL3-227ENST00000482269 PLXNC1O60486 1568 aa27.15■■□□□ 1.94
TTLL3-227ENST00000482269 A2MP01023 1474 aa27.15■■□□□ 1.94
TTLL3-227ENST00000482269 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa27.14■■□□□ 1.94
TTLL3-227ENST00000482269 AGLP35573 1532 aa27.12■■□□□ 1.93
TTLL3-227ENST00000482269 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa27.1■■□□□ 1.93
TTLL3-227ENST00000482269 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.1■■□□□ 1.93
TTLL3-227ENST00000482269 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
TTLL3-227ENST00000482269 ADGRL2O95490 1459 aa27.09■■□□□ 1.93
TTLL3-227ENST00000482269 PTPRKQ15262 1439 aa27.08■■□□□ 1.93
TTLL3-227ENST00000482269 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.08■■□□□ 1.93
TTLL3-227ENST00000482269 ITGAEP38570 1179 aa27.07■■□□□ 1.92
TTLL3-227ENST00000482269 NCOA1Q15788 1441 aa27.07■■□□□ 1.92
TTLL3-227ENST00000482269 KIF15Q9NS87 1388 aa27.06■■□□□ 1.92
TTLL3-227ENST00000482269 DUOX2Q9NRD8 1548 aa27.06■■□□□ 1.92
TTLL3-227ENST00000482269 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.04■■□□□ 1.92
TTLL3-227ENST00000482269 ROCK1Q13464 1354 aa27.03■■□□□ 1.92
TTLL3-227ENST00000482269 ADAMTSL3P82987 1691 aa27.01■■□□□ 1.91
TTLL3-227ENST00000482269 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa26.99■■□□□ 1.91
TTLL3-227ENST00000482269 MLECQ14165 292 aa26.99■■□□□ 1.91
TTLL3-227ENST00000482269 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
TTLL3-227ENST00000482269 ERBINQ96RT1 1412 aa26.98■■□□□ 1.91
TTLL3-227ENST00000482269 KIF3BO15066 747 aa26.96■■□□□ 1.91
TTLL3-227ENST00000482269 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa26.94■■□□□ 1.9
TTLL3-227ENST00000482269 MADDQ8WXG6 1647 aa26.94■■□□□ 1.9
TTLL3-227ENST00000482269 GGT6Q6P531 493 aa26.91■■□□□ 1.9
TTLL3-227ENST00000482269 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.9■■□□□ 1.9
TTLL3-227ENST00000482269 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
TTLL3-227ENST00000482269 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.9■■□□□ 1.9
TTLL3-227ENST00000482269 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.6 ms