RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481800.1

COL9A3-212, Transcript of collagen type IX alpha 3 chain, humanhuman

TSL 4

Gene COL9A3, Length 548 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3-212ENST00000481800 RICTORQ6R327 1708 aa28.22■■■□□ 2.11
COL9A3-212ENST00000481800 POGZQ7Z3K3 1410 aa28.22■■■□□ 2.11
COL9A3-212ENST00000481800 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.19■■■□□ 2.1
COL9A3-212ENST00000481800 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.18■■■□□ 2.1
COL9A3-212ENST00000481800 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.18■■■□□ 2.1
COL9A3-212ENST00000481800 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.16■■■□□ 2.1
COL9A3-212ENST00000481800 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.15■■■□□ 2.1
COL9A3-212ENST00000481800 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.15■■■□□ 2.1
COL9A3-212ENST00000481800 MYT1LQ9UL68 1186 aa28.14■■■□□ 2.1
COL9A3-212ENST00000481800 AFAP1Q8N556 730 aa28.13■■■□□ 2.09
COL9A3-212ENST00000481800 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28.12■■■□□ 2.09
COL9A3-212ENST00000481800 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
COL9A3-212ENST00000481800 PREX2Q70Z35 1606 aa28.08■■■□□ 2.09
COL9A3-212ENST00000481800 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.06■■■□□ 2.08
COL9A3-212ENST00000481800 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.06■■■□□ 2.08
COL9A3-212ENST00000481800 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
COL9A3-212ENST00000481800 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
COL9A3-212ENST00000481800 ATP10AO60312 1499 aa28.04■■■□□ 2.08
COL9A3-212ENST00000481800 ADAMTSL3P82987 1691 aa28.03■■■□□ 2.08
COL9A3-212ENST00000481800 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.03■■■□□ 2.08
COL9A3-212ENST00000481800 PTPRMP28827 1452 aa28.02■■■□□ 2.08
COL9A3-212ENST00000481800 MLECQ14165 292 aa28.02■■■□□ 2.08
COL9A3-212ENST00000481800 ABCC1P33527 1531 aa28.01■■■□□ 2.07
COL9A3-212ENST00000481800 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.01■■■□□ 2.07
COL9A3-212ENST00000481800 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa28.01■■■□□ 2.07
COL9A3-212ENST00000481800 KDM5CP41229 1560 aa27.99■■■□□ 2.07
COL9A3-212ENST00000481800 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.99■■■□□ 2.07
COL9A3-212ENST00000481800 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.98■■■□□ 2.07
COL9A3-212ENST00000481800 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.98■■■□□ 2.07
COL9A3-212ENST00000481800 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.98■■■□□ 2.07
COL9A3-212ENST00000481800 MLH3Q9UHC1 1453 aa27.95■■■□□ 2.07
COL9A3-212ENST00000481800 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.95■■■□□ 2.06
COL9A3-212ENST00000481800 MADDQ8WXG6 1647 aa27.95■■■□□ 2.06
COL9A3-212ENST00000481800 HECW2Q9P2P5 1572 aa27.94■■■□□ 2.06
COL9A3-212ENST00000481800 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa27.92■■■□□ 2.06
COL9A3-212ENST00000481800 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.91■■■□□ 2.06
COL9A3-212ENST00000481800 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.91■■■□□ 2.06
COL9A3-212ENST00000481800 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.9■■■□□ 2.06
COL9A3-212ENST00000481800 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27.9■■■□□ 2.06
COL9A3-212ENST00000481800 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.89■■■□□ 2.06
COL9A3-212ENST00000481800 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.05
COL9A3-212ENST00000481800 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa27.88■■■□□ 2.05
COL9A3-212ENST00000481800 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa27.86■■■□□ 2.05
COL9A3-212ENST00000481800 TIAM1Q13009 1591 aa27.86■■■□□ 2.05
COL9A3-212ENST00000481800 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
COL9A3-212ENST00000481800 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
COL9A3-212ENST00000481800 NCOA2Q15596 1464 aa27.83■■■□□ 2.05
COL9A3-212ENST00000481800 ABCA6Q8N139 1617 aa27.81■■■□□ 2.04
COL9A3-212ENST00000481800 REREQ9P2R6 1566 aa27.81■■■□□ 2.04
COL9A3-212ENST00000481800 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
COL9A3-212ENST00000481800 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.79■■■□□ 2.04
COL9A3-212ENST00000481800 APLP2Q06481 763 aa27.79■■■□□ 2.04
COL9A3-212ENST00000481800 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
COL9A3-212ENST00000481800 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa27.76■■■□□ 2.03
COL9A3-212ENST00000481800 AGLP35573 1532 aa27.76■■■□□ 2.03
COL9A3-212ENST00000481800 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
COL9A3-212ENST00000481800 MAP3K1Q13233 1512 aa27.75■■■□□ 2.03
COL9A3-212ENST00000481800 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa27.74■■■□□ 2.03
COL9A3-212ENST00000481800 ATP7AQ04656 1500 aa27.72■■■□□ 2.03
COL9A3-212ENST00000481800 MBD5Q9P267 1494 aa27.72■■■□□ 2.03
COL9A3-212ENST00000481800 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
COL9A3-212ENST00000481800 RSPH4AQ5TD94 716 aa27.71■■■□□ 2.03
COL9A3-212ENST00000481800 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.68■■■□□ 2.02
COL9A3-212ENST00000481800 A2MP01023 1474 aa27.67■■■□□ 2.02
COL9A3-212ENST00000481800 LMTK3Q96Q04 1460 aa27.67■■■□□ 2.02
COL9A3-212ENST00000481800 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
COL9A3-212ENST00000481800 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.65■■■□□ 2.02
COL9A3-212ENST00000481800 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.64■■■□□ 2.01
COL9A3-212ENST00000481800 TSPY4P0CV99 314 aa27.62■■■□□ 2.01
COL9A3-212ENST00000481800 TSPY10P0CW01 314 aa27.62■■■□□ 2.01
COL9A3-212ENST00000481800 CNTLNQ9NXG0 1405 aa27.61■■■□□ 2.01
COL9A3-212ENST00000481800 HSPA2P54652 639 aa27.61■■■□□ 2.01
COL9A3-212ENST00000481800 GGT6Q6P531 493 aa27.6■■■□□ 2.01
COL9A3-212ENST00000481800 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.58■■■□□ 2.01
COL9A3-212ENST00000481800 MIA2Q96PC5 1412 aa27.57■■■□□ 2
COL9A3-212ENST00000481800 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
COL9A3-212ENST00000481800 PLXNC1O60486 1568 aa27.56■■■□□ 2
COL9A3-212ENST00000481800 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.52■■■□□ 2
COL9A3-212ENST00000481800 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.52■■■□□ 2
COL9A3-212ENST00000481800 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa27.52■■■□□ 2
COL9A3-212ENST00000481800 PPP6R1Q9UPN7 881 aa27.52■■■□□ 2
COL9A3-212ENST00000481800 ZMYM3Q14202 1370 aa27.51■■□□□ 1.99
COL9A3-212ENST00000481800 KIF3BO15066 747 aa27.5■■□□□ 1.99
COL9A3-212ENST00000481800 C3P01024 1663 aa27.46■■□□□ 1.99
COL9A3-212ENST00000481800 PREX1Q8TCU6 1659 aa27.46■■□□□ 1.99
COL9A3-212ENST00000481800 NPATQ14207 1427 aa27.41■■□□□ 1.98
COL9A3-212ENST00000481800 MROH2AA6NES4 1674 aa27.4■■□□□ 1.98
COL9A3-212ENST00000481800 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
COL9A3-212ENST00000481800 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.38■■□□□ 1.97
COL9A3-212ENST00000481800 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
COL9A3-212ENST00000481800 MAST1Q9Y2H9 1570 aa27.37■■□□□ 1.97
COL9A3-212ENST00000481800 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa27.37■■□□□ 1.97
COL9A3-212ENST00000481800 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
COL9A3-212ENST00000481800 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.35■■□□□ 1.97
COL9A3-212ENST00000481800 DMRT2Q9Y5R5 561 aa27.35■■□□□ 1.97
COL9A3-212ENST00000481800 PTPRKQ15262 1439 aa27.33■■□□□ 1.97
COL9A3-212ENST00000481800 ABCC5O15440 1437 aa27.33■■□□□ 1.96
COL9A3-212ENST00000481800 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
COL9A3-212ENST00000481800 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.29■■□□□ 1.96
COL9A3-212ENST00000481800 DAPK1P53355 1430 aa27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.2 ms