RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481211.1

NISCH-208, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 557 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-208ENST00000481211 FGD6Q6ZV73 1430 aa20.01■□□□□ 0.79
NISCH-208ENST00000481211 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
NISCH-208ENST00000481211 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
NISCH-208ENST00000481211 TEX14Q8IWB6 1497 aa19.99■□□□□ 0.79
NISCH-208ENST00000481211 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP19.98■□□□□ 0.79
NISCH-208ENST00000481211 ARHGAP5Q13017 1502 aa19.98■□□□□ 0.79
NISCH-208ENST00000481211 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa19.98■□□□□ 0.79
NISCH-208ENST00000481211 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa19.98■□□□□ 0.79
NISCH-208ENST00000481211 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa19.97■□□□□ 0.79
NISCH-208ENST00000481211 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
NISCH-208ENST00000481211 NEO1Q92859 1461 aa19.96■□□□□ 0.79
NISCH-208ENST00000481211 FANCAO15360 1455 aa19.95■□□□□ 0.78
NISCH-208ENST00000481211 PTPN23Q9H3S7 1636 aa19.94■□□□□ 0.78
NISCH-208ENST00000481211 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa19.92■□□□□ 0.78
NISCH-208ENST00000481211 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa19.91■□□□□ 0.78
NISCH-208ENST00000481211 TRHP20396 242 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
NISCH-208ENST00000481211 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa19.9■□□□□ 0.78
NISCH-208ENST00000481211 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
NISCH-208ENST00000481211 ABCC1P33527 1531 aa19.88■□□□□ 0.77
NISCH-208ENST00000481211 AKNAQ7Z591 1439 aa19.88■□□□□ 0.77
NISCH-208ENST00000481211 RSPH4AQ5TD94 716 aa19.88■□□□□ 0.77
NISCH-208ENST00000481211 ARHGEF5Q12774 1597 aa19.86■□□□□ 0.77
NISCH-208ENST00000481211 ADGRL1O94910 1474 aa19.86■□□□□ 0.77
NISCH-208ENST00000481211 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
NISCH-208ENST00000481211 TSPOAP1O95153 1857 aa19.84■□□□□ 0.77
NISCH-208ENST00000481211 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
NISCH-208ENST00000481211 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.77
NISCH-208ENST00000481211 MBD5Q9P267 1494 aa19.82■□□□□ 0.76
NISCH-208ENST00000481211 SYCP2Q9BX26 1530 aa19.81■□□□□ 0.76
NISCH-208ENST00000481211 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
NISCH-208ENST00000481211 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
NISCH-208ENST00000481211 SCAPERQ9BY12 1400 aa19.81■□□□□ 0.76
NISCH-208ENST00000481211 CCDC141Q6ZP82 1450 aa19.8■□□□□ 0.76
NISCH-208ENST00000481211 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa19.79■□□□□ 0.76
NISCH-208ENST00000481211 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP19.79■□□□□ 0.76
NISCH-208ENST00000481211 SHANK2Q9UPX8 1470 aa19.79■□□□□ 0.76
NISCH-208ENST00000481211 DAPK1P53355 1430 aa19.77■□□□□ 0.76
NISCH-208ENST00000481211 POGZQ7Z3K3 1410 aa19.77■□□□□ 0.76
NISCH-208ENST00000481211 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa19.77■□□□□ 0.76
NISCH-208ENST00000481211 ABCC5O15440 1437 aa19.76■□□□□ 0.75
NISCH-208ENST00000481211 CROCC2H7BZ55 1655 aa19.75■□□□□ 0.75
NISCH-208ENST00000481211 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP19.75■□□□□ 0.75
NISCH-208ENST00000481211 KDM5CP41229 1560 aa19.74■□□□□ 0.75
NISCH-208ENST00000481211 MAST1Q9Y2H9 1570 aa19.74■□□□□ 0.75
NISCH-208ENST00000481211 TSPY4P0CV99 314 aa19.74■□□□□ 0.75
NISCH-208ENST00000481211 TSPY10P0CW01 314 aa19.74■□□□□ 0.75
NISCH-208ENST00000481211 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa19.73■□□□□ 0.75
NISCH-208ENST00000481211 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa19.73■□□□□ 0.75
NISCH-208ENST00000481211 RICTORQ6R327 1708 aa19.72■□□□□ 0.75
NISCH-208ENST00000481211 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa19.71■□□□□ 0.75
NISCH-208ENST00000481211 ROCK1Q13464 1354 aa19.7■□□□□ 0.74
NISCH-208ENST00000481211 C9orf84Q5VXU9 1444 aa19.7■□□□□ 0.74
NISCH-208ENST00000481211 ADGRL2O95490 1459 aa19.7■□□□□ 0.74
NISCH-208ENST00000481211 MAGI2Q86UL8 1455 aa19.7■□□□□ 0.74
NISCH-208ENST00000481211 MLH3Q9UHC1 1453 aa19.69■□□□□ 0.74
NISCH-208ENST00000481211 ADGBQ8N7X0 1667 aa19.68■□□□□ 0.74
NISCH-208ENST00000481211 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa19.68■□□□□ 0.74
NISCH-208ENST00000481211 HECW2Q9P2P5 1572 aa19.68■□□□□ 0.74
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NISCH-208ENST00000481211 PLXNC1O60486 1568 aa19.66■□□□□ 0.74
NISCH-208ENST00000481211 AFAP1Q8N556 730 aa19.66■□□□□ 0.74
NISCH-208ENST00000481211 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa19.66■□□□□ 0.74
NISCH-208ENST00000481211 PTPRKQ15262 1439 aa19.66■□□□□ 0.74
NISCH-208ENST00000481211 ATP7AQ04656 1500 aa19.66■□□□□ 0.74
NISCH-208ENST00000481211 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa19.66■□□□□ 0.74
NISCH-208ENST00000481211 RAPGEF3O95398 923 aa19.64■□□□□ 0.73
NISCH-208ENST00000481211 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP19.64■□□□□ 0.73
NISCH-208ENST00000481211 NCOA1Q15788 1441 aa19.63■□□□□ 0.73
NISCH-208ENST00000481211 ITGAEP38570 1179 aa19.63■□□□□ 0.73
NISCH-208ENST00000481211 HFM1A2PYH4 1435 aa19.6■□□□□ 0.73
NISCH-208ENST00000481211 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa19.6■□□□□ 0.73
NISCH-208ENST00000481211 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.73
NISCH-208ENST00000481211 GCC2Q8IWJ2 1684 aa19.58■□□□□ 0.72
NISCH-208ENST00000481211 KIF15Q9NS87 1388 aa19.57■□□□□ 0.72
NISCH-208ENST00000481211 DUOX2Q9NRD8 1548 aa19.57■□□□□ 0.72
NISCH-208ENST00000481211 CHIC2Q9UKJ5 165 aa19.57■□□□□ 0.72
NISCH-208ENST00000481211 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa19.56■□□□□ 0.72
NISCH-208ENST00000481211 MYT1LQ9UL68 1186 aa19.56■□□□□ 0.72
NISCH-208ENST00000481211 PCGF6Q9BYE7 350 aa19.55■□□□□ 0.72
NISCH-208ENST00000481211 REREQ9P2R6 1566 aa19.55■□□□□ 0.72
NISCH-208ENST00000481211 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa19.54■□□□□ 0.72
NISCH-208ENST00000481211 NAIPQ13075 1403 aa19.54■□□□□ 0.72
NISCH-208ENST00000481211 ERBINQ96RT1 1412 aa19.54■□□□□ 0.72
NISCH-208ENST00000481211 ABCA6Q8N139 1617 aa19.54■□□□□ 0.72
NISCH-208ENST00000481211 ATP10AO60312 1499 aa19.53■□□□□ 0.72
NISCH-208ENST00000481211 SETD5Q9C0A6 1442 aa19.52■□□□□ 0.72
NISCH-208ENST00000481211 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
NISCH-208ENST00000481211 A2MP01023 1474 aa19.52■□□□□ 0.72
NISCH-208ENST00000481211 HRCP23327 699 aa19.51■□□□□ 0.71
NISCH-208ENST00000481211 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa19.51■□□□□ 0.71
NISCH-208ENST00000481211 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
NISCH-208ENST00000481211 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa19.51■□□□□ 0.71
NISCH-208ENST00000481211 YEATS2Q9ULM3 1422 aa19.51■□□□□ 0.71
NISCH-208ENST00000481211 BCORL1Q5H9F3 1711 aa19.47■□□□□ 0.71
NISCH-208ENST00000481211 AGLP35573 1532 aa19.46■□□□□ 0.71
NISCH-208ENST00000481211 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa19.43■□□□□ 0.7
NISCH-208ENST00000481211 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP19.4■□□□□ 0.7
NISCH-208ENST00000481211 UNC13BO14795 1591 aa19.4■□□□□ 0.7
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