RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481121.5

NELFE-208, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-208ENST00000481121 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP33.09■■■□□ 2.89
NELFE-208ENST00000481121 ADGRL1O94910 1474 aa33.09■■■□□ 2.89
NELFE-208ENST00000481121 RAPGEF3O95398 923 aa33.04■■■□□ 2.88
NELFE-208ENST00000481121 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa33.03■■■□□ 2.88
NELFE-208ENST00000481121 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa32.99■■■□□ 2.87
NELFE-208ENST00000481121 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP32.99■■■□□ 2.87
NELFE-208ENST00000481121 ITSN2Q9NZM3 1697 aa32.99■■■□□ 2.87
NELFE-208ENST00000481121 SCAPERQ9BY12 1400 aa32.98■■■□□ 2.87
NELFE-208ENST00000481121 POGZQ7Z3K3 1410 aa32.97■■■□□ 2.87
NELFE-208ENST00000481121 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa32.96■■■□□ 2.87
NELFE-208ENST00000481121 ABCC1P33527 1531 aa32.94■■■□□ 2.86
NELFE-208ENST00000481121 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP32.94■■■□□ 2.86
NELFE-208ENST00000481121 MAP3K1Q13233 1512 aa32.93■■■□□ 2.86
NELFE-208ENST00000481121 CCNB3Q8WWL7 1395 aa32.9■■■□□ 2.86
NELFE-208ENST00000481121 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa32.9■■■□□ 2.86
NELFE-208ENST00000481121 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa32.89■■■□□ 2.86
NELFE-208ENST00000481121 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa32.88■■■□□ 2.85
NELFE-208ENST00000481121 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa32.88■■■□□ 2.85
NELFE-208ENST00000481121 KDM5CP41229 1560 aa32.86■■■□□ 2.85
NELFE-208ENST00000481121 MAGI2Q86UL8 1455 aa32.85■■■□□ 2.85
NELFE-208ENST00000481121 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP32.85■■■□□ 2.85
NELFE-208ENST00000481121 NCOA2Q15596 1464 aa32.85■■■□□ 2.85
NELFE-208ENST00000481121 HECW2Q9P2P5 1572 aa32.82■■■□□ 2.84
NELFE-208ENST00000481121 SYCP2Q9BX26 1530 aa32.81■■■□□ 2.84
NELFE-208ENST00000481121 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa32.81■■■□□ 2.84
NELFE-208ENST00000481121 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa32.8■■■□□ 2.84
NELFE-208ENST00000481121 YEATS2Q9ULM3 1422 aa32.79■■■□□ 2.84
NELFE-208ENST00000481121 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP32.78■■■□□ 2.84
NELFE-208ENST00000481121 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP32.78■■■□□ 2.84
NELFE-208ENST00000481121 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa32.76■■■□□ 2.83
NELFE-208ENST00000481121 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa32.74■■■□□ 2.83
NELFE-208ENST00000481121 APLP2Q06481 763 aa32.74■■■□□ 2.83
NELFE-208ENST00000481121 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa32.72■■■□□ 2.83
NELFE-208ENST00000481121 AFAP1Q8N556 730 aa32.72■■■□□ 2.83
NELFE-208ENST00000481121 BCORL1Q5H9F3 1711 aa32.71■■■□□ 2.83
NELFE-208ENST00000481121 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP32.71■■■□□ 2.83
NELFE-208ENST00000481121 ABCA6Q8N139 1617 aa32.69■■■□□ 2.82
NELFE-208ENST00000481121 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa32.69■■■□□ 2.82
NELFE-208ENST00000481121 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa32.68■■■□□ 2.82
NELFE-208ENST00000481121 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa32.68■■■□□ 2.82
NELFE-208ENST00000481121 MLH3Q9UHC1 1453 aa32.68■■■□□ 2.82
NELFE-208ENST00000481121 ADAMTSL3P82987 1691 aa32.66■■■□□ 2.82
NELFE-208ENST00000481121 C9orf84Q5VXU9 1444 aa32.65■■■□□ 2.82
NELFE-208ENST00000481121 ATP10AO60312 1499 aa32.64■■■□□ 2.82
NELFE-208ENST00000481121 MYT1LQ9UL68 1186 aa32.64■■■□□ 2.82
NELFE-208ENST00000481121 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP32.64■■■□□ 2.82
NELFE-208ENST00000481121 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa32.64■■■□□ 2.82
NELFE-208ENST00000481121 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP32.62■■■□□ 2.81
NELFE-208ENST00000481121 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP32.61■■■□□ 2.81
NELFE-208ENST00000481121 REREQ9P2R6 1566 aa32.6■■■□□ 2.81
NELFE-208ENST00000481121 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP32.59■■■□□ 2.81
NELFE-208ENST00000481121 MADDQ8WXG6 1647 aa32.59■■■□□ 2.81
NELFE-208ENST00000481121 ATP7AQ04656 1500 aa32.58■■■□□ 2.81
NELFE-208ENST00000481121 MYOM3Q5VTT5 1437 aa32.57■■■□□ 2.8
NELFE-208ENST00000481121 MBD5Q9P267 1494 aa32.56■■■□□ 2.8
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NELFE-208ENST00000481121 MIA2Q96PC5 1412 aa32.5■■■□□ 2.79
NELFE-208ENST00000481121 ADGBQ8N7X0 1667 aa32.48■■■□□ 2.79
NELFE-208ENST00000481121 PTPN23Q9H3S7 1636 aa32.45■■■□□ 2.78
NELFE-208ENST00000481121 AGLP35573 1532 aa32.44■■■□□ 2.78
NELFE-208ENST00000481121 PTPRMP28827 1452 aa32.42■■■□□ 2.78
NELFE-208ENST00000481121 PLXNC1O60486 1568 aa32.41■■■□□ 2.78
NELFE-208ENST00000481121 MLECQ14165 292 aa32.4■■■□□ 2.78
NELFE-208ENST00000481121 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa32.39■■■□□ 2.78
NELFE-208ENST00000481121 RSPH4AQ5TD94 716 aa32.38■■■□□ 2.77
NELFE-208ENST00000481121 CROCC2H7BZ55 1655 aa32.37■■■□□ 2.77
NELFE-208ENST00000481121 FGD6Q6ZV73 1430 aa32.37■■■□□ 2.77
NELFE-208ENST00000481121 A2MP01023 1474 aa32.36■■■□□ 2.77
NELFE-208ENST00000481121 MAST1Q9Y2H9 1570 aa32.35■■■□□ 2.77
NELFE-208ENST00000481121 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP32.31■■■□□ 2.76
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NELFE-208ENST00000481121 TSPY10P0CW01 314 aa32.27■■■□□ 2.76
NELFE-208ENST00000481121 SHANK2Q9UPX8 1470 aa32.23■■■□□ 2.75
NELFE-208ENST00000481121 C3P01024 1663 aa32.2■■■□□ 2.74
NELFE-208ENST00000481121 MROH2AA6NES4 1674 aa32.19■■■□□ 2.74
NELFE-208ENST00000481121 DAPK1P53355 1430 aa32.19■■■□□ 2.74
NELFE-208ENST00000481121 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP32.19■■■□□ 2.74
NELFE-208ENST00000481121 ABCC5O15440 1437 aa32.17■■■□□ 2.74
NELFE-208ENST00000481121 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP32.17■■■□□ 2.74
NELFE-208ENST00000481121 PLPPR3Q6T4P5 718 aa32.15■■■□□ 2.74
NELFE-208ENST00000481121 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP32.15■■■□□ 2.74
NELFE-208ENST00000481121 CNTLNQ9NXG0 1405 aa32.14■■■□□ 2.74
NELFE-208ENST00000481121 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP32.13■■■□□ 2.73
NELFE-208ENST00000481121 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP32.12■■■□□ 2.73
NELFE-208ENST00000481121 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP32.09■■■□□ 2.73
NELFE-208ENST00000481121 PREX1Q8TCU6 1659 aa32.09■■■□□ 2.73
NELFE-208ENST00000481121 DUOX2Q9NRD8 1548 aa32.08■■■□□ 2.73
NELFE-208ENST00000481121 GGT6Q6P531 493 aa32.07■■■□□ 2.72
NELFE-208ENST00000481121 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP32.06■■■□□ 2.72
NELFE-208ENST00000481121 KIF3BO15066 747 aa32.04■■■□□ 2.72
NELFE-208ENST00000481121 FAM135AQ9P2D6 1515 aa32.04■■■□□ 2.72
NELFE-208ENST00000481121 KIF15Q9NS87 1388 aa32.03■■■□□ 2.72
NELFE-208ENST00000481121 LMTK3Q96Q04 1460 aa32.03■■■□□ 2.72
NELFE-208ENST00000481121 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP32.03■■■□□ 2.72
NELFE-208ENST00000481121 KDM5DQ9BY66 1539 aa32.01■■■□□ 2.71
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