RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480665.1

TNS1-216, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 2

Gene TNS1, Length 758 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-216ENST00000480665 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
TNS1-216ENST00000480665 SCAPERQ9BY12 1400 aa25■■□□□ 1.59
TNS1-216ENST00000480665 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
TNS1-216ENST00000480665 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.97■■□□□ 1.59
TNS1-216ENST00000480665 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.97■■□□□ 1.59
TNS1-216ENST00000480665 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.96■■□□□ 1.59
TNS1-216ENST00000480665 KDM5CP41229 1560 aa24.95■■□□□ 1.58
TNS1-216ENST00000480665 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.94■■□□□ 1.58
TNS1-216ENST00000480665 PREX2Q70Z35 1606 aa24.92■■□□□ 1.58
TNS1-216ENST00000480665 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
TNS1-216ENST00000480665 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
TNS1-216ENST00000480665 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.89■■□□□ 1.57
TNS1-216ENST00000480665 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa24.88■■□□□ 1.57
TNS1-216ENST00000480665 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.88■■□□□ 1.57
TNS1-216ENST00000480665 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.86■■□□□ 1.57
TNS1-216ENST00000480665 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa24.86■■□□□ 1.57
TNS1-216ENST00000480665 ABCC1P33527 1531 aa24.86■■□□□ 1.57
TNS1-216ENST00000480665 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.85■■□□□ 1.57
TNS1-216ENST00000480665 ABCA6Q8N139 1617 aa24.85■■□□□ 1.57
TNS1-216ENST00000480665 ATP10AO60312 1499 aa24.84■■□□□ 1.57
TNS1-216ENST00000480665 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.84■■□□□ 1.57
TNS1-216ENST00000480665 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.84■■□□□ 1.57
TNS1-216ENST00000480665 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.84■■□□□ 1.57
TNS1-216ENST00000480665 CLIP1P30622 1438 aa24.84■■□□□ 1.57
TNS1-216ENST00000480665 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.84■■□□□ 1.57
TNS1-216ENST00000480665 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.83■■□□□ 1.57
TNS1-216ENST00000480665 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
TNS1-216ENST00000480665 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.8■■□□□ 1.56
TNS1-216ENST00000480665 REREQ9P2R6 1566 aa24.8■■□□□ 1.56
TNS1-216ENST00000480665 AFAP1Q8N556 730 aa24.79■■□□□ 1.56
TNS1-216ENST00000480665 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.76■■□□□ 1.55
TNS1-216ENST00000480665 MLH3Q9UHC1 1453 aa24.76■■□□□ 1.55
TNS1-216ENST00000480665 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.76■■□□□ 1.55
TNS1-216ENST00000480665 MLECQ14165 292 aa24.75■■□□□ 1.55
TNS1-216ENST00000480665 HSPA2P54652 639 aa24.71■■□□□ 1.55
TNS1-216ENST00000480665 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
TNS1-216ENST00000480665 AGLP35573 1532 aa24.67■■□□□ 1.54
TNS1-216ENST00000480665 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.67■■□□□ 1.54
TNS1-216ENST00000480665 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.66■■□□□ 1.54
TNS1-216ENST00000480665 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.66■■□□□ 1.54
TNS1-216ENST00000480665 C3P01024 1663 aa24.63■■□□□ 1.53
TNS1-216ENST00000480665 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
TNS1-216ENST00000480665 TIAM1Q13009 1591 aa24.6■■□□□ 1.53
TNS1-216ENST00000480665 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
TNS1-216ENST00000480665 STRCQ7RTU9 1775 aa24.58■■□□□ 1.53
TNS1-216ENST00000480665 PLXNC1O60486 1568 aa24.57■■□□□ 1.52
TNS1-216ENST00000480665 CEP162Q5TB80 1403 aa24.54■■□□□ 1.52
TNS1-216ENST00000480665 ATP7AQ04656 1500 aa24.54■■□□□ 1.52
TNS1-216ENST00000480665 FBXO41Q8TF61 875 aa24.53■■□□□ 1.52
TNS1-216ENST00000480665 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.52■■□□□ 1.52
TNS1-216ENST00000480665 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.52■■□□□ 1.52
TNS1-216ENST00000480665 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
TNS1-216ENST00000480665 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.5■■□□□ 1.51
TNS1-216ENST00000480665 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
TNS1-216ENST00000480665 MBD5Q9P267 1494 aa24.49■■□□□ 1.51
TNS1-216ENST00000480665 MROH2AA6NES4 1674 aa24.48■■□□□ 1.51
TNS1-216ENST00000480665 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.47■■□□□ 1.51
TNS1-216ENST00000480665 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
TNS1-216ENST00000480665 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.46■■□□□ 1.51
TNS1-216ENST00000480665 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
TNS1-216ENST00000480665 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.46■■□□□ 1.51
TNS1-216ENST00000480665 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.45■■□□□ 1.51
TNS1-216ENST00000480665 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.45■■□□□ 1.5
TNS1-216ENST00000480665 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
TNS1-216ENST00000480665 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
TNS1-216ENST00000480665 A2MP01023 1474 aa24.42■■□□□ 1.5
TNS1-216ENST00000480665 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
TNS1-216ENST00000480665 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.4■■□□□ 1.5
TNS1-216ENST00000480665 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.4■■□□□ 1.5
TNS1-216ENST00000480665 NCOA2Q15596 1464 aa24.38■■□□□ 1.49
TNS1-216ENST00000480665 NPATQ14207 1427 aa24.34■■□□□ 1.49
TNS1-216ENST00000480665 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.33■■□□□ 1.49
TNS1-216ENST00000480665 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.33■■□□□ 1.49
TNS1-216ENST00000480665 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
TNS1-216ENST00000480665 ZMYM3Q14202 1370 aa24.32■■□□□ 1.48
TNS1-216ENST00000480665 CERKQ8TCT0 537 aa24.32■■□□□ 1.48
TNS1-216ENST00000480665 NCOA1Q15788 1441 aa24.32■■□□□ 1.48
TNS1-216ENST00000480665 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.3■■□□□ 1.48
TNS1-216ENST00000480665 PTPRKQ15262 1439 aa24.3■■□□□ 1.48
TNS1-216ENST00000480665 PTPRTO14522 1441 aa24.29■■□□□ 1.48
TNS1-216ENST00000480665 LTBP4Q8N2S1 1624 aa24.29■■□□□ 1.48
TNS1-216ENST00000480665 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.29■■□□□ 1.48
TNS1-216ENST00000480665 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.28■■□□□ 1.48
TNS1-216ENST00000480665 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa24.28■■□□□ 1.48
TNS1-216ENST00000480665 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.27■■□□□ 1.48
TNS1-216ENST00000480665 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.26■■□□□ 1.47
TNS1-216ENST00000480665 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.25■■□□□ 1.47
TNS1-216ENST00000480665 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
TNS1-216ENST00000480665 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
TNS1-216ENST00000480665 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
TNS1-216ENST00000480665 GGT6Q6P531 493 aa24.2■■□□□ 1.46
TNS1-216ENST00000480665 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
TNS1-216ENST00000480665 MAP3K1Q13233 1512 aa24.17■■□□□ 1.46
TNS1-216ENST00000480665 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
TNS1-216ENST00000480665 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.16■■□□□ 1.46
TNS1-216ENST00000480665 PLA2R1Q13018 1463 aa24.16■■□□□ 1.46
TNS1-216ENST00000480665 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
TNS1-216ENST00000480665 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.15■■□□□ 1.46
TNS1-216ENST00000480665 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.15■■□□□ 1.46
TNS1-216ENST00000480665 MROH1Q8NDA8 1641 aa24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms