RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479554.5

ATG4B-218, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 4

Gene ATG4B, Length 556 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-218ENST00000479554 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.29■■□□□ 1.32
ATG4B-218ENST00000479554 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.29■■□□□ 1.32
ATG4B-218ENST00000479554 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
ATG4B-218ENST00000479554 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.28■■□□□ 1.32
ATG4B-218ENST00000479554 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.27■■□□□ 1.32
ATG4B-218ENST00000479554 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.27■■□□□ 1.32
ATG4B-218ENST00000479554 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.26■■□□□ 1.31
ATG4B-218ENST00000479554 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.25■■□□□ 1.31
ATG4B-218ENST00000479554 MADDQ8WXG6 1647 aa23.24■■□□□ 1.31
ATG4B-218ENST00000479554 PTPRMP28827 1452 aa23.24■■□□□ 1.31
ATG4B-218ENST00000479554 PREX2Q70Z35 1606 aa23.2■■□□□ 1.3
ATG4B-218ENST00000479554 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.19■■□□□ 1.3
ATG4B-218ENST00000479554 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.18■■□□□ 1.3
ATG4B-218ENST00000479554 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.17■■□□□ 1.3
ATG4B-218ENST00000479554 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
ATG4B-218ENST00000479554 KDM5CP41229 1560 aa23.14■■□□□ 1.3
ATG4B-218ENST00000479554 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.13■■□□□ 1.29
ATG4B-218ENST00000479554 ABCC1P33527 1531 aa23.13■■□□□ 1.29
ATG4B-218ENST00000479554 ATP10AO60312 1499 aa23.12■■□□□ 1.29
ATG4B-218ENST00000479554 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.12■■□□□ 1.29
ATG4B-218ENST00000479554 CEP162Q5TB80 1403 aa23.09■■□□□ 1.29
ATG4B-218ENST00000479554 AFAP1Q8N556 730 aa23.09■■□□□ 1.29
ATG4B-218ENST00000479554 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.09■■□□□ 1.29
ATG4B-218ENST00000479554 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa23.06■■□□□ 1.28
ATG4B-218ENST00000479554 MLECQ14165 292 aa23.06■■□□□ 1.28
ATG4B-218ENST00000479554 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.06■■□□□ 1.28
ATG4B-218ENST00000479554 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.06■■□□□ 1.28
ATG4B-218ENST00000479554 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.06■■□□□ 1.28
ATG4B-218ENST00000479554 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.04■■□□□ 1.28
ATG4B-218ENST00000479554 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.04■■□□□ 1.28
ATG4B-218ENST00000479554 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.03■■□□□ 1.28
ATG4B-218ENST00000479554 ABCA6Q8N139 1617 aa23.03■■□□□ 1.28
ATG4B-218ENST00000479554 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
ATG4B-218ENST00000479554 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.01■■□□□ 1.27
ATG4B-218ENST00000479554 REREQ9P2R6 1566 aa23.01■■□□□ 1.27
ATG4B-218ENST00000479554 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23■■□□□ 1.27
ATG4B-218ENST00000479554 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.99■■□□□ 1.27
ATG4B-218ENST00000479554 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.99■■□□□ 1.27
ATG4B-218ENST00000479554 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.99■■□□□ 1.27
ATG4B-218ENST00000479554 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
ATG4B-218ENST00000479554 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.99■■□□□ 1.27
ATG4B-218ENST00000479554 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.96■■□□□ 1.27
ATG4B-218ENST00000479554 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.94■■□□□ 1.26
ATG4B-218ENST00000479554 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
ATG4B-218ENST00000479554 TIAM1Q13009 1591 aa22.93■■□□□ 1.26
ATG4B-218ENST00000479554 AGLP35573 1532 aa22.92■■□□□ 1.26
ATG4B-218ENST00000479554 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.91■■□□□ 1.26
ATG4B-218ENST00000479554 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.254e-7■■■■□ 21.8
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ATG4B-218ENST00000479554 ATP7AQ04656 1500 aa22.87■■□□□ 1.25
ATG4B-218ENST00000479554 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.87■■□□□ 1.25
ATG4B-218ENST00000479554 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
ATG4B-218ENST00000479554 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
ATG4B-218ENST00000479554 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.84■■□□□ 1.25
ATG4B-218ENST00000479554 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.84■■□□□ 1.25
ATG4B-218ENST00000479554 HSPA2P54652 639 aa22.84■■□□□ 1.25
ATG4B-218ENST00000479554 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
ATG4B-218ENST00000479554 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
ATG4B-218ENST00000479554 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
ATG4B-218ENST00000479554 NCOA2Q15596 1464 aa22.81■■□□□ 1.24
ATG4B-218ENST00000479554 C3P01024 1663 aa22.8■■□□□ 1.24
ATG4B-218ENST00000479554 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
ATG4B-218ENST00000479554 PLXNC1O60486 1568 aa22.79■■□□□ 1.24
ATG4B-218ENST00000479554 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.78■■□□□ 1.24
ATG4B-218ENST00000479554 A2MP01023 1474 aa22.78■■□□□ 1.24
ATG4B-218ENST00000479554 MBD5Q9P267 1494 aa22.78■■□□□ 1.24
ATG4B-218ENST00000479554 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.76■■□□□ 1.23
ATG4B-218ENST00000479554 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.74■■□□□ 1.23
ATG4B-218ENST00000479554 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.74■■□□□ 1.23
ATG4B-218ENST00000479554 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.73■■□□□ 1.23
ATG4B-218ENST00000479554 MROH2AA6NES4 1674 aa22.73■■□□□ 1.23
ATG4B-218ENST00000479554 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.72■■□□□ 1.23
ATG4B-218ENST00000479554 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.71■■□□□ 1.23
ATG4B-218ENST00000479554 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.23
ATG4B-218ENST00000479554 MAP3K1Q13233 1512 aa22.7■■□□□ 1.22
ATG4B-218ENST00000479554 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
ATG4B-218ENST00000479554 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.65■■□□□ 1.22
ATG4B-218ENST00000479554 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.64■■□□□ 1.21
ATG4B-218ENST00000479554 GGT6Q6P531 493 aa22.64■■□□□ 1.21
ATG4B-218ENST00000479554 NPATQ14207 1427 aa22.64■■□□□ 1.21
ATG4B-218ENST00000479554 ZMYM3Q14202 1370 aa22.63■■□□□ 1.21
ATG4B-218ENST00000479554 FBXO41Q8TF61 875 aa22.63■■□□□ 1.21
ATG4B-218ENST00000479554 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
ATG4B-218ENST00000479554 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
ATG4B-218ENST00000479554 STRCQ7RTU9 1775 aa22.62■■□□□ 1.21
ATG4B-218ENST00000479554 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.59■■□□□ 1.21
ATG4B-218ENST00000479554 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.58■■□□□ 1.21
ATG4B-218ENST00000479554 TSPY4P0CV99 314 aa22.57■■□□□ 1.2
ATG4B-218ENST00000479554 TSPY10P0CW01 314 aa22.57■■□□□ 1.2
ATG4B-218ENST00000479554 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.57■■□□□ 1.2
ATG4B-218ENST00000479554 MIA2Q96PC5 1412 aa22.57■■□□□ 1.2
ATG4B-218ENST00000479554 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.56■■□□□ 1.2
ATG4B-218ENST00000479554 APLP2Q06481 763 aa22.55■■□□□ 1.2
ATG4B-218ENST00000479554 PTPRKQ15262 1439 aa22.55■■□□□ 1.2
ATG4B-218ENST00000479554 KIF3BO15066 747 aa22.54■■□□□ 1.2
ATG4B-218ENST00000479554 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.54■■□□□ 1.2
ATG4B-218ENST00000479554 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.53■■□□□ 1.2
ATG4B-218ENST00000479554 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
ATG4B-218ENST00000479554 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.52■■□□□ 1.2
ATG4B-218ENST00000479554 NCOA1Q15788 1441 aa22.52■■□□□ 1.2
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