RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479350.1

HIVEP3-204, Transcript of human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 3, humanhuman

TSL 5

Gene HIVEP3, Length 940 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3-204ENST00000479350 ADGRL1O94910 1474 aa21.03■□□□□ 0.96
HIVEP3-204ENST00000479350 NCOA2Q15596 1464 aa21.03■□□□□ 0.96
HIVEP3-204ENST00000479350 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.03■□□□□ 0.96
HIVEP3-204ENST00000479350 RAPGEF3O95398 923 aa21.03■□□□□ 0.96
HIVEP3-204ENST00000479350 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
HIVEP3-204ENST00000479350 MAP3K1Q13233 1512 aa21.03■□□□□ 0.96
HIVEP3-204ENST00000479350 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
HIVEP3-204ENST00000479350 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21■□□□□ 0.95
HIVEP3-204ENST00000479350 APLP2Q06481 763 aa21■□□□□ 0.95
HIVEP3-204ENST00000479350 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21■□□□□ 0.95
HIVEP3-204ENST00000479350 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
HIVEP3-204ENST00000479350 SCAPERQ9BY12 1400 aa20.99■□□□□ 0.95
HIVEP3-204ENST00000479350 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
HIVEP3-204ENST00000479350 RICTORQ6R327 1708 aa20.98■□□□□ 0.95
HIVEP3-204ENST00000479350 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa20.97■□□□□ 0.95
HIVEP3-204ENST00000479350 ABCC1P33527 1531 aa20.97■□□□□ 0.95
HIVEP3-204ENST00000479350 POGZQ7Z3K3 1410 aa20.96■□□□□ 0.95
HIVEP3-204ENST00000479350 ITSN2Q9NZM3 1697 aa20.96■□□□□ 0.95
HIVEP3-204ENST00000479350 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa20.94■□□□□ 0.94
HIVEP3-204ENST00000479350 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
HIVEP3-204ENST00000479350 SYCP2Q9BX26 1530 aa20.94■□□□□ 0.94
HIVEP3-204ENST00000479350 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
HIVEP3-204ENST00000479350 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa20.9■□□□□ 0.94
HIVEP3-204ENST00000479350 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa20.88■□□□□ 0.93
HIVEP3-204ENST00000479350 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa20.88■□□□□ 0.93
HIVEP3-204ENST00000479350 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
HIVEP3-204ENST00000479350 YEATS2Q9ULM3 1422 aa20.87■□□□□ 0.93
HIVEP3-204ENST00000479350 AFAP1Q8N556 730 aa20.87■□□□□ 0.93
HIVEP3-204ENST00000479350 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa20.87■□□□□ 0.93
HIVEP3-204ENST00000479350 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP20.86■□□□□ 0.93
HIVEP3-204ENST00000479350 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa20.86■□□□□ 0.93
HIVEP3-204ENST00000479350 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa20.86■□□□□ 0.93
HIVEP3-204ENST00000479350 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.85■□□□□ 0.93
HIVEP3-204ENST00000479350 KDM5CP41229 1560 aa20.85■□□□□ 0.93
HIVEP3-204ENST00000479350 HECW2Q9P2P5 1572 aa20.82■□□□□ 0.92
HIVEP3-204ENST00000479350 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa20.81■□□□□ 0.92
HIVEP3-204ENST00000479350 MYT1LQ9UL68 1186 aa20.81■□□□□ 0.92
HIVEP3-204ENST00000479350 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa20.79■□□□□ 0.92
HIVEP3-204ENST00000479350 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa20.78■□□□□ 0.92
HIVEP3-204ENST00000479350 ABCA6Q8N139 1617 aa20.78■□□□□ 0.92
HIVEP3-204ENST00000479350 MBD5Q9P267 1494 aa20.77■□□□□ 0.92
HIVEP3-204ENST00000479350 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa20.76■□□□□ 0.91
HIVEP3-204ENST00000479350 MAGI2Q86UL8 1455 aa20.76■□□□□ 0.91
HIVEP3-204ENST00000479350 FGD6Q6ZV73 1430 aa20.75■□□□□ 0.91
HIVEP3-204ENST00000479350 PTPN23Q9H3S7 1636 aa20.75■□□□□ 0.91
HIVEP3-204ENST00000479350 MIA2Q96PC5 1412 aa20.74■□□□□ 0.91
HIVEP3-204ENST00000479350 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa20.74■□□□□ 0.91
HIVEP3-204ENST00000479350 MLH3Q9UHC1 1453 aa20.74■□□□□ 0.91
HIVEP3-204ENST00000479350 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
HIVEP3-204ENST00000479350 CCDC141Q6ZP82 1450 aa20.73■□□□□ 0.91
HIVEP3-204ENST00000479350 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
HIVEP3-204ENST00000479350 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
HIVEP3-204ENST00000479350 ATP7AQ04656 1500 aa20.73■□□□□ 0.91
HIVEP3-204ENST00000479350 C9orf84Q5VXU9 1444 aa20.71■□□□□ 0.91
HIVEP3-204ENST00000479350 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa20.71■□□□□ 0.91
HIVEP3-204ENST00000479350 ATP10AO60312 1499 aa20.7■□□□□ 0.9
HIVEP3-204ENST00000479350 ARHGEF5Q12774 1597 aa20.7■□□□□ 0.9
HIVEP3-204ENST00000479350 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
HIVEP3-204ENST00000479350 BCORL1Q5H9F3 1711 aa20.65■□□□□ 0.9
HIVEP3-204ENST00000479350 MLECQ14165 292 aa20.65■□□□□ 0.9
HIVEP3-204ENST00000479350 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
HIVEP3-204ENST00000479350 CROCC2H7BZ55 1655 aa20.62■□□□□ 0.89
HIVEP3-204ENST00000479350 ABCC5O15440 1437 aa20.61■□□□□ 0.89
HIVEP3-204ENST00000479350 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
HIVEP3-204ENST00000479350 MADDQ8WXG6 1647 aa20.61■□□□□ 0.89
HIVEP3-204ENST00000479350 REREQ9P2R6 1566 aa20.61■□□□□ 0.89
HIVEP3-204ENST00000479350 DAPK1P53355 1430 aa20.61■□□□□ 0.89
HIVEP3-204ENST00000479350 ADGBQ8N7X0 1667 aa20.61■□□□□ 0.89
HIVEP3-204ENST00000479350 ADAMTSL3P82987 1691 aa20.6■□□□□ 0.89
HIVEP3-204ENST00000479350 A2MP01023 1474 aa20.59■□□□□ 0.89
HIVEP3-204ENST00000479350 MAST1Q9Y2H9 1570 aa20.59■□□□□ 0.89
HIVEP3-204ENST00000479350 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
HIVEP3-204ENST00000479350 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa20.58■□□□□ 0.88
HIVEP3-204ENST00000479350 PLXNC1O60486 1568 aa20.58■□□□□ 0.88
HIVEP3-204ENST00000479350 TSPY4P0CV99 314 aa20.57■□□□□ 0.88
HIVEP3-204ENST00000479350 TSPY10P0CW01 314 aa20.57■□□□□ 0.88
HIVEP3-204ENST00000479350 RSPH4AQ5TD94 716 aa20.56■□□□□ 0.88
HIVEP3-204ENST00000479350 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
HIVEP3-204ENST00000479350 AGLP35573 1532 aa20.55■□□□□ 0.88
HIVEP3-204ENST00000479350 SHANK2Q9UPX8 1470 aa20.55■□□□□ 0.88
HIVEP3-204ENST00000479350 CHIC2Q9UKJ5 165 aa20.54■□□□□ 0.88
HIVEP3-204ENST00000479350 PLPPR3Q6T4P5 718 aa20.53■□□□□ 0.88
HIVEP3-204ENST00000479350 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa20.53■□□□□ 0.88
HIVEP3-204ENST00000479350 ITGAEP38570 1179 aa20.51■□□□□ 0.87
HIVEP3-204ENST00000479350 PTPRKQ15262 1439 aa20.49■□□□□ 0.87
HIVEP3-204ENST00000479350 PTPRMP28827 1452 aa20.49■□□□□ 0.87
HIVEP3-204ENST00000479350 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
HIVEP3-204ENST00000479350 KIF15Q9NS87 1388 aa20.48■□□□□ 0.87
HIVEP3-204ENST00000479350 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa20.48■□□□□ 0.87
HIVEP3-204ENST00000479350 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
HIVEP3-204ENST00000479350 GGT6Q6P531 493 aa20.45■□□□□ 0.86
HIVEP3-204ENST00000479350 KIF3BO15066 747 aa20.44■□□□□ 0.86
HIVEP3-204ENST00000479350 DUOX2Q9NRD8 1548 aa20.43■□□□□ 0.86
HIVEP3-204ENST00000479350 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa20.43■□□□□ 0.86
HIVEP3-204ENST00000479350 ADGRL2O95490 1459 aa20.43■□□□□ 0.86
HIVEP3-204ENST00000479350 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
HIVEP3-204ENST00000479350 NCOA1Q15788 1441 aa20.4■□□□□ 0.86
HIVEP3-204ENST00000479350 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.86
HIVEP3-204ENST00000479350 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP20.39■□□□□ 0.85
HIVEP3-204ENST00000479350 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms