RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478603.5

C9orf3-216, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf3, Length 802 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-216ENST00000478603 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa37.13■■■■□ 3.53
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C9orf3-216ENST00000478603 YEATS2Q9ULM3 1422 aa37.11■■■■□ 3.53
C9orf3-216ENST00000478603 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa37.11■■■■□ 3.53
C9orf3-216ENST00000478603 PTPRMP28827 1452 aa37.09■■■■□ 3.53
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C9orf3-216ENST00000478603 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa36.83■■■■□ 3.49
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C9orf3-216ENST00000478603 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa36.81■■■■□ 3.48
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C9orf3-216ENST00000478603 MYT1LQ9UL68 1186 aa36.81■■■■□ 3.48
C9orf3-216ENST00000478603 CEP162Q5TB80 1403 aa36.79■■■■□ 3.48
C9orf3-216ENST00000478603 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa36.79■■■■□ 3.48
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C9orf3-216ENST00000478603 CCNB3Q8WWL7 1395 aa36.64■■■■□ 3.46
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C9orf3-216ENST00000478603 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.6■■■■□ 3.45
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C9orf3-216ENST00000478603 NCOA1Q15788 1441 aa35.92■■■■□ 3.34
C9orf3-216ENST00000478603 MIA2Q96PC5 1412 aa35.92■■■■□ 3.34
C9orf3-216ENST00000478603 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa35.92■■■■□ 3.34
C9orf3-216ENST00000478603 MAST1Q9Y2H9 1570 aa35.9■■■■□ 3.34
C9orf3-216ENST00000478603 APLP2Q06481 763 aa35.9■■■■□ 3.34
C9orf3-216ENST00000478603 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP35.9■■■■□ 3.34
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