RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478087.5

HPS1-211, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 971 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-211ENST00000478087 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
HPS1-211ENST00000478087 YEATS2Q9ULM3 1422 aa21.04■□□□□ 0.96
HPS1-211ENST00000478087 ADAMTSL3P82987 1691 aa21.04■□□□□ 0.96
HPS1-211ENST00000478087 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.03■□□□□ 0.96
HPS1-211ENST00000478087 BCORL1Q5H9F3 1711 aa21.02■□□□□ 0.96
HPS1-211ENST00000478087 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa21.02■□□□□ 0.96
HPS1-211ENST00000478087 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa21.01■□□□□ 0.95
HPS1-211ENST00000478087 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa21.01■□□□□ 0.95
HPS1-211ENST00000478087 POGZQ7Z3K3 1410 aa21■□□□□ 0.95
HPS1-211ENST00000478087 CEP162Q5TB80 1403 aa20.99■□□□□ 0.95
HPS1-211ENST00000478087 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa20.99■□□□□ 0.95
HPS1-211ENST00000478087 AFAP1Q8N556 730 aa20.98■□□□□ 0.95
HPS1-211ENST00000478087 PREX2Q70Z35 1606 aa20.97■□□□□ 0.95
HPS1-211ENST00000478087 MADDQ8WXG6 1647 aa20.96■□□□□ 0.95
HPS1-211ENST00000478087 HECW2Q9P2P5 1572 aa20.95■□□□□ 0.94
HPS1-211ENST00000478087 PTPRMP28827 1452 aa20.94■□□□□ 0.94
HPS1-211ENST00000478087 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa20.94■□□□□ 0.94
HPS1-211ENST00000478087 MAGI2Q86UL8 1455 aa20.93■□□□□ 0.94
HPS1-211ENST00000478087 MLECQ14165 292 aa20.92■□□□□ 0.94
HPS1-211ENST00000478087 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
HPS1-211ENST00000478087 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
HPS1-211ENST00000478087 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa20.9■□□□□ 0.94
HPS1-211ENST00000478087 ITSN2Q9NZM3 1697 aa20.89■□□□□ 0.94
HPS1-211ENST00000478087 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
HPS1-211ENST00000478087 ATP10AO60312 1499 aa20.88■□□□□ 0.93
HPS1-211ENST00000478087 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa20.88■□□□□ 0.93
HPS1-211ENST00000478087 PLPPR3Q6T4P5 718 aa20.88■□□□□ 0.93
HPS1-211ENST00000478087 MYT1LQ9UL68 1186 aa20.88■□□□□ 0.93
HPS1-211ENST00000478087 KDM5CP41229 1560 aa20.88■□□□□ 0.93
HPS1-211ENST00000478087 ABCC1P33527 1531 aa20.88■□□□□ 0.93
HPS1-211ENST00000478087 MTUS2Q5JR59 1369 aa20.85■□□□□ 0.93
HPS1-211ENST00000478087 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa20.85■□□□□ 0.93
HPS1-211ENST00000478087 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP20.84■□□□□ 0.93
HPS1-211ENST00000478087 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa20.83■□□□□ 0.93
HPS1-211ENST00000478087 ABCA6Q8N139 1617 aa20.82■□□□□ 0.92
HPS1-211ENST00000478087 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa20.82■□□□□ 0.92
HPS1-211ENST00000478087 C9orf84Q5VXU9 1444 aa20.82■□□□□ 0.92
HPS1-211ENST00000478087 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa20.82■□□□□ 0.92
HPS1-211ENST00000478087 CCNB3Q8WWL7 1395 aa20.81■□□□□ 0.92
HPS1-211ENST00000478087 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
HPS1-211ENST00000478087 MLH3Q9UHC1 1453 aa20.8■□□□□ 0.92
HPS1-211ENST00000478087 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
HPS1-211ENST00000478087 SYCP2Q9BX26 1530 aa20.79■□□□□ 0.92
HPS1-211ENST00000478087 TIAM1Q13009 1591 aa20.77■□□□□ 0.92
HPS1-211ENST00000478087 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20.77■□□□□ 0.92
HPS1-211ENST00000478087 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
HPS1-211ENST00000478087 VPS8Q8N3P4 1428 aa20.73■□□□□ 0.91
HPS1-211ENST00000478087 LMTK3Q96Q04 1460 aa20.71■□□□□ 0.91
HPS1-211ENST00000478087 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
HPS1-211ENST00000478087 REREQ9P2R6 1566 aa20.71■□□□□ 0.91
HPS1-211ENST00000478087 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
HPS1-211ENST00000478087 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa20.7■□□□□ 0.9
HPS1-211ENST00000478087 NCOA2Q15596 1464 aa20.69■□□□□ 0.9
HPS1-211ENST00000478087 HSPA2P54652 639 aa20.69■□□□□ 0.9
HPS1-211ENST00000478087 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
HPS1-211ENST00000478087 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa20.67■□□□□ 0.9
HPS1-211ENST00000478087 AGLP35573 1532 aa20.66■□□□□ 0.9
HPS1-211ENST00000478087 ATP7AQ04656 1500 aa20.66■□□□□ 0.9
HPS1-211ENST00000478087 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
HPS1-211ENST00000478087 MBD5Q9P267 1494 aa20.65■□□□□ 0.9
HPS1-211ENST00000478087 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.64■□□□□ 0.89
HPS1-211ENST00000478087 C3P01024 1663 aa20.63■□□□□ 0.89
HPS1-211ENST00000478087 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
HPS1-211ENST00000478087 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa20.6■□□□□ 0.89
HPS1-211ENST00000478087 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
HPS1-211ENST00000478087 A2MP01023 1474 aa20.58■□□□□ 0.89
HPS1-211ENST00000478087 PREX1Q8TCU6 1659 aa20.58■□□□□ 0.88
HPS1-211ENST00000478087 PLXNC1O60486 1568 aa20.57■□□□□ 0.88
HPS1-211ENST00000478087 ADGBQ8N7X0 1667 aa20.57■□□□□ 0.88
HPS1-211ENST00000478087 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
HPS1-211ENST00000478087 MAP3K1Q13233 1512 aa20.55■□□□□ 0.88
HPS1-211ENST00000478087 GGT6Q6P531 493 aa20.54■□□□□ 0.88
HPS1-211ENST00000478087 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
HPS1-211ENST00000478087 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa20.52■□□□□ 0.87
HPS1-211ENST00000478087 CCDC141Q6ZP82 1450 aa20.51■□□□□ 0.87
HPS1-211ENST00000478087 ZMYM3Q14202 1370 aa20.49■□□□□ 0.87
HPS1-211ENST00000478087 MROH2AA6NES4 1674 aa20.49■□□□□ 0.87
HPS1-211ENST00000478087 STRCQ7RTU9 1775 aa20.49■□□□□ 0.87
HPS1-211ENST00000478087 ARHGEF5Q12774 1597 aa20.48■□□□□ 0.87
HPS1-211ENST00000478087 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
HPS1-211ENST00000478087 CNTLNQ9NXG0 1405 aa20.47■□□□□ 0.87
HPS1-211ENST00000478087 RSPH4AQ5TD94 716 aa20.47■□□□□ 0.87
HPS1-211ENST00000478087 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.46■□□□□ 0.87
HPS1-211ENST00000478087 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa20.46■□□□□ 0.87
HPS1-211ENST00000478087 APLP2Q06481 763 aa20.46■□□□□ 0.87
HPS1-211ENST00000478087 KIF3BO15066 747 aa20.45■□□□□ 0.86
HPS1-211ENST00000478087 TSPY4P0CV99 314 aa20.44■□□□□ 0.86
HPS1-211ENST00000478087 TSPY10P0CW01 314 aa20.44■□□□□ 0.86
HPS1-211ENST00000478087 MIA2Q96PC5 1412 aa20.41■□□□□ 0.86
HPS1-211ENST00000478087 PTPRKQ15262 1439 aa20.38■□□□□ 0.85
HPS1-211ENST00000478087 PTPN23Q9H3S7 1636 aa20.38■□□□□ 0.85
HPS1-211ENST00000478087 MAST1Q9Y2H9 1570 aa20.38■□□□□ 0.85
HPS1-211ENST00000478087 NPATQ14207 1427 aa20.37■□□□□ 0.85
HPS1-211ENST00000478087 PPP6R1Q9UPN7 881 aa20.37■□□□□ 0.85
HPS1-211ENST00000478087 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
HPS1-211ENST00000478087 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
HPS1-211ENST00000478087 ABCC5O15440 1437 aa20.34■□□□□ 0.85
HPS1-211ENST00000478087 MYO3AQ8NEV4 1616 aa20.33■□□□□ 0.84
HPS1-211ENST00000478087 CROCC2H7BZ55 1655 aa20.32■□□□□ 0.84
HPS1-211ENST00000478087 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms