RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477440.6

ARHGEF3-208, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 3

Gene ARHGEF3, Length 587 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-208ENST00000477440 TIAM1Q13009 1591 aa40.34■■■■■ 4.05
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ARHGEF3-208ENST00000477440 ADGRL1O94910 1474 aa40.31■■■■■ 4.04
ARHGEF3-208ENST00000477440 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa40.28■■■■■ 4.04
ARHGEF3-208ENST00000477440 SCAPERQ9BY12 1400 aa40.23■■■■■ 4.03
ARHGEF3-208ENST00000477440 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP40.2■■■■■ 4.03
ARHGEF3-208ENST00000477440 POGZQ7Z3K3 1410 aa40.17■■■■■ 4.02
ARHGEF3-208ENST00000477440 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa40.16■■■■■ 4.02
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ARHGEF3-208ENST00000477440 MAP3K1Q13233 1512 aa40.16■■■■■ 4.02
ARHGEF3-208ENST00000477440 ABCC1P33527 1531 aa40.13■■■■■ 4.01
ARHGEF3-208ENST00000477440 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa40.13■■■■■ 4.01
ARHGEF3-208ENST00000477440 CCNB3Q8WWL7 1395 aa40.12■■■■■ 4.01
ARHGEF3-208ENST00000477440 ITSN2Q9NZM3 1697 aa40.11■■■■■ 4.01
ARHGEF3-208ENST00000477440 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa40.11■■■■■ 4.01
ARHGEF3-208ENST00000477440 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa40.1■■■■■ 4.01
ARHGEF3-208ENST00000477440 NCOA2Q15596 1464 aa40.07■■■■■ 4.01
ARHGEF3-208ENST00000477440 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa40.06■■■■■ 4
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ARHGEF3-208ENST00000477440 MAGI2Q86UL8 1455 aa40■■■■□ 3.99
ARHGEF3-208ENST00000477440 SYCP2Q9BX26 1530 aa39.98■■■■□ 3.99
ARHGEF3-208ENST00000477440 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa39.97■■■■□ 3.99
ARHGEF3-208ENST00000477440 AFAP1Q8N556 730 aa39.95■■■■□ 3.99
ARHGEF3-208ENST00000477440 HECW2Q9P2P5 1572 aa39.93■■■■□ 3.98
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ARHGEF3-208ENST00000477440 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa39.89■■■■□ 3.98
ARHGEF3-208ENST00000477440 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa39.89■■■■□ 3.98
ARHGEF3-208ENST00000477440 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa39.86■■■■□ 3.97
ARHGEF3-208ENST00000477440 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP39.84■■■■□ 3.97
ARHGEF3-208ENST00000477440 MLH3Q9UHC1 1453 aa39.83■■■■□ 3.97
ARHGEF3-208ENST00000477440 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP39.83■■■■□ 3.97
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ARHGEF3-208ENST00000477440 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa39.82■■■■□ 3.96
ARHGEF3-208ENST00000477440 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa39.81■■■■□ 3.96
ARHGEF3-208ENST00000477440 BCORL1Q5H9F3 1711 aa39.8■■■■□ 3.96
ARHGEF3-208ENST00000477440 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa39.79■■■■□ 3.96
ARHGEF3-208ENST00000477440 ATP10AO60312 1499 aa39.78■■■■□ 3.96
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ARHGEF3-208ENST00000477440 ADAMTSL3P82987 1691 aa39.76■■■■□ 3.96
ARHGEF3-208ENST00000477440 C9orf84Q5VXU9 1444 aa39.75■■■■□ 3.95
ARHGEF3-208ENST00000477440 MBD5Q9P267 1494 aa39.75■■■■□ 3.95
ARHGEF3-208ENST00000477440 MYOM3Q5VTT5 1437 aa39.73■■■■□ 3.95
ARHGEF3-208ENST00000477440 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP39.72■■■■□ 3.95
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ARHGEF3-208ENST00000477440 REREQ9P2R6 1566 aa39.67■■■■□ 3.94
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ARHGEF3-208ENST00000477440 MIA2Q96PC5 1412 aa39.64■■■■□ 3.94
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ARHGEF3-208ENST00000477440 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa39.53■■■■□ 3.92
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ARHGEF3-208ENST00000477440 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa39.49■■■■□ 3.91
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ARHGEF3-208ENST00000477440 PLXNC1O60486 1568 aa39.47■■■■□ 3.91
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ARHGEF3-208ENST00000477440 DAPK1P53355 1430 aa39.27■■■■□ 3.88
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ARHGEF3-208ENST00000477440 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP39.05■■■■□ 3.84
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ARHGEF3-208ENST00000477440 LMTK3Q96Q04 1460 aa39■■■■□ 3.83
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