RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476336.5

PRAME-211, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 2

Gene PRAME, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-211ENST00000476336 RICTORQ6R327 1708 aa21.15■□□□□ 0.98
PRAME-211ENST00000476336 PREX2Q70Z35 1606 aa21.15■□□□□ 0.98
PRAME-211ENST00000476336 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.14■□□□□ 0.97
PRAME-211ENST00000476336 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa21.13■□□□□ 0.97
PRAME-211ENST00000476336 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa21.12■□□□□ 0.97
PRAME-211ENST00000476336 SCAPERQ9BY12 1400 aa21.12■□□□□ 0.97
PRAME-211ENST00000476336 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa21.11■□□□□ 0.97
PRAME-211ENST00000476336 MAGI2Q86UL8 1455 aa21.11■□□□□ 0.97
PRAME-211ENST00000476336 MAP3K1Q13233 1512 aa21.1■□□□□ 0.97
PRAME-211ENST00000476336 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa21.1■□□□□ 0.97
PRAME-211ENST00000476336 ADAMTSL3P82987 1691 aa21.1■□□□□ 0.97
PRAME-211ENST00000476336 TIAM1Q13009 1591 aa21.08■□□□□ 0.97
PRAME-211ENST00000476336 POGZQ7Z3K3 1410 aa21.08■□□□□ 0.97
PRAME-211ENST00000476336 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.07■□□□□ 0.96
PRAME-211ENST00000476336 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa21.07■□□□□ 0.96
PRAME-211ENST00000476336 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
PRAME-211ENST00000476336 BCORL1Q5H9F3 1711 aa21.05■□□□□ 0.96
PRAME-211ENST00000476336 ITSN2Q9NZM3 1697 aa21.05■□□□□ 0.96
PRAME-211ENST00000476336 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
PRAME-211ENST00000476336 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
PRAME-211ENST00000476336 PTPRMP28827 1452 aa21.04■□□□□ 0.96
PRAME-211ENST00000476336 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa21.04■□□□□ 0.96
PRAME-211ENST00000476336 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa21.03■□□□□ 0.96
PRAME-211ENST00000476336 APLP2Q06481 763 aa21.03■□□□□ 0.96
PRAME-211ENST00000476336 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
PRAME-211ENST00000476336 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
PRAME-211ENST00000476336 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa21.02■□□□□ 0.96
PRAME-211ENST00000476336 ABCC1P33527 1531 aa21.01■□□□□ 0.95
PRAME-211ENST00000476336 KDM5CP41229 1560 aa21■□□□□ 0.95
PRAME-211ENST00000476336 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21■□□□□ 0.95
PRAME-211ENST00000476336 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa20.98■□□□□ 0.95
PRAME-211ENST00000476336 MADDQ8WXG6 1647 aa20.97■□□□□ 0.95
PRAME-211ENST00000476336 NCOA2Q15596 1464 aa20.96■□□□□ 0.95
PRAME-211ENST00000476336 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa20.96■□□□□ 0.95
PRAME-211ENST00000476336 MLH3Q9UHC1 1453 aa20.95■□□□□ 0.94
PRAME-211ENST00000476336 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
PRAME-211ENST00000476336 AFAP1Q8N556 730 aa20.94■□□□□ 0.94
PRAME-211ENST00000476336 ATP10AO60312 1499 aa20.94■□□□□ 0.94
PRAME-211ENST00000476336 YEATS2Q9ULM3 1422 aa20.92■□□□□ 0.94
PRAME-211ENST00000476336 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa20.91■□□□□ 0.94
PRAME-211ENST00000476336 MYT1LQ9UL68 1186 aa20.91■□□□□ 0.94
PRAME-211ENST00000476336 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
PRAME-211ENST00000476336 SYCP2Q9BX26 1530 aa20.9■□□□□ 0.94
PRAME-211ENST00000476336 C9orf84Q5VXU9 1444 aa20.9■□□□□ 0.94
PRAME-211ENST00000476336 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa20.9■□□□□ 0.94
PRAME-211ENST00000476336 RSPH4AQ5TD94 716 aa20.9■□□□□ 0.94
PRAME-211ENST00000476336 REREQ9P2R6 1566 aa20.88■□□□□ 0.93
PRAME-211ENST00000476336 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa20.87■□□□□ 0.93
PRAME-211ENST00000476336 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP20.86■□□□□ 0.933e-11■□□□□ 9.5
PRAME-211ENST00000476336 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
PRAME-211ENST00000476336 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
PRAME-211ENST00000476336 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa20.85■□□□□ 0.93
PRAME-211ENST00000476336 MIA2Q96PC5 1412 aa20.84■□□□□ 0.93
PRAME-211ENST00000476336 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa20.84■□□□□ 0.93
PRAME-211ENST00000476336 LMTK3Q96Q04 1460 aa20.83■□□□□ 0.93
PRAME-211ENST00000476336 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa20.81■□□□□ 0.92
PRAME-211ENST00000476336 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.81■□□□□ 0.92
PRAME-211ENST00000476336 MLECQ14165 292 aa20.81■□□□□ 0.92
PRAME-211ENST00000476336 ABCA6Q8N139 1617 aa20.81■□□□□ 0.92
PRAME-211ENST00000476336 MBD5Q9P267 1494 aa20.81■□□□□ 0.92
PRAME-211ENST00000476336 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa20.8■□□□□ 0.92
PRAME-211ENST00000476336 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa20.8■□□□□ 0.92
PRAME-211ENST00000476336 ATP7AQ04656 1500 aa20.8■□□□□ 0.92
PRAME-211ENST00000476336 AGLP35573 1532 aa20.79■□□□□ 0.92
PRAME-211ENST00000476336 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
PRAME-211ENST00000476336 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
PRAME-211ENST00000476336 ARHGEF5Q12774 1597 aa20.78■□□□□ 0.92
PRAME-211ENST00000476336 CCDC141Q6ZP82 1450 aa20.77■□□□□ 0.92
PRAME-211ENST00000476336 PLPPR3Q6T4P5 718 aa20.76■□□□□ 0.91
PRAME-211ENST00000476336 ADGBQ8N7X0 1667 aa20.76■□□□□ 0.91
PRAME-211ENST00000476336 TSPY4P0CV99 314 aa20.74■□□□□ 0.91
PRAME-211ENST00000476336 TSPY10P0CW01 314 aa20.74■□□□□ 0.91
PRAME-211ENST00000476336 FBXO41Q8TF61 875 aa20.73■□□□□ 0.91
PRAME-211ENST00000476336 HSPA2P54652 639 aa20.71■□□□□ 0.91
PRAME-211ENST00000476336 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
PRAME-211ENST00000476336 A2MP01023 1474 aa20.7■□□□□ 0.9
PRAME-211ENST00000476336 PLXNC1O60486 1568 aa20.68■□□□□ 0.9
PRAME-211ENST00000476336 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
PRAME-211ENST00000476336 PTPN23Q9H3S7 1636 aa20.67■□□□□ 0.9
PRAME-211ENST00000476336 FGD6Q6ZV73 1430 aa20.67■□□□□ 0.9
PRAME-211ENST00000476336 MAST1Q9Y2H9 1570 aa20.67■□□□□ 0.9
PRAME-211ENST00000476336 PPP6R1Q9UPN7 881 aa20.66■□□□□ 0.9
PRAME-211ENST00000476336 CNTLNQ9NXG0 1405 aa20.66■□□□□ 0.9
PRAME-211ENST00000476336 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
PRAME-211ENST00000476336 PREX1Q8TCU6 1659 aa20.64■□□□□ 0.9
PRAME-211ENST00000476336 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
PRAME-211ENST00000476336 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
PRAME-211ENST00000476336 SHANK2Q9UPX8 1470 aa20.61■□□□□ 0.89
PRAME-211ENST00000476336 MROH2AA6NES4 1674 aa20.59■□□□□ 0.89
PRAME-211ENST00000476336 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PRAME-211ENST00000476336 CROCC2H7BZ55 1655 aa20.58■□□□□ 0.89
PRAME-211ENST00000476336 FAM135AQ9P2D6 1515 aa20.58■□□□□ 0.88
PRAME-211ENST00000476336 C3P01024 1663 aa20.57■□□□□ 0.88
PRAME-211ENST00000476336 DAPK1P53355 1430 aa20.55■□□□□ 0.88
PRAME-211ENST00000476336 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa20.55■□□□□ 0.88
PRAME-211ENST00000476336 ABCC5O15440 1437 aa20.54■□□□□ 0.88
PRAME-211ENST00000476336 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
PRAME-211ENST00000476336 GGT6Q6P531 493 aa20.54■□□□□ 0.88
PRAME-211ENST00000476336 DMRT2Q9Y5R5 561 aa20.54■□□□□ 0.88
PRAME-211ENST00000476336 KIF3BO15066 747 aa20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms