RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475790.5

MEGF6-204, Transcript of multiple EGF like domains 6, humanhuman

TSL 3

Gene MEGF6, Length 883 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEGF6-204ENST00000475790 POGZQ7Z3K3 1410 aa34.82■■■■□ 3.17
MEGF6-204ENST00000475790 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa34.82■■■■□ 3.16
MEGF6-204ENST00000475790 ADAMTSL3P82987 1691 aa34.81■■■■□ 3.16
MEGF6-204ENST00000475790 BCORL1Q5H9F3 1711 aa34.79■■■■□ 3.16
MEGF6-204ENST00000475790 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa34.79■■■■□ 3.16
MEGF6-204ENST00000475790 PREX2Q70Z35 1606 aa34.77■■■■□ 3.16
MEGF6-204ENST00000475790 YEATS2Q9ULM3 1422 aa34.77■■■■□ 3.16
MEGF6-204ENST00000475790 CEP162Q5TB80 1403 aa34.76■■■■□ 3.16
MEGF6-204ENST00000475790 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP34.75■■■■□ 3.15
MEGF6-204ENST00000475790 MAGI2Q86UL8 1455 aa34.74■■■■□ 3.15
MEGF6-204ENST00000475790 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa34.73■■■■□ 3.15
MEGF6-204ENST00000475790 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa34.72■■■■□ 3.15
MEGF6-204ENST00000475790 MADDQ8WXG6 1647 aa34.69■■■■□ 3.14
MEGF6-204ENST00000475790 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa34.66■■■■□ 3.14
MEGF6-204ENST00000475790 HECW2Q9P2P5 1572 aa34.66■■■■□ 3.14
MEGF6-204ENST00000475790 PTPRMP28827 1452 aa34.65■■■■□ 3.14
MEGF6-204ENST00000475790 KDM5CP41229 1560 aa34.64■■■■□ 3.14
MEGF6-204ENST00000475790 ABCC1P33527 1531 aa34.62■■■■□ 3.13
MEGF6-204ENST00000475790 ITSN2Q9NZM3 1697 aa34.61■■■■□ 3.13
MEGF6-204ENST00000475790 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.59■■■■□ 3.13
MEGF6-204ENST00000475790 AFAP1Q8N556 730 aa34.59■■■■□ 3.13
MEGF6-204ENST00000475790 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP34.59■■■■□ 3.13
MEGF6-204ENST00000475790 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa34.59■■■■□ 3.13
MEGF6-204ENST00000475790 ATP10AO60312 1499 aa34.57■■■■□ 3.12
MEGF6-204ENST00000475790 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP34.55■■■■□ 3.12
MEGF6-204ENST00000475790 MTUS2Q5JR59 1369 aa34.55■■■■□ 3.12
MEGF6-204ENST00000475790 C9orf84Q5VXU9 1444 aa34.55■■■■□ 3.12
MEGF6-204ENST00000475790 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa34.54■■■■□ 3.12
MEGF6-204ENST00000475790 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa34.53■■■■□ 3.12
MEGF6-204ENST00000475790 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa34.5■■■■□ 3.11
MEGF6-204ENST00000475790 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa34.5■■■■□ 3.11
MEGF6-204ENST00000475790 ABCA6Q8N139 1617 aa34.48■■■■□ 3.11
MEGF6-204ENST00000475790 MLH3Q9UHC1 1453 aa34.47■■■■□ 3.11
MEGF6-204ENST00000475790 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa34.47■■■■□ 3.11
MEGF6-204ENST00000475790 MYT1LQ9UL68 1186 aa34.47■■■■□ 3.11
MEGF6-204ENST00000475790 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP34.47■■■■□ 3.11
MEGF6-204ENST00000475790 MLECQ14165 292 aa34.46■■■■□ 3.11
MEGF6-204ENST00000475790 CCNB3Q8WWL7 1395 aa34.46■■■■□ 3.11
MEGF6-204ENST00000475790 SYCP2Q9BX26 1530 aa34.45■■■■□ 3.1
MEGF6-204ENST00000475790 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa34.42■■■■□ 3.1
MEGF6-204ENST00000475790 TIAM1Q13009 1591 aa34.42■■■■□ 3.1
MEGF6-204ENST00000475790 REREQ9P2R6 1566 aa34.4■■■■□ 3.1
MEGF6-204ENST00000475790 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP34.39■■■■□ 3.1
MEGF6-204ENST00000475790 VPS8Q8N3P4 1428 aa34.37■■■■□ 3.09
MEGF6-204ENST00000475790 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP34.34■■■■□ 3.09
MEGF6-204ENST00000475790 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa34.33■■■■□ 3.09
MEGF6-204ENST00000475790 PLPPR3Q6T4P5 718 aa34.33■■■■□ 3.09
MEGF6-204ENST00000475790 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa34.32■■■■□ 3.08
MEGF6-204ENST00000475790 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP34.32■■■■□ 3.08
MEGF6-204ENST00000475790 LMTK3Q96Q04 1460 aa34.27■■■■□ 3.08
MEGF6-204ENST00000475790 AGLP35573 1532 aa34.27■■■■□ 3.08
MEGF6-204ENST00000475790 NCOA2Q15596 1464 aa34.27■■■■□ 3.08
MEGF6-204ENST00000475790 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP34.26■■■■□ 3.07
MEGF6-204ENST00000475790 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP34.26■■■■□ 3.07
MEGF6-204ENST00000475790 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP34.25■■■■□ 3.07
MEGF6-204ENST00000475790 ATP7AQ04656 1500 aa34.25■■■■□ 3.07
MEGF6-204ENST00000475790 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa34.19■■■■□ 3.06
MEGF6-204ENST00000475790 MBD5Q9P267 1494 aa34.18■■■■□ 3.06
MEGF6-204ENST00000475790 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP34.14■■■■□ 3.06
MEGF6-204ENST00000475790 MAP3K1Q13233 1512 aa34.14■■■■□ 3.06
MEGF6-204ENST00000475790 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa34.13■■■■□ 3.05
MEGF6-204ENST00000475790 PLXNC1O60486 1568 aa34.11■■■■□ 3.05
MEGF6-204ENST00000475790 C3P01024 1663 aa34.11■■■■□ 3.05
MEGF6-204ENST00000475790 ADGBQ8N7X0 1667 aa34.09■■■■□ 3.05
MEGF6-204ENST00000475790 PREX1Q8TCU6 1659 aa34.09■■■■□ 3.05
MEGF6-204ENST00000475790 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP34.09■■■■□ 3.05
MEGF6-204ENST00000475790 A2MP01023 1474 aa34.08■■■■□ 3.05
MEGF6-204ENST00000475790 HSPA2P54652 639 aa34.08■■■■□ 3.05
MEGF6-204ENST00000475790 CCDC141Q6ZP82 1450 aa34.04■■■■□ 3.04
MEGF6-204ENST00000475790 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP34.04■■■■□ 3.04
MEGF6-204ENST00000475790 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa34.02■■■■□ 3.04
MEGF6-204ENST00000475790 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP34.01■■■■□ 3.03
MEGF6-204ENST00000475790 CNTLNQ9NXG0 1405 aa34■■■■□ 3.03
MEGF6-204ENST00000475790 MROH2AA6NES4 1674 aa33.99■■■■□ 3.03
MEGF6-204ENST00000475790 ARHGEF5Q12774 1597 aa33.98■■■■□ 3.03
MEGF6-204ENST00000475790 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP33.96■■■■□ 3.03
MEGF6-204ENST00000475790 RSPH4AQ5TD94 716 aa33.92■■■■□ 3.02
MEGF6-204ENST00000475790 MYOM3Q5VTT5 1437 aa33.92■■■■□ 3.02
MEGF6-204ENST00000475790 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa33.92■■■■□ 3.02
MEGF6-204ENST00000475790 GGT6Q6P531 493 aa33.89■■■■□ 3.02
MEGF6-204ENST00000475790 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP33.89■■■■□ 3.02
MEGF6-204ENST00000475790 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP33.88■■■■□ 3.01
MEGF6-204ENST00000475790 APLP2Q06481 763 aa33.88■■■■□ 3.01
MEGF6-204ENST00000475790 MIA2Q96PC5 1412 aa33.87■■■■□ 3.01
MEGF6-204ENST00000475790 ZMYM3Q14202 1370 aa33.85■■■■□ 3.01
MEGF6-204ENST00000475790 MAST1Q9Y2H9 1570 aa33.81■■■■□ 3
MEGF6-204ENST00000475790 TSPY4P0CV99 314 aa33.81■■■■□ 3
MEGF6-204ENST00000475790 TSPY10P0CW01 314 aa33.81■■■■□ 3
MEGF6-204ENST00000475790 STRCQ7RTU9 1775 aa33.8■■■■□ 3
MEGF6-204ENST00000475790 NPATQ14207 1427 aa33.8■■■■□ 3
MEGF6-204ENST00000475790 PPP6R1Q9UPN7 881 aa33.77■■■■□ 3
MEGF6-204ENST00000475790 KIF3BO15066 747 aa33.76■■■□□ 2.99
MEGF6-204ENST00000475790 PTPN23Q9H3S7 1636 aa33.75■■■□□ 2.99
MEGF6-204ENST00000475790 PTPRKQ15262 1439 aa33.72■■■□□ 2.99
MEGF6-204ENST00000475790 MYO3AQ8NEV4 1616 aa33.71■■■□□ 2.99
MEGF6-204ENST00000475790 CROCC2H7BZ55 1655 aa33.71■■■□□ 2.99
MEGF6-204ENST00000475790 KDM5DQ9BY66 1539 aa33.69■■■□□ 2.98
MEGF6-204ENST00000475790 FGD6Q6ZV73 1430 aa33.67■■■□□ 2.98
MEGF6-204ENST00000475790 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP33.67■■■□□ 2.98
MEGF6-204ENST00000475790 FAM135AQ9P2D6 1515 aa33.66■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.9 ms