RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474370.1

RP9-203, Transcript of RP9, pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 2

Gene RP9, Length 535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP9-203ENST00000474370 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa41.52■■■■■ 4.24
RP9-203ENST00000474370 SCAPERQ9BY12 1400 aa41.52■■■■■ 4.24
RP9-203ENST00000474370 POGZQ7Z3K3 1410 aa41.51■■■■■ 4.24
RP9-203ENST00000474370 MAGI2Q86UL8 1455 aa41.5■■■■■ 4.23
RP9-203ENST00000474370 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP41.45■■■■■ 4.23
RP9-203ENST00000474370 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa41.42■■■■■ 4.22
RP9-203ENST00000474370 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa41.42■■■■■ 4.22
RP9-203ENST00000474370 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP41.42■■■■■ 4.22
RP9-203ENST00000474370 CLIP1P30622 1438 aa41.39■■■■■ 4.22
RP9-203ENST00000474370 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP41.37■■■■■ 4.21
RP9-203ENST00000474370 CCDC18Q5T9S5 1454 aa41.34■■■■■ 4.21
RP9-203ENST00000474370 ARHGAP5Q13017 1502 aa41.34■■■■■ 4.21
RP9-203ENST00000474370 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa41.32■■■■■ 4.21
RP9-203ENST00000474370 ATP10AO60312 1499 aa41.28■■■■■ 4.2
RP9-203ENST00000474370 KDM5CP41229 1560 aa41.27■■■■■ 4.2
RP9-203ENST00000474370 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa41.27■■■■■ 4.2
RP9-203ENST00000474370 LMTK3Q96Q04 1460 aa41.26■■■■■ 4.2
RP9-203ENST00000474370 FYCO1Q9BQS8 1478 aa41.25■■■■■ 4.19
RP9-203ENST00000474370 PREX2Q70Z35 1606 aa41.25■■■■■ 4.19
RP9-203ENST00000474370 C9orf84Q5VXU9 1444 aa41.22■■■■■ 4.19
RP9-203ENST00000474370 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa41.2■■■■■ 4.19
RP9-203ENST00000474370 AFAP1Q8N556 730 aa41.2■■■■■ 4.19
RP9-203ENST00000474370 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa41.18■■■■■ 4.18
RP9-203ENST00000474370 MLECQ14165 292 aa41.17■■■■■ 4.18
RP9-203ENST00000474370 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa41.15■■■■■ 4.18
RP9-203ENST00000474370 ABCC1P33527 1531 aa41.13■■■■■ 4.18
RP9-203ENST00000474370 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa41.12■■■■■ 4.17
RP9-203ENST00000474370 ITSN2Q9NZM3 1697 aa41.1■■■■■ 4.17
RP9-203ENST00000474370 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa41.09■■■■■ 4.17
RP9-203ENST00000474370 MLH3Q9UHC1 1453 aa41.08■■■■■ 4.17
RP9-203ENST00000474370 ABCA6Q8N139 1617 aa41.07■■■■■ 4.16
RP9-203ENST00000474370 REREQ9P2R6 1566 aa41.06■■■■■ 4.16
RP9-203ENST00000474370 PLPPR3Q6T4P5 718 aa41.05■■■■■ 4.16
RP9-203ENST00000474370 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP40.97■■■■■ 4.15
RP9-203ENST00000474370 HSPA2P54652 639 aa40.96■■■■■ 4.15
RP9-203ENST00000474370 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa40.96■■■■■ 4.15
RP9-203ENST00000474370 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa40.95■■■■■ 4.15
RP9-203ENST00000474370 MYT1LQ9UL68 1186 aa40.94■■■■■ 4.14
RP9-203ENST00000474370 AGLP35573 1532 aa40.9■■■■■ 4.14
RP9-203ENST00000474370 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP40.87■■■■■ 4.13
RP9-203ENST00000474370 PREX1Q8TCU6 1659 aa40.86■■■■■ 4.13
RP9-203ENST00000474370 SYCP2Q9BX26 1530 aa40.86■■■■■ 4.13
RP9-203ENST00000474370 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP40.83■■■■■ 4.13
RP9-203ENST00000474370 CEP162Q5TB80 1403 aa40.77■■■■■ 4.12
RP9-203ENST00000474370 MTUS2Q5JR59 1369 aa40.77■■■■■ 4.12
RP9-203ENST00000474370 FBXO41Q8TF61 875 aa40.77■■■■■ 4.12
RP9-203ENST00000474370 C3P01024 1663 aa40.76■■■■■ 4.12
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RP9-203ENST00000474370 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa40.76■■■■■ 4.11
RP9-203ENST00000474370 CCNB3Q8WWL7 1395 aa40.75■■■■■ 4.11
RP9-203ENST00000474370 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP40.73■■■■■ 4.11
RP9-203ENST00000474370 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa40.72■■■■■ 4.11
RP9-203ENST00000474370 TIAM1Q13009 1591 aa40.71■■■■■ 4.11
RP9-203ENST00000474370 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP40.71■■■■■ 4.11
RP9-203ENST00000474370 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa40.71■■■■■ 4.11
RP9-203ENST00000474370 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP40.69■■■■■ 4.11
RP9-203ENST00000474370 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP40.69■■■■■ 4.11
RP9-203ENST00000474370 ATP7AQ04656 1500 aa40.68■■■■■ 4.1
RP9-203ENST00000474370 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa40.63■■■■■ 4.09
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RP9-203ENST00000474370 STRCQ7RTU9 1775 aa40.61■■■■■ 4.09
RP9-203ENST00000474370 CNTLNQ9NXG0 1405 aa40.59■■■■■ 4.09
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RP9-203ENST00000474370 MROH2AA6NES4 1674 aa40.56■■■■■ 4.08
RP9-203ENST00000474370 A2MP01023 1474 aa40.54■■■■■ 4.08
RP9-203ENST00000474370 ADGBQ8N7X0 1667 aa40.48■■■■■ 4.07
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RP9-203ENST00000474370 NPATQ14207 1427 aa40.42■■■■■ 4.06
RP9-203ENST00000474370 CERKQ8TCT0 537 aa40.42■■■■■ 4.06
RP9-203ENST00000474370 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa40.41■■■■■ 4.06
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RP9-203ENST00000474370 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa40.36■■■■■ 4.05
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RP9-203ENST00000474370 PTPRTO14522 1441 aa40.32■■■■■ 4.04
RP9-203ENST00000474370 CCDC141Q6ZP82 1450 aa40.32■■■■■ 4.04
RP9-203ENST00000474370 NCOA1Q15788 1441 aa40.3■■■■■ 4.04
RP9-203ENST00000474370 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa40.28■■■■■ 4.04
RP9-203ENST00000474370 PTPRKQ15262 1439 aa40.28■■■■■ 4.04
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RP9-203ENST00000474370 MYO3AQ8NEV4 1616 aa40.24■■■■■ 4.03
RP9-203ENST00000474370 ARHGEF5Q12774 1597 aa40.23■■■■■ 4.03
RP9-203ENST00000474370 RSPH4AQ5TD94 716 aa40.2■■■■■ 4.03
RP9-203ENST00000474370 MAP3K1Q13233 1512 aa40.18■■■■■ 4.02
RP9-203ENST00000474370 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP40.15■■■■■ 4.02
RP9-203ENST00000474370 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP40.14■■■■■ 4.02
RP9-203ENST00000474370 LTBP4Q8N2S1 1624 aa40.13■■■■■ 4.02
RP9-203ENST00000474370 KIF3BO15066 747 aa40.1■■■■■ 4.01
RP9-203ENST00000474370 PLA2R1Q13018 1463 aa40.07■■■■■ 4.01
RP9-203ENST00000474370 FAM135AQ9P2D6 1515 aa40.07■■■■■ 4.01
RP9-203ENST00000474370 KDM5DQ9BY66 1539 aa40.06■■■■■ 4
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