RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472427.5

RALGPS1-212, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2

Gene RALGPS1, Length 764 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-212ENST00000472427 NCOA2Q15596 1464 aa33.93■■■■□ 3.02
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RALGPS1-212ENST00000472427 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa33.92■■■■□ 3.02
RALGPS1-212ENST00000472427 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP33.9■■■■□ 3.02
RALGPS1-212ENST00000472427 AKNAQ7Z591 1439 aa33.88■■■■□ 3.01
RALGPS1-212ENST00000472427 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa33.88■■■■□ 3.01
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RALGPS1-212ENST00000472427 MYOM3Q5VTT5 1437 aa33.7■■■□□ 2.99
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RALGPS1-212ENST00000472427 POGZQ7Z3K3 1410 aa33.67■■■□□ 2.98
RALGPS1-212ENST00000472427 RICTORQ6R327 1708 aa33.66■■■□□ 2.98
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RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa33.64■■■□□ 2.98
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RALGPS1-212ENST00000472427 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa33.64■■■□□ 2.98
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RALGPS1-212ENST00000472427 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa33.6■■■□□ 2.97
RALGPS1-212ENST00000472427 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa33.58■■■□□ 2.97
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RALGPS1-212ENST00000472427 AFAP1Q8N556 730 aa33.49■■■□□ 2.95
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RALGPS1-212ENST00000472427 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa33.47■■■□□ 2.95
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RALGPS1-212ENST00000472427 YEATS2Q9ULM3 1422 aa33.36■■■□□ 2.93
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RALGPS1-212ENST00000472427 TSPY10P0CW01 314 aa33.35■■■□□ 2.93
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RALGPS1-212ENST00000472427 C9orf84Q5VXU9 1444 aa33.29■■■□□ 2.92
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RALGPS1-212ENST00000472427 MAST1Q9Y2H9 1570 aa33.26■■■□□ 2.92
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RALGPS1-212ENST00000472427 SHANK2Q9UPX8 1470 aa33.25■■■□□ 2.91
RALGPS1-212ENST00000472427 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP33.24■■■□□ 2.91
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RALGPS1-212ENST00000472427 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa32.99■■■□□ 2.87
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RALGPS1-212ENST00000472427 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP32.96■■■□□ 2.87
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RALGPS1-212ENST00000472427 MADDQ8WXG6 1647 aa32.91■■■□□ 2.86
RALGPS1-212ENST00000472427 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa32.91■■■□□ 2.86
RALGPS1-212ENST00000472427 GGT6Q6P531 493 aa32.87■■■□□ 2.85
RALGPS1-212ENST00000472427 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP32.85■■■□□ 2.85
RALGPS1-212ENST00000472427 PPP6R1Q9UPN7 881 aa32.83■■■□□ 2.85
RALGPS1-212ENST00000472427 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP32.83■■■□□ 2.85
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