RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471092.1

MDFI-209, Transcript of MyoD family inhibitor, humanhuman

TSL 3

Gene MDFI, Length 549 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDFI-209ENST00000471092 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
MDFI-209ENST00000471092 SCAPERQ9BY12 1400 aa29.12■■■□□ 2.25
MDFI-209ENST00000471092 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
MDFI-209ENST00000471092 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa29.09■■■□□ 2.25
MDFI-209ENST00000471092 KIF14Q15058 1648 aa29.09■■■□□ 2.25
MDFI-209ENST00000471092 LMTK3Q96Q04 1460 aa29.06■■■□□ 2.24
MDFI-209ENST00000471092 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.06■■■□□ 2.24
MDFI-209ENST00000471092 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
MDFI-209ENST00000471092 CLIP1P30622 1438 aa29.03■■■□□ 2.24
MDFI-209ENST00000471092 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.03■■■□□ 2.24
MDFI-209ENST00000471092 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa29.02■■■□□ 2.24
MDFI-209ENST00000471092 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.99■■■□□ 2.23
MDFI-209ENST00000471092 ATP10AO60312 1499 aa28.98■■■□□ 2.23
MDFI-209ENST00000471092 MLECQ14165 292 aa28.98■■■□□ 2.23
MDFI-209ENST00000471092 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.97■■■□□ 2.23
MDFI-209ENST00000471092 PLPPR3Q6T4P5 718 aa28.97■■■□□ 2.23
MDFI-209ENST00000471092 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28.96■■■□□ 2.23
MDFI-209ENST00000471092 FBXO41Q8TF61 875 aa28.92■■■□□ 2.22
MDFI-209ENST00000471092 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.92■■■□□ 2.22
MDFI-209ENST00000471092 KDM5CP41229 1560 aa28.92■■■□□ 2.22
MDFI-209ENST00000471092 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.91■■■□□ 2.22
MDFI-209ENST00000471092 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.91■■■□□ 2.22
MDFI-209ENST00000471092 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.9■■■□□ 2.22
MDFI-209ENST00000471092 PREX2Q70Z35 1606 aa28.87■■■□□ 2.21
MDFI-209ENST00000471092 HSPA2P54652 639 aa28.87■■■□□ 2.21
MDFI-209ENST00000471092 AFAP1Q8N556 730 aa28.86■■■□□ 2.21
MDFI-209ENST00000471092 MYT1LQ9UL68 1186 aa28.84■■■□□ 2.21
MDFI-209ENST00000471092 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa28.83■■■□□ 2.21
MDFI-209ENST00000471092 ABCC1P33527 1531 aa28.8■■■□□ 2.2
MDFI-209ENST00000471092 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28.8■■■□□ 2.2
MDFI-209ENST00000471092 PREX1Q8TCU6 1659 aa28.8■■■□□ 2.2
MDFI-209ENST00000471092 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28.8■■■□□ 2.2
MDFI-209ENST00000471092 REREQ9P2R6 1566 aa28.79■■■□□ 2.2
MDFI-209ENST00000471092 MLH3Q9UHC1 1453 aa28.78■■■□□ 2.2
MDFI-209ENST00000471092 ABCA6Q8N139 1617 aa28.78■■■□□ 2.2
MDFI-209ENST00000471092 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.77■■■□□ 2.2
MDFI-209ENST00000471092 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa28.75■■■□□ 2.19
MDFI-209ENST00000471092 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
MDFI-209ENST00000471092 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
MDFI-209ENST00000471092 AGLP35573 1532 aa28.69■■■□□ 2.18
MDFI-209ENST00000471092 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa28.69■■■□□ 2.18
MDFI-209ENST00000471092 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa28.65■■■□□ 2.18
MDFI-209ENST00000471092 C3P01024 1663 aa28.64■■■□□ 2.17
MDFI-209ENST00000471092 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa28.63■■■□□ 2.17
MDFI-209ENST00000471092 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
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MDFI-209ENST00000471092 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
MDFI-209ENST00000471092 SYCP2Q9BX26 1530 aa28.6■■■□□ 2.17
MDFI-209ENST00000471092 CERKQ8TCT0 537 aa28.58■■■□□ 2.17
MDFI-209ENST00000471092 STRCQ7RTU9 1775 aa28.57■■■□□ 2.16
MDFI-209ENST00000471092 CNTLNQ9NXG0 1405 aa28.56■■■□□ 2.16
MDFI-209ENST00000471092 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa28.54■■■□□ 2.16
MDFI-209ENST00000471092 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
MDFI-209ENST00000471092 DMRT2Q9Y5R5 561 aa28.54■■■□□ 2.16
MDFI-209ENST00000471092 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.53■■■□□ 2.16
MDFI-209ENST00000471092 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.52■■■□□ 2.16
MDFI-209ENST00000471092 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP28.52■■■□□ 2.16
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MDFI-209ENST00000471092 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa28.52■■■□□ 2.16
MDFI-209ENST00000471092 ATP7AQ04656 1500 aa28.51■■■□□ 2.15
MDFI-209ENST00000471092 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
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MDFI-209ENST00000471092 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
MDFI-209ENST00000471092 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.43■■■□□ 2.14
MDFI-209ENST00000471092 PLXNC1O60486 1568 aa28.43■■■□□ 2.14
MDFI-209ENST00000471092 TIAM1Q13009 1591 aa28.42■■■□□ 2.14
MDFI-209ENST00000471092 A2MP01023 1474 aa28.42■■■□□ 2.14
MDFI-209ENST00000471092 PTPRTO14522 1441 aa28.42■■■□□ 2.14
MDFI-209ENST00000471092 NPATQ14207 1427 aa28.41■■■□□ 2.14
MDFI-209ENST00000471092 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
MDFI-209ENST00000471092 ADGBQ8N7X0 1667 aa28.38■■■□□ 2.13
MDFI-209ENST00000471092 ZMYM3Q14202 1370 aa28.38■■■□□ 2.13
MDFI-209ENST00000471092 NCOA1Q15788 1441 aa28.35■■■□□ 2.13
MDFI-209ENST00000471092 CEP162Q5TB80 1403 aa28.35■■■□□ 2.13
MDFI-209ENST00000471092 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
MDFI-209ENST00000471092 GGT6Q6P531 493 aa28.31■■■□□ 2.12
MDFI-209ENST00000471092 MBD5Q9P267 1494 aa28.31■■■□□ 2.12
MDFI-209ENST00000471092 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa28.31■■■□□ 2.12
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MDFI-209ENST00000471092 MYO3AQ8NEV4 1616 aa28.29■■■□□ 2.12
MDFI-209ENST00000471092 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa28.27■■■□□ 2.12
MDFI-209ENST00000471092 PPP6R1Q9UPN7 881 aa28.26■■■□□ 2.11
MDFI-209ENST00000471092 PTPRKQ15262 1439 aa28.26■■■□□ 2.11
MDFI-209ENST00000471092 LTBP4Q8N2S1 1624 aa28.25■■■□□ 2.11
MDFI-209ENST00000471092 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
MDFI-209ENST00000471092 NCOA2Q15596 1464 aa28.22■■■□□ 2.11
MDFI-209ENST00000471092 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.21■■■□□ 2.11
MDFI-209ENST00000471092 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
MDFI-209ENST00000471092 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa28.21■■■□□ 2.11
MDFI-209ENST00000471092 PLA2R1Q13018 1463 aa28.2■■■□□ 2.1
MDFI-209ENST00000471092 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28.19■■■□□ 2.1
MDFI-209ENST00000471092 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa28.18■■■□□ 2.1
MDFI-209ENST00000471092 PKD2Q13563 968 aa28.15■■■□□ 2.1
MDFI-209ENST00000471092 RSPH4AQ5TD94 716 aa28.15■■■□□ 2.1
MDFI-209ENST00000471092 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
MDFI-209ENST00000471092 FAM135AQ9P2D6 1515 aa28.13■■■□□ 2.09
MDFI-209ENST00000471092 KIF3BO15066 747 aa28.12■■■□□ 2.09
MDFI-209ENST00000471092 A2ML1A8K2U0 1454 aa28.11■■■□□ 2.09
MDFI-209ENST00000471092 ARHGEF5Q12774 1597 aa28.11■■■□□ 2.09
MDFI-209ENST00000471092 KDM5DQ9BY66 1539 aa28.1■■■□□ 2.09
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