RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470944.1

SOD1-203, Transcript of superoxide dismutase 1, humanhuman

TSL 2

Gene SOD1, Length 1,746 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOD1-203ENST00000470944 ARHGAP5Q13017 1502 aa44.38■■■■■ 4.69
SOD1-203ENST00000470944 ARAP3Q8WWN8 1544 aa44.33■■■■■ 4.69
SOD1-203ENST00000470944 MIA2Q96PC5 1412 aa44.33■■■■■ 4.69
SOD1-203ENST00000470944 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP44.32■■■■■ 4.69
SOD1-203ENST00000470944 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP44.32■■■■■ 4.69
SOD1-203ENST00000470944 TSPOAP1O95153 1857 aa44.29■■■■■ 4.68
SOD1-203ENST00000470944 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP44.29■■■■■ 4.68
SOD1-203ENST00000470944 FANCAO15360 1455 aa44.29■■■■■ 4.68
SOD1-203ENST00000470944 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa44.29■■■■■ 4.68
SOD1-203ENST00000470944 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP44.26■■■■■ 4.68
SOD1-203ENST00000470944 PTPN23Q9H3S7 1636 aa44.24■■■■■ 4.67
SOD1-203ENST00000470944 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa44.22■■■■■ 4.67
SOD1-203ENST00000470944 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa44.2■■■■■ 4.67
SOD1-203ENST00000470944 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP44.18■■■■■ 4.66
SOD1-203ENST00000470944 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP44.18■■■■■ 4.66
SOD1-203ENST00000470944 AKNAQ7Z591 1439 aa44.15■■■■■ 4.66
SOD1-203ENST00000470944 TEX14Q8IWB6 1497 aa44.14■■■■■ 4.66
SOD1-203ENST00000470944 NEO1Q92859 1461 aa44.14■■■■■ 4.66
SOD1-203ENST00000470944 CFAP74Q9C0B2 1584 aa44.11■■■■■ 4.65
SOD1-203ENST00000470944 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa44.09■■■■■ 4.65
SOD1-203ENST00000470944 ABCC1P33527 1531 aa44.08■■■■■ 4.65
SOD1-203ENST00000470944 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP44.07■■■■■ 4.65
SOD1-203ENST00000470944 ADGRL1O94910 1474 aa44.07■■■■■ 4.65
SOD1-203ENST00000470944 SYCP2Q9BX26 1530 aa44.06■■■■■ 4.64
SOD1-203ENST00000470944 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa44.04■■■■■ 4.64
SOD1-203ENST00000470944 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP44.04■■■■■ 4.642e-18■■□□□ 12.5
SOD1-203ENST00000470944 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa44.03■■■■■ 4.64
SOD1-203ENST00000470944 SCAPERQ9BY12 1400 aa44.03■■■■■ 4.64
SOD1-203ENST00000470944 MBD5Q9P267 1494 aa44.03■■■■■ 4.64
SOD1-203ENST00000470944 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP43.96■■■■■ 4.63
SOD1-203ENST00000470944 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa43.95■■■■■ 4.63
SOD1-203ENST00000470944 ITGAEP38570 1179 aa43.93■■■■■ 4.62
SOD1-203ENST00000470944 ABCC5O15440 1437 aa43.91■■■■■ 4.62
SOD1-203ENST00000470944 ARHGEF5Q12774 1597 aa43.9■■■■■ 4.62
SOD1-203ENST00000470944 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP43.9■■■■■ 4.62
SOD1-203ENST00000470944 AFAP1Q8N556 730 aa43.9■■■■■ 4.62
SOD1-203ENST00000470944 DAPK1P53355 1430 aa43.89■■■■■ 4.62
SOD1-203ENST00000470944 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP43.89■■■■■ 4.62
SOD1-203ENST00000470944 RAPGEF3O95398 923 aa43.88■■■■■ 4.62
SOD1-203ENST00000470944 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP43.87■■■■■ 4.61
SOD1-203ENST00000470944 CCDC141Q6ZP82 1450 aa43.87■■■■■ 4.61
SOD1-203ENST00000470944 PTPRKQ15262 1439 aa43.87■■■■■ 4.61
SOD1-203ENST00000470944 POGZQ7Z3K3 1410 aa43.86■■■■■ 4.61
SOD1-203ENST00000470944 RSPH4AQ5TD94 716 aa43.82■■■■■ 4.61
SOD1-203ENST00000470944 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa43.8■■■■■ 4.6
SOD1-203ENST00000470944 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa43.78■■■■■ 4.6
SOD1-203ENST00000470944 RICTORQ6R327 1708 aa43.77■■■■■ 4.6
SOD1-203ENST00000470944 CHIC2Q9UKJ5 165 aa43.76■■■■■ 4.6
SOD1-203ENST00000470944 CROCC2H7BZ55 1655 aa43.75■■■■■ 4.59
SOD1-203ENST00000470944 TSPY4P0CV99 314 aa43.73■■■■■ 4.59
SOD1-203ENST00000470944 TSPY10P0CW01 314 aa43.73■■■■■ 4.59
SOD1-203ENST00000470944 KDM5CP41229 1560 aa43.72■■■■■ 4.59
SOD1-203ENST00000470944 C9orf84Q5VXU9 1444 aa43.71■■■■■ 4.59
SOD1-203ENST00000470944 SHANK2Q9UPX8 1470 aa43.7■■■■■ 4.59
SOD1-203ENST00000470944 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP43.69■■■■■ 4.58
SOD1-203ENST00000470944 KDM6BO15054 1643 aa43.69■■■■■ 4.58
SOD1-203ENST00000470944 PCGF6Q9BYE7 350 aa43.65■■■■■ 4.58
SOD1-203ENST00000470944 MAST1Q9Y2H9 1570 aa43.64■■■■■ 4.58
SOD1-203ENST00000470944 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa43.62■■■■■ 4.57
SOD1-203ENST00000470944 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP43.6■■■■■ 4.57
SOD1-203ENST00000470944 MLH3Q9UHC1 1453 aa43.59■■■■■ 4.57
SOD1-203ENST00000470944 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa43.59■■■■■ 4.57
SOD1-203ENST00000470944 ATP7AQ04656 1500 aa43.58■■■■■ 4.57
SOD1-203ENST00000470944 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa43.58■■■■■ 4.57
SOD1-203ENST00000470944 MYT1LQ9UL68 1186 aa43.58■■■■■ 4.57
SOD1-203ENST00000470944 HECW2Q9P2P5 1572 aa43.58■■■■■ 4.57
SOD1-203ENST00000470944 ADGRL2O95490 1459 aa43.57■■■■■ 4.56
SOD1-203ENST00000470944 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa43.56■■■■■ 4.56
SOD1-203ENST00000470944 NCOA1Q15788 1441 aa43.56■■■■■ 4.56
SOD1-203ENST00000470944 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa43.55■■■■■ 4.56
SOD1-203ENST00000470944 ROCK1Q13464 1354 aa43.54■■■■■ 4.56
SOD1-203ENST00000470944 ADGBQ8N7X0 1667 aa43.52■■■■■ 4.56
SOD1-203ENST00000470944 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa43.52■■■■■ 4.56
SOD1-203ENST00000470944 YEATS2Q9ULM3 1422 aa43.52■■■■■ 4.56
SOD1-203ENST00000470944 MAGI2Q86UL8 1455 aa43.47■■■■■ 4.55
SOD1-203ENST00000470944 PLXNC1O60486 1568 aa43.46■■■■■ 4.55
SOD1-203ENST00000470944 KIF15Q9NS87 1388 aa43.45■■■■■ 4.55
SOD1-203ENST00000470944 ABCA6Q8N139 1617 aa43.44■■■■■ 4.54
SOD1-203ENST00000470944 HFM1A2PYH4 1435 aa43.41■■■■■ 4.54
SOD1-203ENST00000470944 NAIPQ13075 1403 aa43.41■■■■■ 4.54
SOD1-203ENST00000470944 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa43.4■■■■■ 4.54
SOD1-203ENST00000470944 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa43.34■■■■■ 4.53
SOD1-203ENST00000470944 DUOX2Q9NRD8 1548 aa43.31■■■■■ 4.52
SOD1-203ENST00000470944 GCC2Q8IWJ2 1684 aa43.3■■■■■ 4.52
SOD1-203ENST00000470944 A2MP01023 1474 aa43.29■■■■■ 4.52
SOD1-203ENST00000470944 ATP10AO60312 1499 aa43.29■■■■■ 4.52
SOD1-203ENST00000470944 SETD5Q9C0A6 1442 aa43.28■■■■■ 4.52
SOD1-203ENST00000470944 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa43.28■■■■■ 4.52
SOD1-203ENST00000470944 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP43.27■■■■■ 4.52
SOD1-203ENST00000470944 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa43.21■■■■■ 4.51
SOD1-203ENST00000470944 ERBINQ96RT1 1412 aa43.2■■■■■ 4.51
SOD1-203ENST00000470944 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa43.15■■■■■ 4.5
SOD1-203ENST00000470944 REREQ9P2R6 1566 aa43.15■■■■■ 4.5
SOD1-203ENST00000470944 KIF3BO15066 747 aa43.1■■■■■ 4.49
SOD1-203ENST00000470944 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP43.06■■■■■ 4.48
SOD1-203ENST00000470944 AGLP35573 1532 aa43.03■■■■■ 4.48
SOD1-203ENST00000470944 BCORL1Q5H9F3 1711 aa42.98■■■■■ 4.47
SOD1-203ENST00000470944 HRCP23327 699 aa42.98■■■■■ 4.47
SOD1-203ENST00000470944 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP42.97■■■■■ 4.47
SOD1-203ENST00000470944 GGT6Q6P531 493 aa42.95■■■■■ 4.47
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