RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469826.1

CEP41-204, Transcript of centrosomal protein 41, human

TSL 5

Gene CEP41, Length 516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CEP41-204	ENST00000469826	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		40.6	■■■■■ 4.09
CEP41-204	ENST00000469826	RICTOR	Q6R327	1708 aa		40.56	■■■■■ 4.08
CEP41-204	ENST00000469826	PREX2	Q70Z35	1606 aa		40.55	■■■■■ 4.08
CEP41-204	ENST00000469826	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		40.53	■■■■■ 4.08
CEP41-204	ENST00000469826	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		40.53	■■■■■ 4.08
CEP41-204	ENST00000469826	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		40.53	■■■■■ 4.08
CEP41-204	ENST00000469826	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		40.5	■■■■■ 4.07
CEP41-204	ENST00000469826	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	40.5	■■■■■ 4.07
CEP41-204	ENST00000469826	TIAM1	Q13009	1591 aa		40.48	■■■■■ 4.07
CEP41-204	ENST00000469826	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		40.47	■■■■■ 4.07
CEP41-204	ENST00000469826	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		40.47	■■■■■ 4.07
CEP41-204	ENST00000469826	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		40.45	■■■■■ 4.07
CEP41-204	ENST00000469826	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	40.44	■■■■■ 4.06
CEP41-204	ENST00000469826	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	40.43	■■■■■ 4.06
CEP41-204	ENST00000469826	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		40.42	■■■■■ 4.06
CEP41-204	ENST00000469826	AFAP1	Q8N556	730 aa		40.4	■■■■■ 4.06
CEP41-204	ENST00000469826	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		40.39	■■■■■ 4.06
CEP41-204	ENST00000469826	MAP3K1	Q13233	1512 aa		40.38	■■■■■ 4.06
CEP41-204	ENST00000469826	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		40.37	■■■■■ 4.05
CEP41-204	ENST00000469826	ABCC1	P33527	1531 aa		40.37	■■■■■ 4.05
CEP41-204	ENST00000469826	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		40.34	■■■■■ 4.05
CEP41-204	ENST00000469826	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		40.34	■■■■■ 4.05
CEP41-204	ENST00000469826	APLP2	Q06481	763 aa		40.34	■■■■■ 4.05
CEP41-204	ENST00000469826	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		40.33	■■■■■ 4.05
CEP41-204	ENST00000469826	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	40.33	■■■■■ 4.05
CEP41-204	ENST00000469826	NCOA2	Q15596	1464 aa		40.32	■■■■■ 4.04
CEP41-204	ENST00000469826	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	40.3	■■■■■ 4.04
CEP41-204	ENST00000469826	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		40.3	■■■■■ 4.04
CEP41-204	ENST00000469826	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		40.3	■■■■■ 4.04
CEP41-204	ENST00000469826	KDM5C	P41229	1560 aa		40.29	■■■■■ 4.04
CEP41-204	ENST00000469826	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		40.28	■■■■■ 4.04
CEP41-204	ENST00000469826	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		40.27	■■■■■ 4.04
CEP41-204	ENST00000469826	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	40.27	■■■■■ 4.04
CEP41-204	ENST00000469826	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		40.25	■■■■■ 4.03
CEP41-204	ENST00000469826	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		40.25	■■■■■ 4.03
CEP41-204	ENST00000469826	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	40.25	■■■■■ 4.03
CEP41-204	ENST00000469826	ATP10A	O60312	1499 aa		40.23	■■■■■ 4.03
CEP41-204	ENST00000469826	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		40.21	■■■■■ 4.03
CEP41-204	ENST00000469826	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		40.21	■■■■■ 4.03
CEP41-204	ENST00000469826	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		40.18	■■■■■ 4.02
CEP41-204	ENST00000469826	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	40.17	■■■■■ 4.02
CEP41-204	ENST00000469826	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		40.16	■■■■■ 4.02
CEP41-204	ENST00000469826	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	40.12	■■■■■ 4.01
CEP41-204	ENST00000469826	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		40.1	■■■■■ 4.01
CEP41-204	ENST00000469826	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		40.08	■■■■■ 4.01
CEP41-204	ENST00000469826	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		40.06	■■■■■ 4
CEP41-204	ENST00000469826	MBD5	Q9P267	1494 aa		40.03	■■■■■ 4
CEP41-204	ENST00000469826	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		40.02	■■■■■ 4
CEP41-204	ENST00000469826	MLEC	Q14165	292 aa		40.02	■■■■■ 4
CEP41-204	ENST00000469826	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		40.01	■■■■■ 4
CEP41-204	ENST00000469826	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		40.01	■■■■■ 4
CEP41-204	ENST00000469826	ABCA6	Q8N139	1617 aa		40.01	■■■■■ 4
CEP41-204	ENST00000469826	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		40	■■■■□ 3.99
CEP41-204	ENST00000469826	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		39.99	■■■■□ 3.99
CEP41-204	ENST00000469826	RERE	Q9P2R6	1566 aa		39.98	■■■■□ 3.99
CEP41-204	ENST00000469826	MIA2	Q96PC5	1412 aa		39.95	■■■■□ 3.99
CEP41-204	ENST00000469826	ATP7A	Q04656	1500 aa		39.95	■■■■□ 3.99
CEP41-204	ENST00000469826	MADD	Q8WXG6	1647 aa		39.94	■■■■□ 3.99
CEP41-204	ENST00000469826	PTPRM	P28827	1452 aa		39.94	■■■■□ 3.98
CEP41-204	ENST00000469826	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	39.9	■■■■□ 3.98
CEP41-204	ENST00000469826	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		39.9	■■■■□ 3.98
CEP41-204	ENST00000469826	AGL	P35573	1532 aa		39.88	■■■■□ 3.97
CEP41-204	ENST00000469826	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		39.88	■■■■□ 3.97
CEP41-204	ENST00000469826	TSPY4	P0CV99	314 aa		39.84	■■■■□ 3.97
CEP41-204	ENST00000469826	TSPY10	P0CW01	314 aa		39.84	■■■■□ 3.97
CEP41-204	ENST00000469826	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		39.83	■■■■□ 3.97
CEP41-204	ENST00000469826	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	39.81	■■■■□ 3.96
CEP41-204	ENST00000469826	A2M	P01023	1474 aa		39.81	■■■■□ 3.96
CEP41-204	ENST00000469826	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		39.74	■■■■□ 3.95
CEP41-204	ENST00000469826	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	39.73	■■■■□ 3.95
CEP41-204	ENST00000469826	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		39.73	■■■■□ 3.95
CEP41-204	ENST00000469826	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		39.71	■■■■□ 3.95
CEP41-204	ENST00000469826	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		39.71	■■■■□ 3.95
CEP41-204	ENST00000469826	PLXNC1	O60486	1568 aa		39.71	■■■■□ 3.95
CEP41-204	ENST00000469826	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	39.69	■■■■□ 3.94
CEP41-204	ENST00000469826	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		39.68	■■■■□ 3.94
CEP41-204	ENST00000469826	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	39.63	■■■■□ 3.94
CEP41-204	ENST00000469826	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		39.61	■■■■□ 3.93
CEP41-204	ENST00000469826	GGT6	Q6P531	493 aa		39.6	■■■■□ 3.93
CEP41-204	ENST00000469826	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		39.58	■■■■□ 3.93
CEP41-204	ENST00000469826	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	39.58	■■■■□ 3.93
CEP41-204	ENST00000469826	ABCC5	O15440	1437 aa		39.57	■■■■□ 3.92
CEP41-204	ENST00000469826	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		39.55	■■■■□ 3.92
CEP41-204	ENST00000469826	KIF3B	O15066	747 aa		39.54	■■■■□ 3.92
CEP41-204	ENST00000469826	DAPK1	P53355	1430 aa		39.52	■■■■□ 3.92
CEP41-204	ENST00000469826	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	39.52	■■■■□ 3.92
CEP41-204	ENST00000469826	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	39.51	■■■■□ 3.92
CEP41-204	ENST00000469826	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		39.5	■■■■□ 3.91
CEP41-204	ENST00000469826	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	39.47	■■■■□ 3.91
CEP41-204	ENST00000469826	ZMYM3	Q14202	1370 aa		39.44	■■■■□ 3.9
CEP41-204	ENST00000469826	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		39.43	■■■■□ 3.9
CEP41-204	ENST00000469826	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		39.42	■■■■□ 3.9
CEP41-204	ENST00000469826	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		39.4	■■■■□ 3.9
CEP41-204	ENST00000469826	C3	P01024	1663 aa		39.4	■■■■□ 3.9
CEP41-204	ENST00000469826	KIF15	Q9NS87	1388 aa		39.39	■■■■□ 3.9
CEP41-204	ENST00000469826	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		39.39	■■■■□ 3.9
CEP41-204	ENST00000469826	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		39.38	■■■■□ 3.89
CEP41-204	ENST00000469826	MROH2A	A6NES4	1674 aa		39.38	■■■■□ 3.89
CEP41-204	ENST00000469826	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		39.36	■■■■□ 3.89
CEP41-204	ENST00000469826	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	39.35	■■■■□ 3.89

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