RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469389.5

SYP-204, Transcript of synaptophysin, humanhuman

TSL 4

Gene SYP, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-204ENST00000469389 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.36■■□□□ 1.49
SYP-204ENST00000469389 FANCAO15360 1455 aa24.36■■□□□ 1.49
SYP-204ENST00000469389 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.35■■□□□ 1.49
SYP-204ENST00000469389 NEO1Q92859 1461 aa24.34■■□□□ 1.49
SYP-204ENST00000469389 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
SYP-204ENST00000469389 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
SYP-204ENST00000469389 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
SYP-204ENST00000469389 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.31■■□□□ 1.48
SYP-204ENST00000469389 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.3■■□□□ 1.48
SYP-204ENST00000469389 AKNAQ7Z591 1439 aa24.28■■□□□ 1.48
SYP-204ENST00000469389 MIA2Q96PC5 1412 aa24.26■■□□□ 1.47
SYP-204ENST00000469389 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.26■■□□□ 1.47
SYP-204ENST00000469389 ADGRL1O94910 1474 aa24.25■■□□□ 1.47
SYP-204ENST00000469389 KDM6BO15054 1643 aa24.23■■□□□ 1.47
SYP-204ENST00000469389 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.19■■□□□ 1.46
SYP-204ENST00000469389 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.19■■□□□ 1.46
SYP-204ENST00000469389 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
SYP-204ENST00000469389 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.17■■□□□ 1.46
SYP-204ENST00000469389 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.17■■□□□ 1.46
SYP-204ENST00000469389 ABCC1P33527 1531 aa24.16■■□□□ 1.46
SYP-204ENST00000469389 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.16■■□□□ 1.46
SYP-204ENST00000469389 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
SYP-204ENST00000469389 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.15■■□□□ 1.46
SYP-204ENST00000469389 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.15■■□□□ 1.46
SYP-204ENST00000469389 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.14■■□□□ 1.45
SYP-204ENST00000469389 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
SYP-204ENST00000469389 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.13■■□□□ 1.45
SYP-204ENST00000469389 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.13■■□□□ 1.45
SYP-204ENST00000469389 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.12■■□□□ 1.45
SYP-204ENST00000469389 RAPGEF3O95398 923 aa24.11■■□□□ 1.45
SYP-204ENST00000469389 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.1■■□□□ 1.45
SYP-204ENST00000469389 TSPY4P0CV99 314 aa24.08■■□□□ 1.45
SYP-204ENST00000469389 TSPY10P0CW01 314 aa24.08■■□□□ 1.45
SYP-204ENST00000469389 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
SYP-204ENST00000469389 RICTORQ6R327 1708 aa24.06■■□□□ 1.44
SYP-204ENST00000469389 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.06■■□□□ 1.44
SYP-204ENST00000469389 AFAP1Q8N556 730 aa24.05■■□□□ 1.44
SYP-204ENST00000469389 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
SYP-204ENST00000469389 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.04■■□□□ 1.44
SYP-204ENST00000469389 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
SYP-204ENST00000469389 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.04■■□□□ 1.44
SYP-204ENST00000469389 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.03■■□□□ 1.44
SYP-204ENST00000469389 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
SYP-204ENST00000469389 MBD5Q9P267 1494 aa24.01■■□□□ 1.43
SYP-204ENST00000469389 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.01■■□□□ 1.43
SYP-204ENST00000469389 MAGI2Q86UL8 1455 aa24■■□□□ 1.43
SYP-204ENST00000469389 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa23.99■■□□□ 1.43
SYP-204ENST00000469389 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.99■■□□□ 1.43
SYP-204ENST00000469389 KDM5CP41229 1560 aa23.99■■□□□ 1.43
SYP-204ENST00000469389 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.99■■□□□ 1.43
SYP-204ENST00000469389 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
SYP-204ENST00000469389 DAPK1P53355 1430 aa23.96■■□□□ 1.43
SYP-204ENST00000469389 ITGAEP38570 1179 aa23.96■■□□□ 1.43
SYP-204ENST00000469389 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.95■■□□□ 1.43
SYP-204ENST00000469389 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.95■■□□□ 1.42
SYP-204ENST00000469389 ATP7AQ04656 1500 aa23.93■■□□□ 1.42
SYP-204ENST00000469389 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa23.93■■□□□ 1.42
SYP-204ENST00000469389 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.93■■□□□ 1.42
SYP-204ENST00000469389 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.92■■□□□ 1.42
SYP-204ENST00000469389 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.92■■□□□ 1.42
SYP-204ENST00000469389 ABCC5O15440 1437 aa23.92■■□□□ 1.42
SYP-204ENST00000469389 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
SYP-204ENST00000469389 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa23.89■■□□□ 1.41
SYP-204ENST00000469389 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23.88■■□□□ 1.41
SYP-204ENST00000469389 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.88■■□□□ 1.41
SYP-204ENST00000469389 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.88■■□□□ 1.41
SYP-204ENST00000469389 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.87■■□□□ 1.41
SYP-204ENST00000469389 ATP10AO60312 1499 aa23.86■■□□□ 1.41
SYP-204ENST00000469389 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.85■■□□□ 1.41
SYP-204ENST00000469389 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.84■■□□□ 1.41
SYP-204ENST00000469389 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
SYP-204ENST00000469389 ABCA6Q8N139 1617 aa23.82■■□□□ 1.4
SYP-204ENST00000469389 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.82■■□□□ 1.4
SYP-204ENST00000469389 PLXNC1O60486 1568 aa23.81■■□□□ 1.4
SYP-204ENST00000469389 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.8■■□□□ 1.4
SYP-204ENST00000469389 KIF15Q9NS87 1388 aa23.79■■□□□ 1.4
SYP-204ENST00000469389 A2MP01023 1474 aa23.79■■□□□ 1.4
SYP-204ENST00000469389 ROCK1Q13464 1354 aa23.78■■□□□ 1.4
SYP-204ENST00000469389 ADGRL2O95490 1459 aa23.77■■□□□ 1.4
SYP-204ENST00000469389 DUOX2Q9NRD8 1548 aa23.76■■□□□ 1.39
SYP-204ENST00000469389 NCOA1Q15788 1441 aa23.76■■□□□ 1.39
SYP-204ENST00000469389 REREQ9P2R6 1566 aa23.75■■□□□ 1.39
SYP-204ENST00000469389 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
SYP-204ENST00000469389 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
SYP-204ENST00000469389 PTPRKQ15262 1439 aa23.74■■□□□ 1.39
SYP-204ENST00000469389 ERBINQ96RT1 1412 aa23.69■■□□□ 1.38
SYP-204ENST00000469389 AGLP35573 1532 aa23.69■■□□□ 1.38
SYP-204ENST00000469389 KIF3BO15066 747 aa23.68■■□□□ 1.38
SYP-204ENST00000469389 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
SYP-204ENST00000469389 MLECQ14165 292 aa23.67■■□□□ 1.38
SYP-204ENST00000469389 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.67■■□□□ 1.38
SYP-204ENST00000469389 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
SYP-204ENST00000469389 GGT6Q6P531 493 aa23.64■■□□□ 1.37
SYP-204ENST00000469389 HFM1A2PYH4 1435 aa23.63■■□□□ 1.37
SYP-204ENST00000469389 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.62■■□□□ 1.37
SYP-204ENST00000469389 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
SYP-204ENST00000469389 KANK1Q14678 1352 aa23.59■■□□□ 1.37
SYP-204ENST00000469389 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.59■■□□□ 1.37
SYP-204ENST00000469389 NAIPQ13075 1403 aa23.59■■□□□ 1.37
SYP-204ENST00000469389 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms