RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468018.5

ATG4B-215, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4B, Length 721 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-215ENST00000468018 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.32■■□□□ 1.48
ATG4B-215ENST00000468018 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.32■■□□□ 1.48
ATG4B-215ENST00000468018 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa24.31■■□□□ 1.48
ATG4B-215ENST00000468018 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.31■■□□□ 1.48
ATG4B-215ENST00000468018 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.31■■□□□ 1.48
ATG4B-215ENST00000468018 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.3■■□□□ 1.48
ATG4B-215ENST00000468018 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.29■■□□□ 1.48
ATG4B-215ENST00000468018 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
ATG4B-215ENST00000468018 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.26■■□□□ 1.47
ATG4B-215ENST00000468018 ABCC1P33527 1531 aa24.26■■□□□ 1.47
ATG4B-215ENST00000468018 KDM5CP41229 1560 aa24.26■■□□□ 1.47
ATG4B-215ENST00000468018 TIAM1Q13009 1591 aa24.26■■□□□ 1.47
ATG4B-215ENST00000468018 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
ATG4B-215ENST00000468018 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.25■■□□□ 1.47
ATG4B-215ENST00000468018 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.24■■□□□ 1.47
ATG4B-215ENST00000468018 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa24.22■■□□□ 1.47
ATG4B-215ENST00000468018 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.21■■□□□ 1.47
ATG4B-215ENST00000468018 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.21■■□□□ 1.47
ATG4B-215ENST00000468018 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.21■■□□□ 1.47
ATG4B-215ENST00000468018 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa24.21■■□□□ 1.47
ATG4B-215ENST00000468018 MAP3K1Q13233 1512 aa24.2■■□□□ 1.47
ATG4B-215ENST00000468018 YEATS2Q9ULM3 1422 aa24.19■■□□□ 1.46
ATG4B-215ENST00000468018 ADAMTSL3P82987 1691 aa24.19■■□□□ 1.46
ATG4B-215ENST00000468018 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.18■■□□□ 1.46
ATG4B-215ENST00000468018 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
ATG4B-215ENST00000468018 HECW2Q9P2P5 1572 aa24.16■■□□□ 1.46
ATG4B-215ENST00000468018 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.14■■□□□ 1.45
ATG4B-215ENST00000468018 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.13■■□□□ 1.45
ATG4B-215ENST00000468018 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.13■■□□□ 1.45
ATG4B-215ENST00000468018 MLH3Q9UHC1 1453 aa24.13■■□□□ 1.45
ATG4B-215ENST00000468018 NCOA2Q15596 1464 aa24.12■■□□□ 1.45
ATG4B-215ENST00000468018 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.11■■□□□ 1.45
ATG4B-215ENST00000468018 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.11■■□□□ 1.45
ATG4B-215ENST00000468018 AFAP1Q8N556 730 aa24.11■■□□□ 1.45
ATG4B-215ENST00000468018 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.1■■□□□ 1.45
ATG4B-215ENST00000468018 REREQ9P2R6 1566 aa24.09■■□□□ 1.45
ATG4B-215ENST00000468018 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa24.09■■□□□ 1.45
ATG4B-215ENST00000468018 ABCA6Q8N139 1617 aa24.09■■□□□ 1.45
ATG4B-215ENST00000468018 ATP10AO60312 1499 aa24.08■■□□□ 1.45
ATG4B-215ENST00000468018 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.08■■□□□ 1.45
ATG4B-215ENST00000468018 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.07■■□□□ 1.44
ATG4B-215ENST00000468018 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
ATG4B-215ENST00000468018 MADDQ8WXG6 1647 aa24.06■■□□□ 1.44
ATG4B-215ENST00000468018 MBD5Q9P267 1494 aa24.02■■□□□ 1.44
ATG4B-215ENST00000468018 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
ATG4B-215ENST00000468018 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
ATG4B-215ENST00000468018 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
ATG4B-215ENST00000468018 PTPRMP28827 1452 aa23.99■■□□□ 1.43
ATG4B-215ENST00000468018 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
ATG4B-215ENST00000468018 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa23.97■■□□□ 1.43
ATG4B-215ENST00000468018 AGLP35573 1532 aa23.97■■□□□ 1.43
ATG4B-215ENST00000468018 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.97■■□□□ 1.434e-7■■■■□ 21.8
ATG4B-215ENST00000468018 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
ATG4B-215ENST00000468018 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
ATG4B-215ENST00000468018 ATP7AQ04656 1500 aa23.96■■□□□ 1.43
ATG4B-215ENST00000468018 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.95■■□□□ 1.42
ATG4B-215ENST00000468018 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.92■■□□□ 1.42
ATG4B-215ENST00000468018 PLXNC1O60486 1568 aa23.91■■□□□ 1.42
ATG4B-215ENST00000468018 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
ATG4B-215ENST00000468018 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.9■■□□□ 1.42
ATG4B-215ENST00000468018 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.89■■□□□ 1.42
ATG4B-215ENST00000468018 MIA2Q96PC5 1412 aa23.89■■□□□ 1.41
ATG4B-215ENST00000468018 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.88■■□□□ 1.41
ATG4B-215ENST00000468018 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa23.88■■□□□ 1.41
ATG4B-215ENST00000468018 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.85■■□□□ 1.41
ATG4B-215ENST00000468018 APLP2Q06481 763 aa23.84■■□□□ 1.41
ATG4B-215ENST00000468018 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.84■■□□□ 1.41
ATG4B-215ENST00000468018 A2MP01023 1474 aa23.82■■□□□ 1.4
ATG4B-215ENST00000468018 MLECQ14165 292 aa23.82■■□□□ 1.4
ATG4B-215ENST00000468018 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23.82■■□□□ 1.4
ATG4B-215ENST00000468018 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.79■■□□□ 1.4
ATG4B-215ENST00000468018 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.76■■□□□ 1.39
ATG4B-215ENST00000468018 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
ATG4B-215ENST00000468018 MROH2AA6NES4 1674 aa23.75■■□□□ 1.39
ATG4B-215ENST00000468018 C3P01024 1663 aa23.75■■□□□ 1.39
ATG4B-215ENST00000468018 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.74■■□□□ 1.39
ATG4B-215ENST00000468018 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
ATG4B-215ENST00000468018 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
ATG4B-215ENST00000468018 LMTK3Q96Q04 1460 aa23.72■■□□□ 1.39
ATG4B-215ENST00000468018 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.39
ATG4B-215ENST00000468018 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.7■■□□□ 1.38
ATG4B-215ENST00000468018 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.69■■□□□ 1.38
ATG4B-215ENST00000468018 PREX1Q8TCU6 1659 aa23.68■■□□□ 1.38
ATG4B-215ENST00000468018 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
ATG4B-215ENST00000468018 TSPY4P0CV99 314 aa23.66■■□□□ 1.38
ATG4B-215ENST00000468018 TSPY10P0CW01 314 aa23.66■■□□□ 1.38
ATG4B-215ENST00000468018 ABCC5O15440 1437 aa23.66■■□□□ 1.38
ATG4B-215ENST00000468018 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
ATG4B-215ENST00000468018 DAPK1P53355 1430 aa23.63■■□□□ 1.37
ATG4B-215ENST00000468018 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.63■■□□□ 1.37
ATG4B-215ENST00000468018 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
ATG4B-215ENST00000468018 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
ATG4B-215ENST00000468018 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.62■■□□□ 1.37
ATG4B-215ENST00000468018 ZMYM3Q14202 1370 aa23.58■■□□□ 1.37
ATG4B-215ENST00000468018 DUOX2Q9NRD8 1548 aa23.58■■□□□ 1.36
ATG4B-215ENST00000468018 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.57■■□□□ 1.36
ATG4B-215ENST00000468018 MROH1Q8NDA8 1641 aa23.56■■□□□ 1.36
ATG4B-215ENST00000468018 GGT6Q6P531 493 aa23.56■■□□□ 1.36
ATG4B-215ENST00000468018 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
ATG4B-215ENST00000468018 NPATQ14207 1427 aa23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.2 ms