RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467594.1

NISCH-205, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 1,014 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-205ENST00000467594 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.86■■□□□ 1.57
NISCH-205ENST00000467594 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.86■■□□□ 1.57
NISCH-205ENST00000467594 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
NISCH-205ENST00000467594 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa24.82■■□□□ 1.56
NISCH-205ENST00000467594 CEP162Q5TB80 1403 aa24.82■■□□□ 1.56
NISCH-205ENST00000467594 ADAMTSL3P82987 1691 aa24.79■■□□□ 1.56
NISCH-205ENST00000467594 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.78■■□□□ 1.56
NISCH-205ENST00000467594 PREX2Q70Z35 1606 aa24.78■■□□□ 1.56
NISCH-205ENST00000467594 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.78■■□□□ 1.56
NISCH-205ENST00000467594 YEATS2Q9ULM3 1422 aa24.78■■□□□ 1.56
NISCH-205ENST00000467594 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.77■■□□□ 1.56
NISCH-205ENST00000467594 PTPRMP28827 1452 aa24.72■■□□□ 1.55
NISCH-205ENST00000467594 AFAP1Q8N556 730 aa24.72■■□□□ 1.55
NISCH-205ENST00000467594 ATP10AO60312 1499 aa24.71■■□□□ 1.55
NISCH-205ENST00000467594 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.71■■□□□ 1.55
NISCH-205ENST00000467594 KDM5CP41229 1560 aa24.71■■□□□ 1.55
NISCH-205ENST00000467594 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.7■■□□□ 1.54
NISCH-205ENST00000467594 ABCC1P33527 1531 aa24.69■■□□□ 1.54
NISCH-205ENST00000467594 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.68■■□□□ 1.54
NISCH-205ENST00000467594 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.68■■□□□ 1.54
NISCH-205ENST00000467594 MADDQ8WXG6 1647 aa24.68■■□□□ 1.54
NISCH-205ENST00000467594 HECW2Q9P2P5 1572 aa24.67■■□□□ 1.54
NISCH-205ENST00000467594 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
NISCH-205ENST00000467594 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.67■■□□□ 1.54
NISCH-205ENST00000467594 MLH3Q9UHC1 1453 aa24.65■■□□□ 1.54
NISCH-205ENST00000467594 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.65■■□□□ 1.54
NISCH-205ENST00000467594 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.64■■□□□ 1.53
NISCH-205ENST00000467594 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.63■■□□□ 1.53
NISCH-205ENST00000467594 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.63■■□□□ 1.53
NISCH-205ENST00000467594 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
NISCH-205ENST00000467594 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa24.63■■□□□ 1.53
NISCH-205ENST00000467594 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.62■■□□□ 1.53
NISCH-205ENST00000467594 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
NISCH-205ENST00000467594 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
NISCH-205ENST00000467594 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.59■■□□□ 1.53
NISCH-205ENST00000467594 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.59■■□□□ 1.53
NISCH-205ENST00000467594 MLECQ14165 292 aa24.59■■□□□ 1.53
NISCH-205ENST00000467594 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.58■■□□□ 1.53
NISCH-205ENST00000467594 REREQ9P2R6 1566 aa24.58■■□□□ 1.52
NISCH-205ENST00000467594 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa24.58■■□□□ 1.52
NISCH-205ENST00000467594 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.57■■□□□ 1.52
NISCH-205ENST00000467594 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.55■■□□□ 1.52
NISCH-205ENST00000467594 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.54■■□□□ 1.52
NISCH-205ENST00000467594 ABCA6Q8N139 1617 aa24.53■■□□□ 1.52
NISCH-205ENST00000467594 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa24.52■■□□□ 1.52
NISCH-205ENST00000467594 TIAM1Q13009 1591 aa24.52■■□□□ 1.52
NISCH-205ENST00000467594 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
NISCH-205ENST00000467594 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.51■■□□□ 1.51
NISCH-205ENST00000467594 AGLP35573 1532 aa24.5■■□□□ 1.51
NISCH-205ENST00000467594 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
NISCH-205ENST00000467594 NCOA2Q15596 1464 aa24.46■■□□□ 1.51
NISCH-205ENST00000467594 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.45■■□□□ 1.5
NISCH-205ENST00000467594 MAP3K1Q13233 1512 aa24.44■■□□□ 1.5
NISCH-205ENST00000467594 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.44■■□□□ 1.5
NISCH-205ENST00000467594 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
NISCH-205ENST00000467594 ATP7AQ04656 1500 aa24.43■■□□□ 1.5
NISCH-205ENST00000467594 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.43■■□□□ 1.5
NISCH-205ENST00000467594 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
NISCH-205ENST00000467594 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
NISCH-205ENST00000467594 MBD5Q9P267 1494 aa24.4■■□□□ 1.5
NISCH-205ENST00000467594 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.39■■□□□ 1.49
NISCH-205ENST00000467594 A2MP01023 1474 aa24.36■■□□□ 1.49
NISCH-205ENST00000467594 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.35■■□□□ 1.49
NISCH-205ENST00000467594 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.35■■□□□ 1.49
NISCH-205ENST00000467594 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
NISCH-205ENST00000467594 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.34■■□□□ 1.49
NISCH-205ENST00000467594 APLP2Q06481 763 aa24.33■■□□□ 1.49
NISCH-205ENST00000467594 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
NISCH-205ENST00000467594 PLXNC1O60486 1568 aa24.32■■□□□ 1.48
NISCH-205ENST00000467594 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.32■■□□□ 1.48
NISCH-205ENST00000467594 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.31■■□□□ 1.48
NISCH-205ENST00000467594 HSPA2P54652 639 aa24.29■■□□□ 1.48
NISCH-205ENST00000467594 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.29■■□□□ 1.48
NISCH-205ENST00000467594 C3P01024 1663 aa24.27■■□□□ 1.48
NISCH-205ENST00000467594 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.26■■□□□ 1.47
NISCH-205ENST00000467594 TSPY4P0CV99 314 aa24.26■■□□□ 1.47
NISCH-205ENST00000467594 TSPY10P0CW01 314 aa24.26■■□□□ 1.47
NISCH-205ENST00000467594 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.26■■□□□ 1.47
NISCH-205ENST00000467594 MIA2Q96PC5 1412 aa24.26■■□□□ 1.47
NISCH-205ENST00000467594 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
NISCH-205ENST00000467594 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
NISCH-205ENST00000467594 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.25■■□□□ 1.47
NISCH-205ENST00000467594 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.24■■□□□ 1.47
NISCH-205ENST00000467594 MROH2AA6NES4 1674 aa24.24■■□□□ 1.47
NISCH-205ENST00000467594 GGT6Q6P531 493 aa24.23■■□□□ 1.47
NISCH-205ENST00000467594 ZMYM3Q14202 1370 aa24.21■■□□□ 1.47
NISCH-205ENST00000467594 NPATQ14207 1427 aa24.19■■□□□ 1.46
NISCH-205ENST00000467594 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
NISCH-205ENST00000467594 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
NISCH-205ENST00000467594 KIF3BO15066 747 aa24.15■■□□□ 1.46
NISCH-205ENST00000467594 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.14■■□□□ 1.45
NISCH-205ENST00000467594 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.12■■□□□ 1.45
NISCH-205ENST00000467594 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.1■■□□□ 1.45
NISCH-205ENST00000467594 PTPRKQ15262 1439 aa24.08■■□□□ 1.44
NISCH-205ENST00000467594 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.06■■□□□ 1.44
NISCH-205ENST00000467594 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.05■■□□□ 1.44
NISCH-205ENST00000467594 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.05■■□□□ 1.44
NISCH-205ENST00000467594 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.05■■□□□ 1.44
NISCH-205ENST00000467594 STRCQ7RTU9 1775 aa24.04■■□□□ 1.44
NISCH-205ENST00000467594 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
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