RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466891.5

TMOD4-204, Transcript of tropomodulin 4, humanhuman

TSL 5

Gene TMOD4, Length 441 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4-204ENST00000466891 PDS5BQ9NTI5 1447 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD4-204ENST00000466891 SCUBE2Q9NQ36 999 aa7.71□□□□□ -1.18
TMOD4-204ENST00000466891 GOLGA2Q08379 1002 aa7.7□□□□□ -1.18
TMOD4-204ENST00000466891 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP7.7□□□□□ -1.18
TMOD4-204ENST00000466891 MROH2BQ7Z745 1585 aa7.69□□□□□ -1.18
TMOD4-204ENST00000466891 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
TMOD4-204ENST00000466891 EFCAB3Q8N7B9 438 aa7.69□□□□□ -1.18
TMOD4-204ENST00000466891 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa7.69□□□□□ -1.18
TMOD4-204ENST00000466891 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa7.69□□□□□ -1.18
TMOD4-204ENST00000466891 HS6ST3Q8IZP7 471 aa7.68□□□□□ -1.18
TMOD4-204ENST00000466891 CADPSQ9ULU8 1353 aa7.68□□□□□ -1.18
TMOD4-204ENST00000466891 DPY19L2Q6NUT2 758 aa7.66□□□□□ -1.18
TMOD4-204ENST00000466891 TAOK2Q9UL54 1235 aa7.66□□□□□ -1.18
TMOD4-204ENST00000466891 WDR62O43379 1518 aa7.65□□□□□ -1.18
TMOD4-204ENST00000466891 MRC2Q9UBG0 1479 aa7.65□□□□□ -1.18
TMOD4-204ENST00000466891 SOX12O15370 315 aa7.64□□□□□ -1.19
TMOD4-204ENST00000466891 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
TMOD4-204ENST00000466891 CFAP44Q96MT7 982 aa7.64□□□□□ -1.19
TMOD4-204ENST00000466891 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
TMOD4-204ENST00000466891 MS4A4AQ96JQ5 239 aa7.63□□□□□ -1.19
TMOD4-204ENST00000466891 CHGAP10645 457 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
TMOD4-204ENST00000466891 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
TMOD4-204ENST00000466891 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
TMOD4-204ENST00000466891 STK25O00506 426 aa7.6□□□□□ -1.19
TMOD4-204ENST00000466891 SLAIN1Q8ND83 568 aa7.6□□□□□ -1.19
TMOD4-204ENST00000466891 FBXO22Q8NEZ5 403 aa7.6□□□□□ -1.19
TMOD4-204ENST00000466891 PHF8Q9UPP1 1060 aa7.6□□□□□ -1.19
TMOD4-204ENST00000466891 STK24Q9Y6E0 443 aa7.6□□□□□ -1.19
TMOD4-204ENST00000466891 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa7.59□□□□□ -1.19
TMOD4-204ENST00000466891 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
TMOD4-204ENST00000466891 BOLA1Q9Y3E2 137 aa7.59□□□□□ -1.19
TMOD4-204ENST00000466891 CEP164Q9UPV0 1460 aa7.58□□□□□ -1.2
TMOD4-204ENST00000466891 MFRPQ9BY79 579 aa7.58□□□□□ -1.2
TMOD4-204ENST00000466891 WIZO95785 1651 aa7.57□□□□□ -1.2
TMOD4-204ENST00000466891 FANCD2Q9BXW9 1451 aa7.57□□□□□ -1.2
TMOD4-204ENST00000466891 CFTRP13569 1480 aa7.56□□□□□ -1.2
TMOD4-204ENST00000466891 NLRP6P59044 892 aa7.56□□□□□ -1.2
TMOD4-204ENST00000466891 C3orf67Q6ZVT6 689 aa7.55□□□□□ -1.2
TMOD4-204ENST00000466891 MICALL2Q8IY33 904 aa7.54□□□□□ -1.2
TMOD4-204ENST00000466891 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.2
TMOD4-204ENST00000466891 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
TMOD4-204ENST00000466891 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
TMOD4-204ENST00000466891 TMEM92Q6UXU6 159 aa7.51□□□□□ -1.21
TMOD4-204ENST00000466891 POTEMA6NI47 508 aa7.5□□□□□ -1.21
TMOD4-204ENST00000466891 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
TMOD4-204ENST00000466891 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa7.49□□□□□ -1.21
TMOD4-204ENST00000466891 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa7.49□□□□□ -1.21
TMOD4-204ENST00000466891 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa7.49□□□□□ -1.21
TMOD4-204ENST00000466891 G3V3G9 751 aa7.49□□□□□ -1.21
TMOD4-204ENST00000466891 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
TMOD4-204ENST00000466891 ST18O60284 1047 aa7.49□□□□□ -1.21
TMOD4-204ENST00000466891 POTEGQ6S5H5 508 aa7.49□□□□□ -1.21
TMOD4-204ENST00000466891 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
TMOD4-204ENST00000466891 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
TMOD4-204ENST00000466891 SNPHO15079 494 aa7.48□□□□□ -1.21
TMOD4-204ENST00000466891 TPRNQ4KMQ1 711 aa7.48□□□□□ -1.21
TMOD4-204ENST00000466891 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
TMOD4-204ENST00000466891 PPP1R37O75864 691 aa7.46□□□□□ -1.22
TMOD4-204ENST00000466891 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
TMOD4-204ENST00000466891 ARHGEF11O15085 1522 aa7.46□□□□□ -1.22
TMOD4-204ENST00000466891 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
TMOD4-204ENST00000466891 IFT140Q96RY7 1462 aa7.45□□□□□ -1.22
TMOD4-204ENST00000466891 PRDM2Q13029 1718 aa7.45□□□□□ -1.22
TMOD4-204ENST00000466891 NBR1Q14596 966 aa7.44□□□□□ -1.22
TMOD4-204ENST00000466891 KIF3CO14782 793 aa7.43□□□□□ -1.22
TMOD4-204ENST00000466891 CYB5RLQ6IPT4 315 aa7.43□□□□□ -1.22
TMOD4-204ENST00000466891 TOPBP1Q92547 1522 aa7.42□□□□□ -1.22
TMOD4-204ENST00000466891 CCDC88BA6NC98 1476 aa7.41□□□□□ -1.22
TMOD4-204ENST00000466891 ABCC8Q09428 1581 aa7.41□□□□□ -1.22
TMOD4-204ENST00000466891 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
TMOD4-204ENST00000466891 PCDH10Q9P2E7 1040 aa7.39□□□□□ -1.23
TMOD4-204ENST00000466891 ARAP1Q96P48 1450 aa7.38□□□□□ -1.23
TMOD4-204ENST00000466891 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
TMOD4-204ENST00000466891 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP7.37□□□□□ -1.23
TMOD4-204ENST00000466891 C2orf72A6NCS6 295 aa7.37□□□□□ -1.23
TMOD4-204ENST00000466891 DOK7Q18PE1 504 aa7.37□□□□□ -1.23
TMOD4-204ENST00000466891 CHD1O14646 1710 aa7.37□□□□□ -1.23
TMOD4-204ENST00000466891 DNMBPQ6XZF7 1577 aa7.37□□□□□ -1.23
TMOD4-204ENST00000466891 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
TMOD4-204ENST00000466891 P3H3Q8IVL6 736 aa7.35□□□□□ -1.23
TMOD4-204ENST00000466891 MARVELD3Q96A59 401 aa7.35□□□□□ -1.23
TMOD4-204ENST00000466891 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa7.35□□□□□ -1.23
TMOD4-204ENST00000466891 POTEB3A0JP26 581 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD4-204ENST00000466891 GPR153Q6NV75 609 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD4-204ENST00000466891 POTEBQ6S5H4 581 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD4-204ENST00000466891 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
TMOD4-204ENST00000466891 CDAN1Q8IWY9 1227 aa7.32□□□□□ -1.24
TMOD4-204ENST00000466891 SLC34A2O95436 690 aa7.31□□□□□ -1.24
TMOD4-204ENST00000466891 EMP3P54852 163 aa7.31□□□□□ -1.24
TMOD4-204ENST00000466891 ZNF710Q8N1W2 664 aa7.31□□□□□ -1.24
TMOD4-204ENST00000466891 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
TMOD4-204ENST00000466891 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD4-204ENST00000466891 RIMBP2O15034 1052 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD4-204ENST00000466891 FOXK1P85037 733 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD4-204ENST00000466891 TMC2Q8TDI7 906 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD4-204ENST00000466891 CLASP1Q7Z460 1538 aa7.3□□□□□ -1.24
TMOD4-204ENST00000466891 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TMOD4-204ENST00000466891 SOGA1O94964 1423 aa7.29□□□□□ -1.24
TMOD4-204ENST00000466891 HS3ST6Q96QI5 342 aa7.29□□□□□ -1.24
TMOD4-204ENST00000466891 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms