RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466657.1

SIKE1-205, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

TSL 3

Gene SIKE1, Length 415 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-205ENST00000466657 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa29.38■■■□□ 2.29
SIKE1-205ENST00000466657 POGZQ7Z3K3 1410 aa29.37■■■□□ 2.29
SIKE1-205ENST00000466657 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.37■■■□□ 2.29
SIKE1-205ENST00000466657 SCAPERQ9BY12 1400 aa29.35■■■□□ 2.29
SIKE1-205ENST00000466657 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.35■■■□□ 2.29
SIKE1-205ENST00000466657 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.34■■■□□ 2.29
SIKE1-205ENST00000466657 CLIP1P30622 1438 aa29.33■■■□□ 2.29
SIKE1-205ENST00000466657 YEATS2Q9ULM3 1422 aa29.33■■■□□ 2.29
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SIKE1-205ENST00000466657 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.29■■■□□ 2.28
SIKE1-205ENST00000466657 PREX2Q70Z35 1606 aa29.28■■■□□ 2.28
SIKE1-205ENST00000466657 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.28■■■□□ 2.28
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SIKE1-205ENST00000466657 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.23■■■□□ 2.27
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SIKE1-205ENST00000466657 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa29.21■■■□□ 2.27
SIKE1-205ENST00000466657 ATP10AO60312 1499 aa29.19■■■□□ 2.26
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SIKE1-205ENST00000466657 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.16■■■□□ 2.26
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SIKE1-205ENST00000466657 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.13■■■□□ 2.25
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SIKE1-205ENST00000466657 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.12■■■□□ 2.25
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SIKE1-205ENST00000466657 ABCA6Q8N139 1617 aa29.09■■■□□ 2.25
SIKE1-205ENST00000466657 AFAP1Q8N556 730 aa29.07■■■□□ 2.24
SIKE1-205ENST00000466657 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.04■■■□□ 2.24
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SIKE1-205ENST00000466657 PREX1Q8TCU6 1659 aa28.96■■■□□ 2.23
SIKE1-205ENST00000466657 SYCP2Q9BX26 1530 aa28.94■■■□□ 2.22
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SIKE1-205ENST00000466657 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa28.89■■■□□ 2.22
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SIKE1-205ENST00000466657 C3P01024 1663 aa28.87■■■□□ 2.21
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SIKE1-205ENST00000466657 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
SIKE1-205ENST00000466657 MYT1LQ9UL68 1186 aa28.86■■■□□ 2.21
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SIKE1-205ENST00000466657 ATP7AQ04656 1500 aa28.83■■■□□ 2.21
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SIKE1-205ENST00000466657 MBD5Q9P267 1494 aa28.72■■■□□ 2.19
SIKE1-205ENST00000466657 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa28.71■■■□□ 2.19
SIKE1-205ENST00000466657 FBXO41Q8TF61 875 aa28.69■■■□□ 2.18
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SIKE1-205ENST00000466657 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa28.64■■■□□ 2.18
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SIKE1-205ENST00000466657 MAP3K1Q13233 1512 aa28.58■■■□□ 2.17
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SIKE1-205ENST00000466657 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
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SIKE1-205ENST00000466657 PTPRTO14522 1441 aa28.49■■■□□ 2.15
SIKE1-205ENST00000466657 PTPRKQ15262 1439 aa28.47■■■□□ 2.15
SIKE1-205ENST00000466657 NCOA1Q15788 1441 aa28.47■■■□□ 2.15
SIKE1-205ENST00000466657 FAM135AQ9P2D6 1515 aa28.47■■■□□ 2.15
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SIKE1-205ENST00000466657 GGT6Q6P531 493 aa28.45■■■□□ 2.14
SIKE1-205ENST00000466657 MAST1Q9Y2H9 1570 aa28.44■■■□□ 2.14
SIKE1-205ENST00000466657 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa28.43■■■□□ 2.14
SIKE1-205ENST00000466657 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
SIKE1-205ENST00000466657 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
SIKE1-205ENST00000466657 KDM5DQ9BY66 1539 aa28.38■■■□□ 2.13
SIKE1-205ENST00000466657 MIA2Q96PC5 1412 aa28.38■■■□□ 2.13
SIKE1-205ENST00000466657 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.37■■■□□ 2.13
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