RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466278.1

MKL1-208, Transcript of MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene MKL1, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1-208ENST00000466278 SCAPERQ9BY12 1400 aa36.72■■■■□ 3.47
MKL1-208ENST00000466278 POGZQ7Z3K3 1410 aa36.71■■■■□ 3.47
MKL1-208ENST00000466278 PREX2Q70Z35 1606 aa36.68■■■■□ 3.46
MKL1-208ENST00000466278 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa36.67■■■■□ 3.46
MKL1-208ENST00000466278 MAGI2Q86UL8 1455 aa36.66■■■■□ 3.46
MKL1-208ENST00000466278 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa36.65■■■■□ 3.46
MKL1-208ENST00000466278 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa36.59■■■■□ 3.45
MKL1-208ENST00000466278 ADAMTSL3P82987 1691 aa36.59■■■■□ 3.45
MKL1-208ENST00000466278 BCORL1Q5H9F3 1711 aa36.59■■■■□ 3.45
MKL1-208ENST00000466278 YEATS2Q9ULM3 1422 aa36.58■■■■□ 3.45
MKL1-208ENST00000466278 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa36.57■■■■□ 3.45
MKL1-208ENST00000466278 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP36.56■■■■□ 3.44
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MKL1-208ENST00000466278 ABCC1P33527 1531 aa36.52■■■■□ 3.44
MKL1-208ENST00000466278 MTUS2Q5JR59 1369 aa36.52■■■■□ 3.44
MKL1-208ENST00000466278 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.5■■■■□ 3.43
MKL1-208ENST00000466278 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa36.47■■■■□ 3.43
MKL1-208ENST00000466278 ITSN2Q9NZM3 1697 aa36.47■■■■□ 3.43
MKL1-208ENST00000466278 MADDQ8WXG6 1647 aa36.46■■■■□ 3.43
MKL1-208ENST00000466278 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa36.45■■■■□ 3.43
MKL1-208ENST00000466278 HECW2Q9P2P5 1572 aa36.45■■■■□ 3.43
MKL1-208ENST00000466278 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP36.44■■■■□ 3.42
MKL1-208ENST00000466278 PTPRMP28827 1452 aa36.43■■■■□ 3.42
MKL1-208ENST00000466278 AFAP1Q8N556 730 aa36.42■■■■□ 3.42
MKL1-208ENST00000466278 ATP10AO60312 1499 aa36.42■■■■□ 3.42
MKL1-208ENST00000466278 C9orf84Q5VXU9 1444 aa36.42■■■■□ 3.42
MKL1-208ENST00000466278 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa36.4■■■■□ 3.42
MKL1-208ENST00000466278 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.39■■■■□ 3.42
MKL1-208ENST00000466278 CCNB3Q8WWL7 1395 aa36.39■■■■□ 3.42
MKL1-208ENST00000466278 VPS8Q8N3P4 1428 aa36.37■■■■□ 3.41
MKL1-208ENST00000466278 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa36.37■■■■□ 3.41
MKL1-208ENST00000466278 MLH3Q9UHC1 1453 aa36.36■■■■□ 3.41
MKL1-208ENST00000466278 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP36.35■■■■□ 3.41
MKL1-208ENST00000466278 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa36.34■■■■□ 3.41
MKL1-208ENST00000466278 TIAM1Q13009 1591 aa36.32■■■■□ 3.41
MKL1-208ENST00000466278 MYT1LQ9UL68 1186 aa36.32■■■■□ 3.4
MKL1-208ENST00000466278 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP36.32■■■■□ 3.4
MKL1-208ENST00000466278 SYCP2Q9BX26 1530 aa36.32■■■■□ 3.4
MKL1-208ENST00000466278 ABCA6Q8N139 1617 aa36.3■■■■□ 3.4
MKL1-208ENST00000466278 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP36.3■■■■□ 3.4
MKL1-208ENST00000466278 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa36.3■■■■□ 3.4
MKL1-208ENST00000466278 REREQ9P2R6 1566 aa36.29■■■■□ 3.4
MKL1-208ENST00000466278 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa36.27■■■■□ 3.4
MKL1-208ENST00000466278 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa36.25■■■■□ 3.39
MKL1-208ENST00000466278 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP36.25■■■■□ 3.39
MKL1-208ENST00000466278 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa36.25■■■■□ 3.39
MKL1-208ENST00000466278 MLECQ14165 292 aa36.23■■■■□ 3.39
MKL1-208ENST00000466278 NCOA2Q15596 1464 aa36.18■■■■□ 3.38
MKL1-208ENST00000466278 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP36.17■■■■□ 3.384e-7■■■■□ 22.9
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MKL1-208ENST00000466278 MAP3K1Q13233 1512 aa36.14■■■■□ 3.38
MKL1-208ENST00000466278 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP36.13■■■■□ 3.37
MKL1-208ENST00000466278 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa36.13■■■■□ 3.37
MKL1-208ENST00000466278 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP36.12■■■■□ 3.37
MKL1-208ENST00000466278 ATP7AQ04656 1500 aa36.12■■■■□ 3.37
MKL1-208ENST00000466278 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP36.07■■■■□ 3.36
MKL1-208ENST00000466278 MBD5Q9P267 1494 aa36.05■■■■□ 3.36
MKL1-208ENST00000466278 PLPPR3Q6T4P5 718 aa36.02■■■■□ 3.36
MKL1-208ENST00000466278 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa36.02■■■■□ 3.36
MKL1-208ENST00000466278 LMTK3Q96Q04 1460 aa36.02■■■■□ 3.36
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MKL1-208ENST00000466278 A2MP01023 1474 aa35.95■■■■□ 3.35
MKL1-208ENST00000466278 CCDC141Q6ZP82 1450 aa35.95■■■■□ 3.35
MKL1-208ENST00000466278 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP35.94■■■■□ 3.34
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MKL1-208ENST00000466278 ARHGEF5Q12774 1597 aa35.89■■■■□ 3.34
MKL1-208ENST00000466278 CNTLNQ9NXG0 1405 aa35.89■■■■□ 3.34
MKL1-208ENST00000466278 APLP2Q06481 763 aa35.88■■■■□ 3.33
MKL1-208ENST00000466278 RSPH4AQ5TD94 716 aa35.88■■■■□ 3.33
MKL1-208ENST00000466278 C3P01024 1663 aa35.87■■■■□ 3.33
MKL1-208ENST00000466278 PREX1Q8TCU6 1659 aa35.87■■■■□ 3.33
MKL1-208ENST00000466278 MYOM3Q5VTT5 1437 aa35.85■■■■□ 3.33
MKL1-208ENST00000466278 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP35.85■■■■□ 3.33
MKL1-208ENST00000466278 MIA2Q96PC5 1412 aa35.83■■■■□ 3.33
MKL1-208ENST00000466278 MROH2AA6NES4 1674 aa35.81■■■■□ 3.32
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MKL1-208ENST00000466278 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP35.75■■■■□ 3.31
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MKL1-208ENST00000466278 TSPY10P0CW01 314 aa35.72■■■■□ 3.31
MKL1-208ENST00000466278 MAST1Q9Y2H9 1570 aa35.71■■■■□ 3.31
MKL1-208ENST00000466278 GGT6Q6P531 493 aa35.69■■■■□ 3.3
MKL1-208ENST00000466278 PPP6R1Q9UPN7 881 aa35.67■■■■□ 3.3
MKL1-208ENST00000466278 ZMYM3Q14202 1370 aa35.66■■■■□ 3.3
MKL1-208ENST00000466278 NPATQ14207 1427 aa35.65■■■■□ 3.3
MKL1-208ENST00000466278 PTPN23Q9H3S7 1636 aa35.64■■■■□ 3.3
MKL1-208ENST00000466278 FAM135AQ9P2D6 1515 aa35.6■■■■□ 3.29
MKL1-208ENST00000466278 KIF3BO15066 747 aa35.59■■■■□ 3.29
MKL1-208ENST00000466278 FGD6Q6ZV73 1430 aa35.58■■■■□ 3.29
MKL1-208ENST00000466278 CROCC2H7BZ55 1655 aa35.57■■■■□ 3.28
MKL1-208ENST00000466278 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP35.54■■■■□ 3.28
MKL1-208ENST00000466278 SHANK2Q9UPX8 1470 aa35.54■■■■□ 3.28
MKL1-208ENST00000466278 KDM5DQ9BY66 1539 aa35.54■■■■□ 3.28
MKL1-208ENST00000466278 PTPRKQ15262 1439 aa35.52■■■■□ 3.28
MKL1-208ENST00000466278 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP35.51■■■■□ 3.28
MKL1-208ENST00000466278 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP35.5■■■■□ 3.27
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