RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464543.1

CCZ1B-205, Transcript of CCZ1 homolog B, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, human

TSL 2

Gene CCZ1B, Length 748 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCZ1B-205	ENST00000464543	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		43.4	■■■■■ 4.54
CCZ1B-205	ENST00000464543	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		43.37	■■■■■ 4.53
CCZ1B-205	ENST00000464543	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		43.36	■■■■■ 4.53
CCZ1B-205	ENST00000464543	PREX2	Q70Z35	1606 aa		43.33	■■■■■ 4.53
CCZ1B-205	ENST00000464543	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		43.33	■■■■■ 4.53
CCZ1B-205	ENST00000464543	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		43.28	■■■■■ 4.52
CCZ1B-205	ENST00000464543	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		43.27	■■■■■ 4.52
CCZ1B-205	ENST00000464543	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		43.26	■■■■■ 4.52
CCZ1B-205	ENST00000464543	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		43.26	■■■■■ 4.52
CCZ1B-205	ENST00000464543	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		43.23	■■■■■ 4.51
CCZ1B-205	ENST00000464543	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		43.21	■■■■■ 4.51
CCZ1B-205	ENST00000464543	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		43.19	■■■■■ 4.5
CCZ1B-205	ENST00000464543	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	43.18	■■■■■ 4.5
CCZ1B-205	ENST00000464543	ABCC1	P33527	1531 aa		43.15	■■■■■ 4.5
CCZ1B-205	ENST00000464543	KDM5C	P41229	1560 aa		43.15	■■■■■ 4.5
CCZ1B-205	ENST00000464543	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		43.15	■■■■■ 4.5
CCZ1B-205	ENST00000464543	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		43.14	■■■■■ 4.5
CCZ1B-205	ENST00000464543	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	43.12	■■■■■ 4.49
CCZ1B-205	ENST00000464543	AFAP1	Q8N556	730 aa		43.1	■■■■■ 4.49
CCZ1B-205	ENST00000464543	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		43.09	■■■■■ 4.49
CCZ1B-205	ENST00000464543	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		43.09	■■■■■ 4.49
CCZ1B-205	ENST00000464543	MADD	Q8WXG6	1647 aa		43.08	■■■■■ 4.49
CCZ1B-205	ENST00000464543	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		43.07	■■■■■ 4.49
CCZ1B-205	ENST00000464543	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		43.04	■■■■■ 4.48
CCZ1B-205	ENST00000464543	ATP10A	O60312	1499 aa		43.03	■■■■■ 4.48
CCZ1B-205	ENST00000464543	PTPRM	P28827	1452 aa		43.03	■■■■■ 4.48
CCZ1B-205	ENST00000464543	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		43.03	■■■■■ 4.48
CCZ1B-205	ENST00000464543	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		43.03	■■■■■ 4.48
CCZ1B-205	ENST00000464543	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		43.02	■■■■■ 4.48
CCZ1B-205	ENST00000464543	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		43	■■■■■ 4.47
CCZ1B-205	ENST00000464543	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		42.99	■■■■■ 4.47
CCZ1B-205	ENST00000464543	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		42.96	■■■■■ 4.47
CCZ1B-205	ENST00000464543	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	42.96	■■■■■ 4.47
CCZ1B-205	ENST00000464543	TIAM1	Q13009	1591 aa		42.95	■■■■■ 4.47
CCZ1B-205	ENST00000464543	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		42.95	■■■■■ 4.47
CCZ1B-205	ENST00000464543	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		42.93	■■■■■ 4.46
CCZ1B-205	ENST00000464543	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	42.92	■■■■■ 4.46
CCZ1B-205	ENST00000464543	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	42.92	■■■■■ 4.46
CCZ1B-205	ENST00000464543	ABCA6	Q8N139	1617 aa		42.92	■■■■■ 4.46
CCZ1B-205	ENST00000464543	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		42.9	■■■■■ 4.46
CCZ1B-205	ENST00000464543	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		42.85	■■■■■ 4.45
CCZ1B-205	ENST00000464543	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		42.85	■■■■■ 4.45
CCZ1B-205	ENST00000464543	RERE	Q9P2R6	1566 aa		42.85	■■■■■ 4.45
CCZ1B-205	ENST00000464543	MLEC	Q14165	292 aa		42.84	■■■■■ 4.45
CCZ1B-205	ENST00000464543	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		42.84	■■■■■ 4.45
CCZ1B-205	ENST00000464543	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	42.83	■■■■■ 4.45
CCZ1B-205	ENST00000464543	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	42.81	■■■■■ 4.44
CCZ1B-205	ENST00000464543	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		42.8	■■■■■ 4.44
CCZ1B-205	ENST00000464543	NCOA2	Q15596	1464 aa		42.8	■■■■■ 4.44
CCZ1B-205	ENST00000464543	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		42.74	■■■■■ 4.43
CCZ1B-205	ENST00000464543	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	42.72	■■■■■ 4.43
CCZ1B-205	ENST00000464543	MAP3K1	Q13233	1512 aa		42.72	■■■■■ 4.43
CCZ1B-205	ENST00000464543	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	42.71	■■■■■ 4.43
CCZ1B-205	ENST00000464543	AGL	P35573	1532 aa		42.69	■■■■■ 4.42
CCZ1B-205	ENST00000464543	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	42.69	■■■■■ 4.42
CCZ1B-205	ENST00000464543	ATP7A	Q04656	1500 aa		42.67	■■■■■ 4.42
CCZ1B-205	ENST00000464543	MBD5	Q9P267	1494 aa		42.65	■■■■■ 4.42
CCZ1B-205	ENST00000464543	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	42.6	■■■■■ 4.41
CCZ1B-205	ENST00000464543	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		42.59	■■■■■ 4.41
CCZ1B-205	ENST00000464543	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		42.58	■■■■■ 4.41
CCZ1B-205	ENST00000464543	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		42.55	■■■■■ 4.4
CCZ1B-205	ENST00000464543	PLXNC1	O60486	1568 aa		42.51	■■■■■ 4.4
CCZ1B-205	ENST00000464543	A2M	P01023	1474 aa		42.48	■■■■■ 4.39
CCZ1B-205	ENST00000464543	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		42.47	■■■■■ 4.39
CCZ1B-205	ENST00000464543	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		42.45	■■■■■ 4.39
CCZ1B-205	ENST00000464543	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		42.45	■■■■■ 4.39
CCZ1B-205	ENST00000464543	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	42.43	■■■■■ 4.38
CCZ1B-205	ENST00000464543	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		42.41	■■■■■ 4.38
CCZ1B-205	ENST00000464543	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		42.39	■■■■■ 4.38
CCZ1B-205	ENST00000464543	APLP2	Q06481	763 aa		42.39	■■■■■ 4.38
CCZ1B-205	ENST00000464543	C3	P01024	1663 aa		42.38	■■■■■ 4.38
CCZ1B-205	ENST00000464543	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		42.37	■■■■■ 4.37
CCZ1B-205	ENST00000464543	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	42.36	■■■■■ 4.37
CCZ1B-205	ENST00000464543	MIA2	Q96PC5	1412 aa		42.34	■■■■■ 4.37
CCZ1B-205	ENST00000464543	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		42.34	■■■■■ 4.37
CCZ1B-205	ENST00000464543	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		42.33	■■■■■ 4.37
CCZ1B-205	ENST00000464543	HSPA2	P54652	639 aa		42.28	■■■■■ 4.36
CCZ1B-205	ENST00000464543	MROH2A	A6NES4	1674 aa		42.28	■■■■■ 4.36
CCZ1B-205	ENST00000464543	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	42.27	■■■■■ 4.36
CCZ1B-205	ENST00000464543	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	42.24	■■■■■ 4.35
CCZ1B-205	ENST00000464543	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	42.22	■■■■■ 4.35
CCZ1B-205	ENST00000464543	TSPY4	P0CV99	314 aa		42.21	■■■■■ 4.35
CCZ1B-205	ENST00000464543	TSPY10	P0CW01	314 aa		42.21	■■■■■ 4.35
CCZ1B-205	ENST00000464543	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		42.2	■■■■■ 4.35
CCZ1B-205	ENST00000464543	GGT6	Q6P531	493 aa		42.2	■■■■■ 4.35
CCZ1B-205	ENST00000464543	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		42.17	■■■■■ 4.34
CCZ1B-205	ENST00000464543	ZMYM3	Q14202	1370 aa		42.14	■■■■■ 4.34
CCZ1B-205	ENST00000464543	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		42.14	■■■■■ 4.34
CCZ1B-205	ENST00000464543	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		42.11	■■■■■ 4.33
CCZ1B-205	ENST00000464543	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		42.09	■■■■■ 4.33
CCZ1B-205	ENST00000464543	KIF3B	O15066	747 aa		42.08	■■■■■ 4.33
CCZ1B-205	ENST00000464543	NPAT	Q14207	1427 aa		42.08	■■■■■ 4.33
CCZ1B-205	ENST00000464543	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		42.04	■■■■■ 4.32
CCZ1B-205	ENST00000464543	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	42.04	■■■■■ 4.32
CCZ1B-205	ENST00000464543	ABCC5	O15440	1437 aa		42	■■■■■ 4.31
CCZ1B-205	ENST00000464543	PTPRK	Q15262	1439 aa		41.99	■■■■■ 4.31
CCZ1B-205	ENST00000464543	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		41.98	■■■■■ 4.31
CCZ1B-205	ENST00000464543	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		41.98	■■■■■ 4.31
CCZ1B-205	ENST00000464543	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	41.97	■■■■■ 4.31
CCZ1B-205	ENST00000464543	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		41.96	■■■■■ 4.31

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