RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464280.5

NISCH-204, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 3

Gene NISCH, Length 833 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-204ENST00000464280 ADGRL1O94910 1474 aa18.52■□□□□ 0.56
NISCH-204ENST00000464280 RAPGEF3O95398 923 aa18.52■□□□□ 0.56
NISCH-204ENST00000464280 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa18.52■□□□□ 0.56
NISCH-204ENST00000464280 TIAM1Q13009 1591 aa18.5■□□□□ 0.55
NISCH-204ENST00000464280 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
NISCH-204ENST00000464280 SCAPERQ9BY12 1400 aa18.48■□□□□ 0.55
NISCH-204ENST00000464280 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
NISCH-204ENST00000464280 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa18.47■□□□□ 0.55
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NISCH-204ENST00000464280 POGZQ7Z3K3 1410 aa18.45■□□□□ 0.54
NISCH-204ENST00000464280 MAP3K1Q13233 1512 aa18.44■□□□□ 0.54
NISCH-204ENST00000464280 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa18.44■□□□□ 0.54
NISCH-204ENST00000464280 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
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NISCH-204ENST00000464280 MAGI2Q86UL8 1455 aa18.43■□□□□ 0.54
NISCH-204ENST00000464280 ABCC1P33527 1531 aa18.43■□□□□ 0.54
NISCH-204ENST00000464280 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa18.41■□□□□ 0.54
NISCH-204ENST00000464280 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa18.4■□□□□ 0.54
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NISCH-204ENST00000464280 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa18.39■□□□□ 0.54
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NISCH-204ENST00000464280 NCOA2Q15596 1464 aa18.37■□□□□ 0.53
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NISCH-204ENST00000464280 BCORL1Q5H9F3 1711 aa18.35■□□□□ 0.53
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NISCH-204ENST00000464280 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa18.34■□□□□ 0.53
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NISCH-204ENST00000464280 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa18.32■□□□□ 0.52
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NISCH-204ENST00000464280 ADAMTSL3P82987 1691 aa18.31■□□□□ 0.52
NISCH-204ENST00000464280 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
NISCH-204ENST00000464280 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa18.29■□□□□ 0.52
NISCH-204ENST00000464280 ABCA6Q8N139 1617 aa18.29■□□□□ 0.52
NISCH-204ENST00000464280 C9orf84Q5VXU9 1444 aa18.29■□□□□ 0.52
NISCH-204ENST00000464280 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa18.29■□□□□ 0.52
NISCH-204ENST00000464280 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP18.28■□□□□ 0.52
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NISCH-204ENST00000464280 MADDQ8WXG6 1647 aa18.24■□□□□ 0.51
NISCH-204ENST00000464280 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
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NISCH-204ENST00000464280 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
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NISCH-204ENST00000464280 CCDC141Q6ZP82 1450 aa18.19■□□□□ 0.5
NISCH-204ENST00000464280 AGLP35573 1532 aa18.18■□□□□ 0.5
NISCH-204ENST00000464280 PTPRMP28827 1452 aa18.17■□□□□ 0.5
NISCH-204ENST00000464280 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa18.16■□□□□ 0.5
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NISCH-204ENST00000464280 PTPN23Q9H3S7 1636 aa18.16■□□□□ 0.5
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NISCH-204ENST00000464280 TSPY10P0CW01 314 aa18.12■□□□□ 0.49
NISCH-204ENST00000464280 A2MP01023 1474 aa18.12■□□□□ 0.49
NISCH-204ENST00000464280 MAST1Q9Y2H9 1570 aa18.11■□□□□ 0.49
NISCH-204ENST00000464280 CROCC2H7BZ55 1655 aa18.11■□□□□ 0.49
NISCH-204ENST00000464280 FGD6Q6ZV73 1430 aa18.1■□□□□ 0.49
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NISCH-204ENST00000464280 SHANK2Q9UPX8 1470 aa18.02■□□□□ 0.48
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NISCH-204ENST00000464280 DAPK1P53355 1430 aa18■□□□□ 0.47
NISCH-204ENST00000464280 PLPPR3Q6T4P5 718 aa18■□□□□ 0.47
NISCH-204ENST00000464280 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
NISCH-204ENST00000464280 PREX1Q8TCU6 1659 aa17.99■□□□□ 0.47
NISCH-204ENST00000464280 PPP6R1Q9UPN7 881 aa17.99■□□□□ 0.47
NISCH-204ENST00000464280 GGT6Q6P531 493 aa17.98■□□□□ 0.47
NISCH-204ENST00000464280 DUOX2Q9NRD8 1548 aa17.97■□□□□ 0.47
NISCH-204ENST00000464280 KIF3BO15066 747 aa17.96■□□□□ 0.47
NISCH-204ENST00000464280 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
NISCH-204ENST00000464280 FAM135AQ9P2D6 1515 aa17.96■□□□□ 0.47
NISCH-204ENST00000464280 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
NISCH-204ENST00000464280 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
NISCH-204ENST00000464280 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
NISCH-204ENST00000464280 LMTK3Q96Q04 1460 aa17.94■□□□□ 0.46
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