RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461758.6

TLE4-213, Transcript of transducin like enhancer of split 4, human

TSL 5

Gene TLE4, Length 1,536 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TLE4-213	ENST00000461758	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		42.44	■■■■■ 4.38
TLE4-213	ENST00000461758	FANCA	O15360	1455 aa		42.43	■■■■■ 4.38
TLE4-213	ENST00000461758	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		42.43	■■■■■ 4.38
TLE4-213	ENST00000461758	PREX2	Q70Z35	1606 aa		42.42	■■■■■ 4.38
TLE4-213	ENST00000461758	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		42.41	■■■■■ 4.38
TLE4-213	ENST00000461758	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		42.41	■■■■■ 4.38
TLE4-213	ENST00000461758	NEO1	Q92859	1461 aa		42.39	■■■■■ 4.38
TLE4-213	ENST00000461758	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		42.37	■■■■■ 4.37
TLE4-213	ENST00000461758	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		42.37	■■■■■ 4.37
TLE4-213	ENST00000461758	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		42.37	■■■■■ 4.37
TLE4-213	ENST00000461758	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	42.35	■■■■■ 4.37
TLE4-213	ENST00000461758	AKNA	Q7Z591	1439 aa		42.32	■■■■■ 4.36
TLE4-213	ENST00000461758	MIA2	Q96PC5	1412 aa		42.3	■■■■■ 4.36
TLE4-213	ENST00000461758	ADGRL1	O94910	1474 aa		42.21	■■■■■ 4.35
TLE4-213	ENST00000461758	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		42.2	■■■■■ 4.35
TLE4-213	ENST00000461758	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		42.2	■■■■■ 4.35
TLE4-213	ENST00000461758	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		42.17	■■■■■ 4.34
TLE4-213	ENST00000461758	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	42.16	■■■■■ 4.34
TLE4-213	ENST00000461758	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		42.15	■■■■■ 4.34
TLE4-213	ENST00000461758	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		42.13	■■■■■ 4.33
TLE4-213	ENST00000461758	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		42.13	■■■■■ 4.33
TLE4-213	ENST00000461758	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	42.12	■■■■■ 4.33
TLE4-213	ENST00000461758	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		42.11	■■■■■ 4.33
TLE4-213	ENST00000461758	ABCC1	P33527	1531 aa		42.1	■■■■■ 4.33
TLE4-213	ENST00000461758	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	42.08	■■■■■ 4.33
TLE4-213	ENST00000461758	RICTOR	Q6R327	1708 aa		42.08	■■■■■ 4.33
TLE4-213	ENST00000461758	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		42.08	■■■■■ 4.33
TLE4-213	ENST00000461758	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		42.05	■■■■■ 4.32
TLE4-213	ENST00000461758	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	42.05	■■■■■ 4.32
TLE4-213	ENST00000461758	RAPGEF3	O95398	923 aa		42.04	■■■■■ 4.32
TLE4-213	ENST00000461758	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		42.03	■■■■■ 4.32
TLE4-213	ENST00000461758	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	42.03	■■■■■ 4.32
TLE4-213	ENST00000461758	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		42	■■■■■ 4.31
TLE4-213	ENST00000461758	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		42	■■■■■ 4.31
TLE4-213	ENST00000461758	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		42	■■■■■ 4.31
TLE4-213	ENST00000461758	AFAP1	Q8N556	730 aa		41.97	■■■■■ 4.31
TLE4-213	ENST00000461758	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	41.97	■■■■■ 4.31
TLE4-213	ENST00000461758	MBD5	Q9P267	1494 aa		41.96	■■■■■ 4.31
TLE4-213	ENST00000461758	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		41.96	■■■■■ 4.31
TLE4-213	ENST00000461758	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	41.94	■■■■■ 4.3
TLE4-213	ENST00000461758	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	41.93	■■■■■ 4.3
TLE4-213	ENST00000461758	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		41.9	■■■■■ 4.3
TLE4-213	ENST00000461758	TSPY4	P0CV99	314 aa		41.9	■■■■■ 4.3
TLE4-213	ENST00000461758	TSPY10	P0CW01	314 aa		41.9	■■■■■ 4.3
TLE4-213	ENST00000461758	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		41.9	■■■■■ 4.3
TLE4-213	ENST00000461758	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		41.88	■■■■■ 4.29
TLE4-213	ENST00000461758	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		41.88	■■■■■ 4.29
TLE4-213	ENST00000461758	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	41.85	■■■■■ 4.29
TLE4-213	ENST00000461758	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		41.85	■■■■■ 4.29
TLE4-213	ENST00000461758	KDM5C	P41229	1560 aa		41.83	■■■■■ 4.29
TLE4-213	ENST00000461758	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		41.81	■■■■■ 4.28
TLE4-213	ENST00000461758	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		41.79	■■■■■ 4.28
TLE4-213	ENST00000461758	DAPK1	P53355	1430 aa		41.78	■■■■■ 4.28
TLE4-213	ENST00000461758	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	41.77	■■■■■ 4.28
TLE4-213	ENST00000461758	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		41.77	■■■■■ 4.28
TLE4-213	ENST00000461758	ABCC5	O15440	1437 aa		41.77	■■■■■ 4.28
TLE4-213	ENST00000461758	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		41.73	■■■■■ 4.27
TLE4-213	ENST00000461758	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		41.72	■■■■■ 4.27
TLE4-213	ENST00000461758	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		41.72	■■■■■ 4.27
TLE4-213	ENST00000461758	ITGAE	P38570	1179 aa		41.71	■■■■■ 4.27
TLE4-213	ENST00000461758	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		41.7	■■■■■ 4.27
TLE4-213	ENST00000461758	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		41.69	■■■■■ 4.26
TLE4-213	ENST00000461758	ATP7A	Q04656	1500 aa		41.67	■■■■■ 4.26
TLE4-213	ENST00000461758	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		41.67	■■■■■ 4.26
TLE4-213	ENST00000461758	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		41.64	■■■■■ 4.26
TLE4-213	ENST00000461758	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		41.64	■■■■■ 4.26
TLE4-213	ENST00000461758	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		41.64	■■■■■ 4.26
TLE4-213	ENST00000461758	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	41.63	■■■■■ 4.25
TLE4-213	ENST00000461758	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		41.62	■■■■■ 4.25
TLE4-213	ENST00000461758	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		41.61	■■■■■ 4.25
TLE4-213	ENST00000461758	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		41.58	■■■■■ 4.25
TLE4-213	ENST00000461758	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		41.57	■■■■■ 4.25
TLE4-213	ENST00000461758	ATP10A	O60312	1499 aa		41.56	■■■■■ 4.24
TLE4-213	ENST00000461758	PTPRK	Q15262	1439 aa		41.55	■■■■■ 4.24
TLE4-213	ENST00000461758	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		41.53	■■■■■ 4.24
TLE4-213	ENST00000461758	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		41.51	■■■■■ 4.24
TLE4-213	ENST00000461758	ABCA6	Q8N139	1617 aa		41.5	■■■■■ 4.23
TLE4-213	ENST00000461758	ADGRL2	O95490	1459 aa		41.5	■■■■■ 4.23
TLE4-213	ENST00000461758	NCOA1	Q15788	1441 aa		41.49	■■■■■ 4.23
TLE4-213	ENST00000461758	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		41.49	■■■■■ 4.23
TLE4-213	ENST00000461758	ROCK1	Q13464	1354 aa		41.49	■■■■■ 4.23
TLE4-213	ENST00000461758	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	41.48	■■■■■ 4.23
TLE4-213	ENST00000461758	PLXNC1	O60486	1568 aa		41.48	■■■■■ 4.23
TLE4-213	ENST00000461758	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		41.46	■■■■■ 4.23
TLE4-213	ENST00000461758	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	41.46	■■■■■ 4.23
TLE4-213	ENST00000461758	KIF15	Q9NS87	1388 aa		41.45	■■■■■ 4.23
TLE4-213	ENST00000461758	A2M	P01023	1474 aa		41.44	■■■■■ 4.22
TLE4-213	ENST00000461758	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	41.42	■■■■■ 4.22
TLE4-213	ENST00000461758	MADD	Q8WXG6	1647 aa		41.42	■■■■■ 4.22
TLE4-213	ENST00000461758	RERE	Q9P2R6	1566 aa		41.39	■■■■■ 4.22
TLE4-213	ENST00000461758	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		41.37	■■■■■ 4.21
TLE4-213	ENST00000461758	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	41.32	■■■■■ 4.2
TLE4-213	ENST00000461758	AGL	P35573	1532 aa		41.28	■■■■■ 4.2
TLE4-213	ENST00000461758	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		41.28	■■■■■ 4.2
TLE4-213	ENST00000461758	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		41.28	■■■■■ 4.2
TLE4-213	ENST00000461758	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		41.26	■■■■■ 4.19
TLE4-213	ENST00000461758	PTPRM	P28827	1452 aa		41.25	■■■■■ 4.19
TLE4-213	ENST00000461758	KIF3B	O15066	747 aa		41.25	■■■■■ 4.19
TLE4-213	ENST00000461758	HFM1	A2PYH4	1435 aa		41.24	■■■■■ 4.19
TLE4-213	ENST00000461758	MLEC	Q14165	292 aa		41.22	■■■■■ 4.19

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.9 ms