RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461142.3

UBE2J2-209, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 J2, human

TSL 3

Gene UBE2J2, Length 837 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE2J2-209	ENST00000461142	KDM6B	O15054	1643 aa		34.14	■■■■□ 3.06
UBE2J2-209	ENST00000461142	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	34.14	■■■■□ 3.06
UBE2J2-209	ENST00000461142	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		34.11	■■■■□ 3.05
UBE2J2-209	ENST00000461142	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		34.1	■■■■□ 3.05
UBE2J2-209	ENST00000461142	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	34.07	■■■■□ 3.04
UBE2J2-209	ENST00000461142	AKNA	Q7Z591	1439 aa		34.05	■■■■□ 3.04
UBE2J2-209	ENST00000461142	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		34.04	■■■■□ 3.04
UBE2J2-209	ENST00000461142	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		34.02	■■■■□ 3.04
UBE2J2-209	ENST00000461142	ADGRL1	O94910	1474 aa		34	■■■■□ 3.03
UBE2J2-209	ENST00000461142	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		33.98	■■■■□ 3.03
UBE2J2-209	ENST00000461142	ABCC1	P33527	1531 aa		33.96	■■■■□ 3.03
UBE2J2-209	ENST00000461142	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		33.95	■■■■□ 3.03
UBE2J2-209	ENST00000461142	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	33.95	■■■■□ 3.03
UBE2J2-209	ENST00000461142	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		33.94	■■■■□ 3.02
UBE2J2-209	ENST00000461142	RICTOR	Q6R327	1708 aa		33.92	■■■■□ 3.02
UBE2J2-209	ENST00000461142	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	33.91	■■■■□ 3.02
UBE2J2-209	ENST00000461142	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		33.91	■■■■□ 3.02
UBE2J2-209	ENST00000461142	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	33.9	■■■■□ 3.02
UBE2J2-209	ENST00000461142	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	33.89	■■■■□ 3.02
UBE2J2-209	ENST00000461142	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		33.88	■■■■□ 3.01
UBE2J2-209	ENST00000461142	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		33.88	■■■■□ 3.01
UBE2J2-209	ENST00000461142	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		33.88	■■■■□ 3.01
UBE2J2-209	ENST00000461142	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		33.85	■■■■□ 3.01
UBE2J2-209	ENST00000461142	RAPGEF3	O95398	923 aa		33.85	■■■■□ 3.01
UBE2J2-209	ENST00000461142	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		33.84	■■■■□ 3.01
UBE2J2-209	ENST00000461142	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	33.83	■■■■□ 3.01
UBE2J2-209	ENST00000461142	MIA2	Q96PC5	1412 aa		33.83	■■■■□ 3.01
UBE2J2-209	ENST00000461142	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		33.79	■■■■□ 3
UBE2J2-209	ENST00000461142	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		33.79	■■■■□ 3
UBE2J2-209	ENST00000461142	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		33.79	■■■■□ 3
UBE2J2-209	ENST00000461142	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		33.79	■■■■□ 3
UBE2J2-209	ENST00000461142	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		33.79	■■■■□ 3
UBE2J2-209	ENST00000461142	KDM5C	P41229	1560 aa		33.77	■■■■□ 3
UBE2J2-209	ENST00000461142	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		33.77	■■■■□ 3
UBE2J2-209	ENST00000461142	MBD5	Q9P267	1494 aa		33.73	■■■□□ 2.99
UBE2J2-209	ENST00000461142	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	33.72	■■■□□ 2.99	3e-8	■■■■□ 20.7
UBE2J2-209	ENST00000461142	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	33.7	■■■□□ 2.99
UBE2J2-209	ENST00000461142	AFAP1	Q8N556	730 aa		33.7	■■■□□ 2.99
UBE2J2-209	ENST00000461142	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		33.69	■■■□□ 2.98
UBE2J2-209	ENST00000461142	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		33.68	■■■□□ 2.98
UBE2J2-209	ENST00000461142	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		33.68	■■■□□ 2.98
UBE2J2-209	ENST00000461142	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		33.65	■■■□□ 2.98
UBE2J2-209	ENST00000461142	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		33.65	■■■□□ 2.98
UBE2J2-209	ENST00000461142	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		33.63	■■■□□ 2.97
UBE2J2-209	ENST00000461142	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		33.62	■■■□□ 2.97
UBE2J2-209	ENST00000461142	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	33.61	■■■□□ 2.97
UBE2J2-209	ENST00000461142	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		33.61	■■■□□ 2.97
UBE2J2-209	ENST00000461142	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		33.6	■■■□□ 2.97
UBE2J2-209	ENST00000461142	ABCA6	Q8N139	1617 aa		33.57	■■■□□ 2.97
UBE2J2-209	ENST00000461142	ATP7A	Q04656	1500 aa		33.57	■■■□□ 2.96
UBE2J2-209	ENST00000461142	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		33.56	■■■□□ 2.96
UBE2J2-209	ENST00000461142	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	33.56	■■■□□ 2.96
UBE2J2-209	ENST00000461142	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		33.55	■■■□□ 2.96
UBE2J2-209	ENST00000461142	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	33.55	■■■□□ 2.96
UBE2J2-209	ENST00000461142	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	33.52	■■■□□ 2.96
UBE2J2-209	ENST00000461142	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	33.51	■■■□□ 2.95
UBE2J2-209	ENST00000461142	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		33.5	■■■□□ 2.95
UBE2J2-209	ENST00000461142	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		33.5	■■■□□ 2.95
UBE2J2-209	ENST00000461142	ABCC5	O15440	1437 aa		33.5	■■■□□ 2.95
UBE2J2-209	ENST00000461142	DAPK1	P53355	1430 aa		33.5	■■■□□ 2.95
UBE2J2-209	ENST00000461142	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		33.5	■■■□□ 2.95
UBE2J2-209	ENST00000461142	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		33.47	■■■□□ 2.95
UBE2J2-209	ENST00000461142	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		33.46	■■■□□ 2.95
UBE2J2-209	ENST00000461142	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		33.46	■■■□□ 2.95
UBE2J2-209	ENST00000461142	ATP10A	O60312	1499 aa		33.46	■■■□□ 2.95
UBE2J2-209	ENST00000461142	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		33.46	■■■□□ 2.95
UBE2J2-209	ENST00000461142	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	33.42	■■■□□ 2.94	1e-7	■□□□□ 8.6
UBE2J2-209	ENST00000461142	RERE	Q9P2R6	1566 aa		33.42	■■■□□ 2.94
UBE2J2-209	ENST00000461142	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		33.42	■■■□□ 2.94
UBE2J2-209	ENST00000461142	TSPY4	P0CV99	314 aa		33.4	■■■□□ 2.94
UBE2J2-209	ENST00000461142	TSPY10	P0CW01	314 aa		33.4	■■■□□ 2.94
UBE2J2-209	ENST00000461142	PLXNC1	O60486	1568 aa		33.38	■■■□□ 2.93
UBE2J2-209	ENST00000461142	A2M	P01023	1474 aa		33.33	■■■□□ 2.93
UBE2J2-209	ENST00000461142	PTPRK	Q15262	1439 aa		33.33	■■■□□ 2.93
UBE2J2-209	ENST00000461142	ADGRL2	O95490	1459 aa		33.29	■■■□□ 2.92
UBE2J2-209	ENST00000461142	AGL	P35573	1532 aa		33.28	■■■□□ 2.92
UBE2J2-209	ENST00000461142	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	33.28	■■■□□ 2.92
UBE2J2-209	ENST00000461142	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		33.27	■■■□□ 2.92
UBE2J2-209	ENST00000461142	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		33.26	■■■□□ 2.92
UBE2J2-209	ENST00000461142	ITGAE	P38570	1179 aa		33.25	■■■□□ 2.91
UBE2J2-209	ENST00000461142	KIF15	Q9NS87	1388 aa		33.24	■■■□□ 2.91
UBE2J2-209	ENST00000461142	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	33.22	■■■□□ 2.91
UBE2J2-209	ENST00000461142	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		33.22	■■■□□ 2.91
UBE2J2-209	ENST00000461142	NCOA1	Q15788	1441 aa		33.22	■■■□□ 2.91
UBE2J2-209	ENST00000461142	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		33.22	■■■□□ 2.91
UBE2J2-209	ENST00000461142	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		33.18	■■■□□ 2.9
UBE2J2-209	ENST00000461142	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		33.17	■■■□□ 2.9
UBE2J2-209	ENST00000461142	ROCK1	Q13464	1354 aa		33.16	■■■□□ 2.9
UBE2J2-209	ENST00000461142	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	33.14	■■■□□ 2.9
UBE2J2-209	ENST00000461142	MLEC	Q14165	292 aa		33.13	■■■□□ 2.89
UBE2J2-209	ENST00000461142	MADD	Q8WXG6	1647 aa		33.13	■■■□□ 2.89
UBE2J2-209	ENST00000461142	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		33.12	■■■□□ 2.89
UBE2J2-209	ENST00000461142	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		33.11	■■■□□ 2.89
UBE2J2-209	ENST00000461142	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		33.09	■■■□□ 2.89
UBE2J2-209	ENST00000461142	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	33.08	■■■□□ 2.89
UBE2J2-209	ENST00000461142	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	33.04	■■■□□ 2.88
UBE2J2-209	ENST00000461142	KIF3B	O15066	747 aa		33.04	■■■□□ 2.88
UBE2J2-209	ENST00000461142	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		33.02	■■■□□ 2.88
UBE2J2-209	ENST00000461142	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		33.02	■■■□□ 2.88
UBE2J2-209	ENST00000461142	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		33.02	■■■□□ 2.88

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