RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460944.6

DDR1-241, Transcript of discoidin domain receptor tyrosine kinase 1, humanhuman

TSL 5

Gene DDR1, Length 1,248 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1-241ENST00000460944 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.95■■■□□ 2.23
DDR1-241ENST00000460944 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
DDR1-241ENST00000460944 ADGRL1O94910 1474 aa28.91■■■□□ 2.22
DDR1-241ENST00000460944 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.91■■■□□ 2.22
DDR1-241ENST00000460944 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.91■■■□□ 2.22
DDR1-241ENST00000460944 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
DDR1-241ENST00000460944 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
DDR1-241ENST00000460944 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28.86■■■□□ 2.21
DDR1-241ENST00000460944 RAPGEF3O95398 923 aa28.86■■■□□ 2.21
DDR1-241ENST00000460944 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.86■■■□□ 2.21
DDR1-241ENST00000460944 RICTORQ6R327 1708 aa28.85■■■□□ 2.21
DDR1-241ENST00000460944 NCOA2Q15596 1464 aa28.85■■■□□ 2.21
DDR1-241ENST00000460944 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa28.84■■■□□ 2.21
DDR1-241ENST00000460944 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
DDR1-241ENST00000460944 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
DDR1-241ENST00000460944 POGZQ7Z3K3 1410 aa28.8■■■□□ 2.2
DDR1-241ENST00000460944 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
DDR1-241ENST00000460944 ABCC1P33527 1531 aa28.79■■■□□ 2.2
DDR1-241ENST00000460944 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa28.75■■■□□ 2.19
DDR1-241ENST00000460944 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.75■■■□□ 2.19
DDR1-241ENST00000460944 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28.74■■■□□ 2.19
DDR1-241ENST00000460944 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa28.73■■■□□ 2.19
DDR1-241ENST00000460944 SYCP2Q9BX26 1530 aa28.69■■■□□ 2.18
DDR1-241ENST00000460944 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.69■■■□□ 2.18
DDR1-241ENST00000460944 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.69■■■□□ 2.18
DDR1-241ENST00000460944 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.69■■■□□ 2.18
DDR1-241ENST00000460944 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.68■■■□□ 2.18
DDR1-241ENST00000460944 KDM5CP41229 1560 aa28.67■■■□□ 2.18
DDR1-241ENST00000460944 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa28.67■■■□□ 2.18
DDR1-241ENST00000460944 AFAP1Q8N556 730 aa28.65■■■□□ 2.18
DDR1-241ENST00000460944 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa28.65■■■□□ 2.18
DDR1-241ENST00000460944 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.63■■■□□ 2.17
DDR1-241ENST00000460944 MYT1LQ9UL68 1186 aa28.63■■■□□ 2.17
DDR1-241ENST00000460944 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.62■■■□□ 2.17
DDR1-241ENST00000460944 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa28.61■■■□□ 2.17
DDR1-241ENST00000460944 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP28.61■■■□□ 2.17
DDR1-241ENST00000460944 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
DDR1-241ENST00000460944 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.6■■■□□ 2.17
DDR1-241ENST00000460944 MIA2Q96PC5 1412 aa28.59■■■□□ 2.17
DDR1-241ENST00000460944 MLH3Q9UHC1 1453 aa28.58■■■□□ 2.17
DDR1-241ENST00000460944 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
DDR1-241ENST00000460944 MBD5Q9P267 1494 aa28.53■■■□□ 2.16
DDR1-241ENST00000460944 ATP10AO60312 1499 aa28.52■■■□□ 2.16
DDR1-241ENST00000460944 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
DDR1-241ENST00000460944 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa28.51■■■□□ 2.15
DDR1-241ENST00000460944 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.5■■■□□ 2.15
DDR1-241ENST00000460944 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.5■■■□□ 2.15
DDR1-241ENST00000460944 ABCA6Q8N139 1617 aa28.5■■■□□ 2.15
DDR1-241ENST00000460944 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa28.5■■■□□ 2.15
DDR1-241ENST00000460944 RSPH4AQ5TD94 716 aa28.49■■■□□ 2.15
DDR1-241ENST00000460944 ARHGEF5Q12774 1597 aa28.48■■■□□ 2.15
DDR1-241ENST00000460944 ATP7AQ04656 1500 aa28.48■■■□□ 2.15
DDR1-241ENST00000460944 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.47■■■□□ 2.15
DDR1-241ENST00000460944 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
DDR1-241ENST00000460944 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.47■■■□□ 2.15
DDR1-241ENST00000460944 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.45■■■□□ 2.14
DDR1-241ENST00000460944 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
DDR1-241ENST00000460944 REREQ9P2R6 1566 aa28.42■■■□□ 2.14
DDR1-241ENST00000460944 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.42■■■□□ 2.14
DDR1-241ENST00000460944 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa28.4■■■□□ 2.14
DDR1-241ENST00000460944 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
DDR1-241ENST00000460944 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa28.4■■■□□ 2.14
DDR1-241ENST00000460944 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
DDR1-241ENST00000460944 TSPY4P0CV99 314 aa28.39■■■□□ 2.14
DDR1-241ENST00000460944 TSPY10P0CW01 314 aa28.39■■■□□ 2.14
DDR1-241ENST00000460944 ADAMTSL3P82987 1691 aa28.35■■■□□ 2.13
DDR1-241ENST00000460944 ADGBQ8N7X0 1667 aa28.35■■■□□ 2.13
DDR1-241ENST00000460944 AGLP35573 1532 aa28.33■■■□□ 2.13
DDR1-241ENST00000460944 MAST1Q9Y2H9 1570 aa28.33■■■□□ 2.12
DDR1-241ENST00000460944 A2MP01023 1474 aa28.32■■■□□ 2.12
DDR1-241ENST00000460944 MLECQ14165 292 aa28.31■■■□□ 2.12
DDR1-241ENST00000460944 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
DDR1-241ENST00000460944 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.31■■■□□ 2.12
DDR1-241ENST00000460944 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
DDR1-241ENST00000460944 MADDQ8WXG6 1647 aa28.29■■■□□ 2.12
DDR1-241ENST00000460944 PLXNC1O60486 1568 aa28.28■■■□□ 2.12
DDR1-241ENST00000460944 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.27■■■□□ 2.12
DDR1-241ENST00000460944 DAPK1P53355 1430 aa28.27■■■□□ 2.12
DDR1-241ENST00000460944 ABCC5O15440 1437 aa28.26■■■□□ 2.12
DDR1-241ENST00000460944 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa28.26■■■□□ 2.11
DDR1-241ENST00000460944 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
DDR1-241ENST00000460944 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
DDR1-241ENST00000460944 PTPRMP28827 1452 aa28.18■■■□□ 2.1
DDR1-241ENST00000460944 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
DDR1-241ENST00000460944 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.14■■■□□ 2.1
DDR1-241ENST00000460944 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa28.13■■■□□ 2.09
DDR1-241ENST00000460944 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.13■■■□□ 2.09
DDR1-241ENST00000460944 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.13■■■□□ 2.09
DDR1-241ENST00000460944 KIF15Q9NS87 1388 aa28.12■■■□□ 2.09
DDR1-241ENST00000460944 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
DDR1-241ENST00000460944 GGT6Q6P531 493 aa28.11■■■□□ 2.09
DDR1-241ENST00000460944 KIF3BO15066 747 aa28.1■■■□□ 2.09
DDR1-241ENST00000460944 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.09■■■□□ 2.09
DDR1-241ENST00000460944 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
DDR1-241ENST00000460944 CNTLNQ9NXG0 1405 aa28.09■■■□□ 2.09
DDR1-241ENST00000460944 ADGRL2O95490 1459 aa28.08■■■□□ 2.09
DDR1-241ENST00000460944 NCOA1Q15788 1441 aa28.05■■■□□ 2.08
DDR1-241ENST00000460944 PLPPR3Q6T4P5 718 aa28.05■■■□□ 2.08
DDR1-241ENST00000460944 ERBINQ96RT1 1412 aa28.05■■■□□ 2.08
DDR1-241ENST00000460944 PPP6R1Q9UPN7 881 aa28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.8 ms