RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460291.1

ATG7-216, Transcript of autophagy related 7, humanhuman

TSL 3

Gene ATG7, Length 951 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7-216ENST00000460291 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.09■■□□□ 1.29
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ATG7-216ENST00000460291 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.08■■□□□ 1.28
ATG7-216ENST00000460291 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.07■■□□□ 1.28
ATG7-216ENST00000460291 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.07■■□□□ 1.28
ATG7-216ENST00000460291 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
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ATG7-216ENST00000460291 AFAP1Q8N556 730 aa22.94■■□□□ 1.26
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ATG7-216ENST00000460291 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.86■■□□□ 1.25
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ATG7-216ENST00000460291 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
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ATG7-216ENST00000460291 PLXNC1O60486 1568 aa22.55■■□□□ 1.2
ATG7-216ENST00000460291 MROH2AA6NES4 1674 aa22.55■■□□□ 1.2
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ATG7-216ENST00000460291 NCOA2Q15596 1464 aa22.54■■□□□ 1.2
ATG7-216ENST00000460291 STRCQ7RTU9 1775 aa22.53■■□□□ 1.2
ATG7-216ENST00000460291 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.53■■□□□ 1.2
ATG7-216ENST00000460291 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.51■■□□□ 1.19
ATG7-216ENST00000460291 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.51■■□□□ 1.19
ATG7-216ENST00000460291 ZMYM3Q14202 1370 aa22.5■■□□□ 1.19
ATG7-216ENST00000460291 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.49■■□□□ 1.19
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ATG7-216ENST00000460291 NPATQ14207 1427 aa22.47■■□□□ 1.19
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ATG7-216ENST00000460291 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.45■■□□□ 1.18
ATG7-216ENST00000460291 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.44■■□□□ 1.18
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ATG7-216ENST00000460291 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.39■■□□□ 1.18
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ATG7-216ENST00000460291 PTPRKQ15262 1439 aa22.39■■□□□ 1.17
ATG7-216ENST00000460291 NCOA1Q15788 1441 aa22.38■■□□□ 1.17
ATG7-216ENST00000460291 TSPY4P0CV99 314 aa22.37■■□□□ 1.17
ATG7-216ENST00000460291 TSPY10P0CW01 314 aa22.37■■□□□ 1.17
ATG7-216ENST00000460291 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
ATG7-216ENST00000460291 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.36■■□□□ 1.17
ATG7-216ENST00000460291 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.36■■□□□ 1.17
ATG7-216ENST00000460291 KIF3BO15066 747 aa22.36■■□□□ 1.17
ATG7-216ENST00000460291 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
ATG7-216ENST00000460291 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
ATG7-216ENST00000460291 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.3■■□□□ 1.16
ATG7-216ENST00000460291 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.29■■□□□ 1.16
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