RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 WIZO95785 1651 aa15.03■□□□□ -0
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa15□□□□□ -0.01
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PEG3Q9GZU2 1588 aa14.98□□□□□ -0.01
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP14.97□□□□□ -0.01
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BARGINQ6ZT62 677 aa14.97□□□□□ -0.01
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HMGXB3Q12766 1538 aa14.97□□□□□ -0.01
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MS4A4AQ96JQ5 239 aa14.96□□□□□ -0.01
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CAMK2BQ13554 666 aa14.95□□□□□ -0.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GOLGA2Q08379 1002 aa14.88□□□□□ -0.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AK7Q96M32 723 aa14.88□□□□□ -0.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GPIHBP1Q8IV16 184 aa14.84□□□□□ -0.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZRANB1Q9UGI0 708 aa14.8□□□□□ -0.04
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NESP48681 1621 aa14.79□□□□□ -0.04
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM106CQ9BVX2 250 aa14.79□□□□□ -0.04
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa14.76□□□□□ -0.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PHF12Q96QT6 1004 aa14.74□□□□□ -0.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CD44P16070 742 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PIP4P2Q8N4L2 257 aa14.72□□□□□ -0.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KDM4CQ9H3R0 1056 aa14.71□□□□□ -0.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRIM66O15016 1216 aa14.69□□□□□ -0.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IL27Q8NEV9 243 aa14.69□□□□□ -0.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PDE4DQ08499 809 aa14.67□□□□□ -0.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PDIA6Q15084 440 aa14.67□□□□□ -0.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CCDC88BA6NC98 1476 aa14.67□□□□□ -0.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DPYSL4O14531 572 aa14.66□□□□□ -0.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CHRDL2Q6WN34 429 aa14.66□□□□□ -0.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ERCC6Q03468 1493 aa14.65□□□□□ -0.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CADPSQ9ULU8 1353 aa14.64□□□□□ -0.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EMILIN3Q9NT22 766 aa14.63□□□□□ -0.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRPC6Q9Y210 931 aa14.63□□□□□ -0.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MS4A3Q96HJ5 214 aa14.62□□□□□ -0.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa14.62□□□□□ -0.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZMYND15Q9H091 742 aa14.61□□□□□ -0.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TIE1P35590 1138 aa14.6□□□□□ -0.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DSG2Q14126 1118 aa14.59□□□□□ -0.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa14.57□□□□□ -0.08
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GPR37O15354 613 aa14.56□□□□□ -0.08
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CFTRP13569 1480 aa14.56□□□□□ -0.08
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FOXK1P85037 733 aa14.55□□□□□ -0.08
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RSPH6AQ9H0K4 717 aa14.55□□□□□ -0.08
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TTLL13PA6NNM8 815 aa14.54□□□□□ -0.08
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMC2Q8TDI7 906 aa14.54□□□□□ -0.08
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PDS5BQ9NTI5 1447 aa14.54□□□□□ -0.08
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MICALL2Q8IY33 904 aa14.5□□□□□ -0.09
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FANCD2Q9BXW9 1451 aa14.5□□□□□ -0.09
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MAP2K5Q13163 448 aa14.48□□□□□ -0.09
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DDRGK1Q96HY6 314 aa14.48□□□□□ -0.09
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM117AQ9C073 453 aa14.48□□□□□ -0.09
PGGT1BP1-201ENST00000455321 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CEP164Q9UPV0 1460 aa14.45□□□□□ -0.1
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PLPP6Q8IY26 295 aa14.45□□□□□ -0.1
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NUTM2FA1L443 756 aa14.44□□□□□ -0.1
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AMHR2Q16671 573 aa14.44□□□□□ -0.1
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DPY19L2Q6NUT2 758 aa14.44□□□□□ -0.1
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CCDC102AQ96A19 550 aa14.44□□□□□ -0.1
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRIM35Q9UPQ4 493 aa14.44□□□□□ -0.1
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GRXCR2A6NFK2 248 aa14.43□□□□□ -0.1
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IRF6O14896 467 aa14.43□□□□□ -0.1
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRDM2Q13029 1718 aa14.42□□□□□ -0.1
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MRC2Q9UBG0 1479 aa14.42□□□□□ -0.1
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MAP3K9P80192 1104 aa14.41□□□□□ -0.1
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PLEKHG3A1L390 1219 aa14.4□□□□□ -0.1
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C19orf67A6NJJ6 358 aa14.4□□□□□ -0.1
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GNPATO15228 680 aa14.39□□□□□ -0.11
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UBTFP17480 764 aaKnown RBP14.39□□□□□ -0.11
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP14.38□□□□□ -0.11
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CUX2O14529 1486 aa14.38□□□□□ -0.11
PGGT1BP1-201ENST00000455321 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP14.37□□□□□ -0.11
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C2orf72A6NCS6 295 aa14.37□□□□□ -0.11
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KIF3CO14782 793 aa14.37□□□□□ -0.11
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HIC1Q14526 733 aa14.37□□□□□ -0.11
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PARP9Q8IXQ6 854 aa14.37□□□□□ -0.11
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP14.37□□□□□ -0.11
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FCHSD2O94868 740 aa14.36□□□□□ -0.11
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OSBPP22059 807 aa14.36□□□□□ -0.11
PGGT1BP1-201ENST00000455321 WDR62O43379 1518 aa14.36□□□□□ -0.11
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PTGER2P43116 358 aa14.35□□□□□ -0.11
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FLIIQ13045 1269 aa14.35□□□□□ -0.11
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GOPCQ9HD26 462 aa14.34□□□□□ -0.11
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BOLA1Q9Y3E2 137 aa14.33□□□□□ -0.12
PGGT1BP1-201ENST00000455321 G3V3G9 751 aa14.31□□□□□ -0.12
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PODXL2Q9NZ53 605 aa14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.1 ms