RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442928.6

TRAF3IP2-AS1-205, TRAF3IP2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene TRAF3IP2-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa15.29■□□□□ 0.04
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa15.28■□□□□ 0.04
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 AKNAQ7Z591 1439 aa15.28■□□□□ 0.04
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 SETD5Q9C0A6 1442 aa15.28■□□□□ 0.04
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa15.27■□□□□ 0.04
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 ROCK1Q13464 1354 aa15.27■□□□□ 0.04
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa15.27■□□□□ 0.04
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 PREX2Q70Z35 1606 aa15.27■□□□□ 0.03
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 MAPKBP1O60336 1514 aa15.27■□□□□ 0.03
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 DAPK1P53355 1430 aa15.26■□□□□ 0.03
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa15.26■□□□□ 0.03
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 HFM1A2PYH4 1435 aa15.26■□□□□ 0.03
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 ABCC5O15440 1437 aa15.26■□□□□ 0.03
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 PTPRKQ15262 1439 aa15.26■□□□□ 0.03
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 TTC37Q6PGP7 1564 aa15.25■□□□□ 0.03
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 ABCA9Q8IUA7 1624 aa15.25■□□□□ 0.03
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 MYO5CQ9NQX4 1742 aa15.23■□□□□ 0.03
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 ARHGAP5Q13017 1502 aa15.23■□□□□ 0.03
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa15.23■□□□□ 0.03
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 TSPY4P0CV99 314 aa15.22■□□□□ 0.03
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 TSPY10P0CW01 314 aa15.22■□□□□ 0.03
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 ARHGEF5Q12774 1597 aa15.22■□□□□ 0.03
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa15.22■□□□□ 0.03
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 SHANK2Q9UPX8 1470 aa15.21■□□□□ 0.03
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 CLSPNQ9HAW4 1339 aa15.21■□□□□ 0.03
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 MBD5Q9P267 1494 aa15.2■□□□□ 0.02
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 NAIPQ13075 1403 aa15.2■□□□□ 0.02
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 ADGRL2O95490 1459 aa15.19■□□□□ 0.02
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa15.19■□□□□ 0.02
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa15.18■□□□□ 0.02
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 CCDC141Q6ZP82 1450 aa15.18■□□□□ 0.02
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP15.17■□□□□ 0.02
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 CHIC2Q9UKJ5 165 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 NCOA1Q15788 1441 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 CD109Q6YHK3 1445 aa15.17■□□□□ 0.02
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 GLI2P10070 1586 aa15.16■□□□□ 0.02
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 FANCAO15360 1455 aa15.15■□□□□ 0.02
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa15.14■□□□□ 0.01
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 C9orf84Q5VXU9 1444 aa15.14■□□□□ 0.01
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 CROCC2H7BZ55 1655 aa15.13■□□□□ 0.01
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 ABCC1P33527 1531 aa15.12■□□□□ 0.01
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 MAST1Q9Y2H9 1570 aa15.12■□□□□ 0.01
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 GCC2Q8IWJ2 1684 aa15.12■□□□□ 0.01
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 SYCP2Q9BX26 1530 aa15.12■□□□□ 0.01
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 CFAP74Q9C0B2 1584 aa15.11■□□□□ 0.01
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 ADGBQ8N7X0 1667 aa15.11■□□□□ 0.01
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa15.1■□□□□ 0.01
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 NEO1Q92859 1461 aa15.1■□□□□ 0.01
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa15.09■□□□□ 0.01
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 ADGRL1O94910 1474 aa15.08■□□□□ 0
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 FAM69CQ0P6D2 419 aa15.07■□□□□ 0
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 SCAPERQ9BY12 1400 aa15.07■□□□□ 0
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 KIF15Q9NS87 1388 aa15.06■□□□□ 0
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa15.06■□□□□ 0
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa15.06■□□□□ 0
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 DIP2BQ9P265 1576 aa15.06■□□□□ 0
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa15.06■□□□□ 0
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 PLXNC1O60486 1568 aa15.04■□□□□ -0
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa15.03■□□□□ -0
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 TEX14Q8IWB6 1497 aa15.02■□□□□ -0
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 AFAP1Q8N556 730 aa15.02■□□□□ -0
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 TRHP20396 242 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 TRIM52Q96A61 297 aa15.01□□□□□ -0.01
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 DUOX2Q9NRD8 1548 aa15.01□□□□□ -0.01
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 POGZQ7Z3K3 1410 aa15□□□□□ -0.01
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 ERBINQ96RT1 1412 aa15□□□□□ -0.01
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 MLH3Q9UHC1 1453 aa14.98□□□□□ -0.01
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 MPHOSPH9Q99550 1183 aa14.98□□□□□ -0.01
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa14.98□□□□□ -0.01
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 KDM6BO15054 1643 aa14.98□□□□□ -0.01
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa14.97□□□□□ -0.01
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 KDM5CP41229 1560 aa14.96□□□□□ -0.01
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 ATP7AQ04656 1500 aa14.96□□□□□ -0.02
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 KDM5DQ9BY66 1539 aa14.95□□□□□ -0.02
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 MYT1LQ9UL68 1186 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 NUP155O75694 1391 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 PZPP20742 1482 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 MAGI2Q86UL8 1455 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 KIF13AQ9H1H9 1805 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 RAPGEF3O95398 923 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 HECW2Q9P2P5 1572 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 UNC13BO14795 1591 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 A2MP01023 1474 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa14.87□□□□□ -0.03
TRAF3IP2-AS1-205ENST00000442928 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.4 ms