RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442708.5

USP39-205, Transcript of ubiquitin specific peptidase 39, humanhuman

TSL 4

Gene USP39, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP39-205ENST00000442708 NCOA2Q15596 1464 aa25.18■■□□□ 1.62
USP39-205ENST00000442708 CFAP74Q9C0B2 1584 aa25.18■■□□□ 1.62
USP39-205ENST00000442708 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.17■■□□□ 1.62
USP39-205ENST00000442708 APLP2Q06481 763 aa25.17■■□□□ 1.62
USP39-205ENST00000442708 AKNAQ7Z591 1439 aa25.16■■□□□ 1.62
USP39-205ENST00000442708 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.15■■□□□ 1.62
USP39-205ENST00000442708 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.14■■□□□ 1.61
USP39-205ENST00000442708 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.12■■□□□ 1.61
USP39-205ENST00000442708 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.1■■□□□ 1.61
USP39-205ENST00000442708 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.1■■□□□ 1.61
USP39-205ENST00000442708 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.08■■□□□ 1.61
USP39-205ENST00000442708 ADGRL1O94910 1474 aa25.08■■□□□ 1.6
USP39-205ENST00000442708 RICTORQ6R327 1708 aa25.07■■□□□ 1.6
USP39-205ENST00000442708 RAPGEF3O95398 923 aa25.07■■□□□ 1.6
USP39-205ENST00000442708 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.05■■□□□ 1.6
USP39-205ENST00000442708 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
USP39-205ENST00000442708 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
USP39-205ENST00000442708 ABCC1P33527 1531 aa25.04■■□□□ 1.6
USP39-205ENST00000442708 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.04■■□□□ 1.6
USP39-205ENST00000442708 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
USP39-205ENST00000442708 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
USP39-205ENST00000442708 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
USP39-205ENST00000442708 POGZQ7Z3K3 1410 aa25■■□□□ 1.59
USP39-205ENST00000442708 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.99■■□□□ 1.59
USP39-205ENST00000442708 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.98■■□□□ 1.59
USP39-205ENST00000442708 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.96■■□□□ 1.59
USP39-205ENST00000442708 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.94■■□□□ 1.58
USP39-205ENST00000442708 AFAP1Q8N556 730 aa24.94■■□□□ 1.58
USP39-205ENST00000442708 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa24.94■■□□□ 1.58
USP39-205ENST00000442708 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.94■■□□□ 1.58
USP39-205ENST00000442708 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.93■■□□□ 1.58
USP39-205ENST00000442708 KDM5CP41229 1560 aa24.92■■□□□ 1.58
USP39-205ENST00000442708 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.91■■□□□ 1.58
USP39-205ENST00000442708 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.91■■□□□ 1.58
USP39-205ENST00000442708 MIA2Q96PC5 1412 aa24.91■■□□□ 1.58
USP39-205ENST00000442708 MBD5Q9P267 1494 aa24.9■■□□□ 1.58
USP39-205ENST00000442708 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa24.89■■□□□ 1.58
USP39-205ENST00000442708 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.87■■□□□ 1.57
USP39-205ENST00000442708 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.87■■□□□ 1.57
USP39-205ENST00000442708 YEATS2Q9ULM3 1422 aa24.86■■□□□ 1.57
USP39-205ENST00000442708 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa24.85■■□□□ 1.57
USP39-205ENST00000442708 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa24.84■■□□□ 1.57
USP39-205ENST00000442708 HECW2Q9P2P5 1572 aa24.84■■□□□ 1.57
USP39-205ENST00000442708 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.83■■□□□ 1.56
USP39-205ENST00000442708 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.82■■□□□ 1.56
USP39-205ENST00000442708 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
USP39-205ENST00000442708 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.81■■□□□ 1.56
USP39-205ENST00000442708 MLH3Q9UHC1 1453 aa24.81■■□□□ 1.56
USP39-205ENST00000442708 ABCA6Q8N139 1617 aa24.79■■□□□ 1.56
USP39-205ENST00000442708 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa24.79■■□□□ 1.56
USP39-205ENST00000442708 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
USP39-205ENST00000442708 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.78■■□□□ 1.56
USP39-205ENST00000442708 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa24.78■■□□□ 1.56
USP39-205ENST00000442708 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
USP39-205ENST00000442708 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
USP39-205ENST00000442708 ATP7AQ04656 1500 aa24.76■■□□□ 1.55
USP39-205ENST00000442708 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.73■■□□□ 1.55
USP39-205ENST00000442708 ATP10AO60312 1499 aa24.72■■□□□ 1.55
USP39-205ENST00000442708 CROCC2H7BZ55 1655 aa24.72■■□□□ 1.55
USP39-205ENST00000442708 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
USP39-205ENST00000442708 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.71■■□□□ 1.55
USP39-205ENST00000442708 ABCC5O15440 1437 aa24.7■■□□□ 1.55
USP39-205ENST00000442708 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
USP39-205ENST00000442708 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.68■■□□□ 1.54
USP39-205ENST00000442708 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.68■■□□□ 1.54
USP39-205ENST00000442708 DAPK1P53355 1430 aa24.68■■□□□ 1.54
USP39-205ENST00000442708 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.68■■□□□ 1.54
USP39-205ENST00000442708 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.66■■□□□ 1.54
USP39-205ENST00000442708 REREQ9P2R6 1566 aa24.65■■□□□ 1.54
USP39-205ENST00000442708 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
USP39-205ENST00000442708 TSPY4P0CV99 314 aa24.64■■□□□ 1.54
USP39-205ENST00000442708 TSPY10P0CW01 314 aa24.64■■□□□ 1.54
USP39-205ENST00000442708 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.62■■□□□ 1.53
USP39-205ENST00000442708 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.61■■□□□ 1.53
USP39-205ENST00000442708 PLXNC1O60486 1568 aa24.6■■□□□ 1.53
USP39-205ENST00000442708 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
USP39-205ENST00000442708 A2MP01023 1474 aa24.59■■□□□ 1.53
USP39-205ENST00000442708 PTPRKQ15262 1439 aa24.59■■□□□ 1.53
USP39-205ENST00000442708 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.58■■□□□ 1.531e-6■□□□□ 11
USP39-205ENST00000442708 AGLP35573 1532 aa24.57■■□□□ 1.52
USP39-205ENST00000442708 ADAMTSL3P82987 1691 aa24.56■■□□□ 1.52
USP39-205ENST00000442708 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.56■■□□□ 1.52
USP39-205ENST00000442708 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
USP39-205ENST00000442708 ADGRL2O95490 1459 aa24.51■■□□□ 1.51
USP39-205ENST00000442708 MLECQ14165 292 aa24.51■■□□□ 1.51
USP39-205ENST00000442708 ITGAEP38570 1179 aa24.5■■□□□ 1.51
USP39-205ENST00000442708 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.5■■□□□ 1.51
USP39-205ENST00000442708 NCOA1Q15788 1441 aa24.5■■□□□ 1.51
USP39-205ENST00000442708 MADDQ8WXG6 1647 aa24.5■■□□□ 1.51
USP39-205ENST00000442708 KIF15Q9NS87 1388 aa24.49■■□□□ 1.51
USP39-205ENST00000442708 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.47■■□□□ 1.51
USP39-205ENST00000442708 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.47■■□□□ 1.51
USP39-205ENST00000442708 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa24.46■■□□□ 1.51
USP39-205ENST00000442708 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
USP39-205ENST00000442708 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
USP39-205ENST00000442708 KIF3BO15066 747 aa24.41■■□□□ 1.5
USP39-205ENST00000442708 ROCK1Q13464 1354 aa24.41■■□□□ 1.5
USP39-205ENST00000442708 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
USP39-205ENST00000442708 ERBINQ96RT1 1412 aa24.38■■□□□ 1.49
USP39-205ENST00000442708 GGT6Q6P531 493 aa24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.8 ms