RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441400.5

AFF3-212, Transcript of AF4/FMR2 family member 3, human

TSL 4

Gene AFF3, Length 543 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AFF3-212	ENST00000441400	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		43.26	■■■■■ 4.52
AFF3-212	ENST00000441400	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		43.25	■■■■■ 4.51
AFF3-212	ENST00000441400	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		43.23	■■■■■ 4.51
AFF3-212	ENST00000441400	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		43.22	■■■■■ 4.51
AFF3-212	ENST00000441400	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		43.21	■■■■■ 4.51
AFF3-212	ENST00000441400	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		43.19	■■■■■ 4.51
AFF3-212	ENST00000441400	PREX2	Q70Z35	1606 aa		43.18	■■■■■ 4.5
AFF3-212	ENST00000441400	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		43.14	■■■■■ 4.5
AFF3-212	ENST00000441400	CEP162	Q5TB80	1403 aa		43.14	■■■■■ 4.5
AFF3-212	ENST00000441400	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	43.12	■■■■■ 4.49
AFF3-212	ENST00000441400	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		43.1	■■■■■ 4.49
AFF3-212	ENST00000441400	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		43.08	■■■■■ 4.49
AFF3-212	ENST00000441400	KDM5C	P41229	1560 aa		43.06	■■■■■ 4.48
AFF3-212	ENST00000441400	PTPRM	P28827	1452 aa		43.05	■■■■■ 4.48
AFF3-212	ENST00000441400	MADD	Q8WXG6	1647 aa		43.04	■■■■■ 4.48
AFF3-212	ENST00000441400	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		43.03	■■■■■ 4.48
AFF3-212	ENST00000441400	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		43.02	■■■■■ 4.48
AFF3-212	ENST00000441400	ABCC1	P33527	1531 aa		43.01	■■■■■ 4.48
AFF3-212	ENST00000441400	ATP10A	O60312	1499 aa		42.98	■■■■■ 4.47
AFF3-212	ENST00000441400	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		42.95	■■■■■ 4.47
AFF3-212	ENST00000441400	AFAP1	Q8N556	730 aa		42.94	■■■■■ 4.46
AFF3-212	ENST00000441400	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		42.94	■■■■■ 4.46
AFF3-212	ENST00000441400	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		42.92	■■■■■ 4.46
AFF3-212	ENST00000441400	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	42.92	■■■■■ 4.46
AFF3-212	ENST00000441400	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		42.9	■■■■■ 4.46
AFF3-212	ENST00000441400	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	42.89	■■■■■ 4.46
AFF3-212	ENST00000441400	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		42.88	■■■■■ 4.46
AFF3-212	ENST00000441400	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		42.86	■■■■■ 4.45
AFF3-212	ENST00000441400	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		42.85	■■■■■ 4.45
AFF3-212	ENST00000441400	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		42.84	■■■■■ 4.45
AFF3-212	ENST00000441400	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		42.83	■■■■■ 4.45
AFF3-212	ENST00000441400	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		42.81	■■■■■ 4.44
AFF3-212	ENST00000441400	RERE	Q9P2R6	1566 aa		42.81	■■■■■ 4.44
AFF3-212	ENST00000441400	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		42.8	■■■■■ 4.44
AFF3-212	ENST00000441400	ABCA6	Q8N139	1617 aa		42.79	■■■■■ 4.44
AFF3-212	ENST00000441400	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		42.78	■■■■■ 4.44
AFF3-212	ENST00000441400	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		42.74	■■■■■ 4.43
AFF3-212	ENST00000441400	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	42.74	■■■■■ 4.43
AFF3-212	ENST00000441400	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		42.74	■■■■■ 4.43
AFF3-212	ENST00000441400	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		42.74	■■■■■ 4.43
AFF3-212	ENST00000441400	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	42.73	■■■■■ 4.43
AFF3-212	ENST00000441400	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		42.73	■■■■■ 4.43
AFF3-212	ENST00000441400	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		42.72	■■■■■ 4.43
AFF3-212	ENST00000441400	MLEC	Q14165	292 aa		42.72	■■■■■ 4.43
AFF3-212	ENST00000441400	TIAM1	Q13009	1591 aa		42.71	■■■■■ 4.43
AFF3-212	ENST00000441400	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		42.69	■■■■■ 4.42
AFF3-212	ENST00000441400	AGL	P35573	1532 aa		42.65	■■■■■ 4.42
AFF3-212	ENST00000441400	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	42.6	■■■■■ 4.41
AFF3-212	ENST00000441400	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	42.6	■■■■■ 4.41
AFF3-212	ENST00000441400	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		42.59	■■■■■ 4.41
AFF3-212	ENST00000441400	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	42.56	■■■■■ 4.4
AFF3-212	ENST00000441400	NCOA2	Q15596	1464 aa		42.55	■■■■■ 4.4
AFF3-212	ENST00000441400	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	42.54	■■■■■ 4.4
AFF3-212	ENST00000441400	ATP7A	Q04656	1500 aa		42.54	■■■■■ 4.4
AFF3-212	ENST00000441400	MAP3K1	Q13233	1512 aa		42.48	■■■■■ 4.39
AFF3-212	ENST00000441400	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	42.46	■■■■■ 4.39
AFF3-212	ENST00000441400	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		42.46	■■■■■ 4.39
AFF3-212	ENST00000441400	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		42.46	■■■■■ 4.39
AFF3-212	ENST00000441400	MBD5	Q9P267	1494 aa		42.46	■■■■■ 4.39
AFF3-212	ENST00000441400	PLXNC1	O60486	1568 aa		42.4	■■■■■ 4.38
AFF3-212	ENST00000441400	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		42.36	■■■■■ 4.37
AFF3-212	ENST00000441400	A2M	P01023	1474 aa		42.36	■■■■■ 4.37
AFF3-212	ENST00000441400	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		42.36	■■■■■ 4.37
AFF3-212	ENST00000441400	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		42.35	■■■■■ 4.37
AFF3-212	ENST00000441400	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		42.33	■■■■■ 4.37
AFF3-212	ENST00000441400	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	42.33	■■■■■ 4.37
AFF3-212	ENST00000441400	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		42.33	■■■■■ 4.37
AFF3-212	ENST00000441400	C3	P01024	1663 aa		42.32	■■■■■ 4.37
AFF3-212	ENST00000441400	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	42.32	■■■■■ 4.36
AFF3-212	ENST00000441400	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	42.31	■■■■■ 4.36
AFF3-212	ENST00000441400	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		42.3	■■■■■ 4.36
AFF3-212	ENST00000441400	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		42.26	■■■■■ 4.36
AFF3-212	ENST00000441400	HSPA2	P54652	639 aa		42.25	■■■■■ 4.35
AFF3-212	ENST00000441400	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	42.25	■■■■■ 4.35
AFF3-212	ENST00000441400	MROH2A	A6NES4	1674 aa		42.25	■■■■■ 4.35
AFF3-212	ENST00000441400	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		42.24	■■■■■ 4.35
AFF3-212	ENST00000441400	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		42.17	■■■■■ 4.34
AFF3-212	ENST00000441400	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		42.14	■■■■■ 4.34
AFF3-212	ENST00000441400	MIA2	Q96PC5	1412 aa		42.14	■■■■■ 4.34
AFF3-212	ENST00000441400	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	42.13	■■■■■ 4.33
AFF3-212	ENST00000441400	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	42.1	■■■■■ 4.33
AFF3-212	ENST00000441400	APLP2	Q06481	763 aa		42.09	■■■■■ 4.33
AFF3-212	ENST00000441400	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		42.09	■■■■■ 4.33
AFF3-212	ENST00000441400	ZMYM3	Q14202	1370 aa		42.08	■■■■■ 4.33
AFF3-212	ENST00000441400	NPAT	Q14207	1427 aa		42.08	■■■■■ 4.33
AFF3-212	ENST00000441400	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	42.07	■■■■■ 4.33
AFF3-212	ENST00000441400	GGT6	Q6P531	493 aa		42.05	■■■■■ 4.32
AFF3-212	ENST00000441400	TSPY4	P0CV99	314 aa		42.04	■■■■■ 4.32
AFF3-212	ENST00000441400	TSPY10	P0CW01	314 aa		42.04	■■■■■ 4.32
AFF3-212	ENST00000441400	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		42.03	■■■■■ 4.32
AFF3-212	ENST00000441400	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		41.96	■■■■■ 4.31
AFF3-212	ENST00000441400	STRC	Q7RTU9	1775 aa		41.95	■■■■■ 4.31
AFF3-212	ENST00000441400	KIF3B	O15066	747 aa		41.92	■■■■■ 4.3
AFF3-212	ENST00000441400	PTPRK	Q15262	1439 aa		41.91	■■■■■ 4.3
AFF3-212	ENST00000441400	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		41.87	■■■■■ 4.29
AFF3-212	ENST00000441400	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		41.86	■■■■■ 4.29
AFF3-212	ENST00000441400	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		41.85	■■■■■ 4.29
AFF3-212	ENST00000441400	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		41.84	■■■■■ 4.29
AFF3-212	ENST00000441400	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	41.83	■■■■■ 4.29
AFF3-212	ENST00000441400	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		41.81	■■■■■ 4.28

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