RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440239.5

CHTF18-204, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CHTF18, Length 1,801 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-204ENST00000440239 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa35.84■■■■□ 3.33
CHTF18-204ENST00000440239 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP35.82■■■■□ 3.32
CHTF18-204ENST00000440239 NEO1Q92859 1461 aa35.82■■■■□ 3.32
CHTF18-204ENST00000440239 CFAP74Q9C0B2 1584 aa35.82■■■■□ 3.32
CHTF18-204ENST00000440239 KDM6BO15054 1643 aa35.82■■■■□ 3.32
CHTF18-204ENST00000440239 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP35.8■■■■□ 3.32
CHTF18-204ENST00000440239 ARAP3Q8WWN8 1544 aa35.8■■■■□ 3.32
CHTF18-204ENST00000440239 AKNAQ7Z591 1439 aa35.79■■■■□ 3.32
CHTF18-204ENST00000440239 ITSN2Q9NZM3 1697 aa35.78■■■■□ 3.32
CHTF18-204ENST00000440239 PHLDB1Q86UU1 1377 aa35.73■■■■□ 3.31
CHTF18-204ENST00000440239 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
CHTF18-204ENST00000440239 ADGRL1O94910 1474 aa35.72■■■■□ 3.31
CHTF18-204ENST00000440239 SCAPERQ9BY12 1400 aa35.67■■■■□ 3.3
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CHTF18-204ENST00000440239 MYOM3Q5VTT5 1437 aa35.66■■■■□ 3.3
CHTF18-204ENST00000440239 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa35.65■■■■□ 3.3
CHTF18-204ENST00000440239 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP35.64■■■■□ 3.3
CHTF18-204ENST00000440239 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP35.62■■■■□ 3.29
CHTF18-204ENST00000440239 ABCC1P33527 1531 aa35.6■■■■□ 3.29
CHTF18-204ENST00000440239 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP35.57■■■■□ 3.291e-7■■■□□ 17.2
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CHTF18-204ENST00000440239 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa35.55■■■■□ 3.28
CHTF18-204ENST00000440239 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa35.55■■■■□ 3.28
CHTF18-204ENST00000440239 MIA2Q96PC5 1412 aa35.54■■■■□ 3.28
CHTF18-204ENST00000440239 RICTORQ6R327 1708 aa35.53■■■■□ 3.28
CHTF18-204ENST00000440239 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa35.53■■■■□ 3.28
CHTF18-204ENST00000440239 POGZQ7Z3K3 1410 aa35.52■■■■□ 3.28
CHTF18-204ENST00000440239 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa35.52■■■■□ 3.28
CHTF18-204ENST00000440239 AFAP1Q8N556 730 aa35.52■■■■□ 3.28
CHTF18-204ENST00000440239 FGD6Q6ZV73 1430 aa35.52■■■■□ 3.28
CHTF18-204ENST00000440239 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa35.49■■■■□ 3.27
CHTF18-204ENST00000440239 PTPN23Q9H3S7 1636 aa35.48■■■■□ 3.27
CHTF18-204ENST00000440239 MYT1LQ9UL68 1186 aa35.48■■■■□ 3.27
CHTF18-204ENST00000440239 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa35.47■■■■□ 3.27
CHTF18-204ENST00000440239 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa35.47■■■■□ 3.27
CHTF18-204ENST00000440239 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP35.43■■■■□ 3.26
CHTF18-204ENST00000440239 MBD5Q9P267 1494 aa35.39■■■■□ 3.26
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CHTF18-204ENST00000440239 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa35.36■■■■□ 3.25
CHTF18-204ENST00000440239 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP35.35■■■■□ 3.25
CHTF18-204ENST00000440239 CCDC141Q6ZP82 1450 aa35.34■■■■□ 3.25
CHTF18-204ENST00000440239 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP35.33■■■■□ 3.25
CHTF18-204ENST00000440239 HECW2Q9P2P5 1572 aa35.32■■■■□ 3.24
CHTF18-204ENST00000440239 ARHGEF5Q12774 1597 aa35.31■■■■□ 3.24
CHTF18-204ENST00000440239 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa35.3■■■■□ 3.24
CHTF18-204ENST00000440239 RSPH4AQ5TD94 716 aa35.3■■■■□ 3.24
CHTF18-204ENST00000440239 YEATS2Q9ULM3 1422 aa35.3■■■■□ 3.24
CHTF18-204ENST00000440239 MAGI2Q86UL8 1455 aa35.28■■■■□ 3.24
CHTF18-204ENST00000440239 TSPY4P0CV99 314 aa35.27■■■■□ 3.24
CHTF18-204ENST00000440239 TSPY10P0CW01 314 aa35.27■■■■□ 3.24
CHTF18-204ENST00000440239 MLH3Q9UHC1 1453 aa35.26■■■■□ 3.23
CHTF18-204ENST00000440239 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa35.24■■■■□ 3.23
CHTF18-204ENST00000440239 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa35.23■■■■□ 3.23
CHTF18-204ENST00000440239 ATP7AQ04656 1500 aa35.23■■■■□ 3.23
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CHTF18-204ENST00000440239 DAPK1P53355 1430 aa35.21■■■■□ 3.23
CHTF18-204ENST00000440239 ITGAEP38570 1179 aa35.21■■■■□ 3.23
CHTF18-204ENST00000440239 ABCC5O15440 1437 aa35.21■■■■□ 3.23
CHTF18-204ENST00000440239 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.2■■■■□ 3.23
CHTF18-204ENST00000440239 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP35.2■■■■□ 3.23
CHTF18-204ENST00000440239 ABCA6Q8N139 1617 aa35.19■■■■□ 3.22
CHTF18-204ENST00000440239 C9orf84Q5VXU9 1444 aa35.17■■■■□ 3.22
CHTF18-204ENST00000440239 CROCC2H7BZ55 1655 aa35.17■■■■□ 3.22
CHTF18-204ENST00000440239 CHIC2Q9UKJ5 165 aa35.16■■■■□ 3.22
CHTF18-204ENST00000440239 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa35.16■■■■□ 3.22
CHTF18-204ENST00000440239 ATP10AO60312 1499 aa35.14■■■■□ 3.22
CHTF18-204ENST00000440239 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP35.13■■■■□ 3.21
CHTF18-204ENST00000440239 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa35.13■■■■□ 3.21
CHTF18-204ENST00000440239 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP35.1■■■■□ 3.214e-8■□□□□ 10
CHTF18-204ENST00000440239 MAST1Q9Y2H9 1570 aa35.09■■■■□ 3.21
CHTF18-204ENST00000440239 SHANK2Q9UPX8 1470 aa35.08■■■■□ 3.21
CHTF18-204ENST00000440239 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa35.03■■■■□ 3.2
CHTF18-204ENST00000440239 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa35.03■■■■□ 3.2
CHTF18-204ENST00000440239 ADGBQ8N7X0 1667 aa35.03■■■■□ 3.2
CHTF18-204ENST00000440239 PTPRKQ15262 1439 aa35.02■■■■□ 3.2
CHTF18-204ENST00000440239 A2MP01023 1474 aa35.01■■■■□ 3.2
CHTF18-204ENST00000440239 MLECQ14165 292 aa34.99■■■■□ 3.19
CHTF18-204ENST00000440239 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa34.98■■■■□ 3.19
CHTF18-204ENST00000440239 PLXNC1O60486 1568 aa34.98■■■■□ 3.19
CHTF18-204ENST00000440239 REREQ9P2R6 1566 aa34.96■■■■□ 3.19
CHTF18-204ENST00000440239 KIF15Q9NS87 1388 aa34.96■■■■□ 3.19
CHTF18-204ENST00000440239 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP34.93■■■■□ 3.18
CHTF18-204ENST00000440239 NCOA1Q15788 1441 aa34.92■■■■□ 3.18
CHTF18-204ENST00000440239 ADGRL2O95490 1459 aa34.91■■■■□ 3.18
CHTF18-204ENST00000440239 DUOX2Q9NRD8 1548 aa34.88■■■■□ 3.17
CHTF18-204ENST00000440239 AGLP35573 1532 aa34.86■■■■□ 3.17
CHTF18-204ENST00000440239 BCORL1Q5H9F3 1711 aa34.86■■■■□ 3.17
CHTF18-204ENST00000440239 KIF3BO15066 747 aa34.85■■■■□ 3.17
CHTF18-204ENST00000440239 ROCK1Q13464 1354 aa34.83■■■■□ 3.17
CHTF18-204ENST00000440239 GGT6Q6P531 493 aa34.83■■■■□ 3.17
CHTF18-204ENST00000440239 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa34.78■■■■□ 3.16
CHTF18-204ENST00000440239 ERBINQ96RT1 1412 aa34.77■■■■□ 3.16
CHTF18-204ENST00000440239 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa34.74■■■■□ 3.15
CHTF18-204ENST00000440239 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP34.74■■■■□ 3.15
CHTF18-204ENST00000440239 ADAMTSL3P82987 1691 aa34.73■■■■□ 3.15
CHTF18-204ENST00000440239 MADDQ8WXG6 1647 aa34.73■■■■□ 3.15
CHTF18-204ENST00000440239 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP34.73■■■■□ 3.15
CHTF18-204ENST00000440239 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa34.71■■■■□ 3.15
CHTF18-204ENST00000440239 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP34.69■■■■□ 3.141e-6■■□□□ 14.5
CHTF18-204ENST00000440239 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP34.67■■■■□ 3.14
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