RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437652.5

UBAP2L-209, Transcript of ubiquitin associated protein 2 like, humanhuman

TSL 3

Gene UBAP2L, Length 911 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2L-209ENST00000437652 MAGI2Q86UL8 1455 aa42.37■■■■■ 4.37
UBAP2L-209ENST00000437652 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa42.37■■■■■ 4.37
UBAP2L-209ENST00000437652 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa42.35■■■■■ 4.37
UBAP2L-209ENST00000437652 CCDC18Q5T9S5 1454 aa42.34■■■■■ 4.37
UBAP2L-209ENST00000437652 POGZQ7Z3K3 1410 aa42.33■■■■■ 4.37
UBAP2L-209ENST00000437652 YEATS2Q9ULM3 1422 aa42.33■■■■■ 4.37
UBAP2L-209ENST00000437652 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP42.31■■■■■ 4.36
UBAP2L-209ENST00000437652 ARHGAP5Q13017 1502 aa42.3■■■■■ 4.36
UBAP2L-209ENST00000437652 MADDQ8WXG6 1647 aa42.28■■■■■ 4.36
UBAP2L-209ENST00000437652 MYT1LQ9UL68 1186 aa42.23■■■■■ 4.35
UBAP2L-209ENST00000437652 MLECQ14165 292 aa42.22■■■■■ 4.35
UBAP2L-209ENST00000437652 AFAP1Q8N556 730 aa42.21■■■■■ 4.35
UBAP2L-209ENST00000437652 FYCO1Q9BQS8 1478 aa42.21■■■■■ 4.35
UBAP2L-209ENST00000437652 ATP10AO60312 1499 aa42.18■■■■■ 4.34
UBAP2L-209ENST00000437652 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa42.17■■■■■ 4.34
UBAP2L-209ENST00000437652 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa42.16■■■■■ 4.34
UBAP2L-209ENST00000437652 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP42.15■■■■■ 4.34
UBAP2L-209ENST00000437652 PLPPR3Q6T4P5 718 aa42.14■■■■■ 4.34
UBAP2L-209ENST00000437652 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa42.11■■■■■ 4.33
UBAP2L-209ENST00000437652 C9orf84Q5VXU9 1444 aa42.09■■■■■ 4.33
UBAP2L-209ENST00000437652 PREX2Q70Z35 1606 aa42.06■■■■■ 4.32
UBAP2L-209ENST00000437652 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP42.02■■■■■ 4.32
UBAP2L-209ENST00000437652 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP42.02■■■■■ 4.32
UBAP2L-209ENST00000437652 KDM5CP41229 1560 aa42.01■■■■■ 4.32
UBAP2L-209ENST00000437652 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa41.99■■■■■ 4.31
UBAP2L-209ENST00000437652 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa41.96■■■■■ 4.31
UBAP2L-209ENST00000437652 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa41.96■■■■■ 4.31
UBAP2L-209ENST00000437652 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa41.95■■■■■ 4.31
UBAP2L-209ENST00000437652 MLH3Q9UHC1 1453 aa41.94■■■■■ 4.3
UBAP2L-209ENST00000437652 ABCC1P33527 1531 aa41.94■■■■■ 4.3
UBAP2L-209ENST00000437652 MTUS2Q5JR59 1369 aa41.9■■■■■ 4.3
UBAP2L-209ENST00000437652 LMTK3Q96Q04 1460 aa41.9■■■■■ 4.3
UBAP2L-209ENST00000437652 ITSN2Q9NZM3 1697 aa41.9■■■■■ 4.3
UBAP2L-209ENST00000437652 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP41.89■■■■■ 4.3
UBAP2L-209ENST00000437652 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP41.87■■■■■ 4.29
UBAP2L-209ENST00000437652 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa41.86■■■■■ 4.29
UBAP2L-209ENST00000437652 CCNB3Q8WWL7 1395 aa41.86■■■■■ 4.29
UBAP2L-209ENST00000437652 CEP162Q5TB80 1403 aa41.86■■■■■ 4.29
UBAP2L-209ENST00000437652 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP41.84■■■■■ 4.293e-7■■■□□ 15
UBAP2L-209ENST00000437652 HSPA2P54652 639 aa41.82■■■■■ 4.29
UBAP2L-209ENST00000437652 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP41.81■■■■■ 4.28
UBAP2L-209ENST00000437652 ABCA6Q8N139 1617 aa41.8■■■■■ 4.28
UBAP2L-209ENST00000437652 REREQ9P2R6 1566 aa41.79■■■■■ 4.28
UBAP2L-209ENST00000437652 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP41.78■■■■■ 4.28
UBAP2L-209ENST00000437652 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa41.77■■■■■ 4.28
UBAP2L-209ENST00000437652 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP41.76■■■■■ 4.28
UBAP2L-209ENST00000437652 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa41.75■■■■■ 4.27
UBAP2L-209ENST00000437652 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.72■■■■■ 4.27
UBAP2L-209ENST00000437652 SYCP2Q9BX26 1530 aa41.72■■■■■ 4.27
UBAP2L-209ENST00000437652 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa41.72■■■■■ 4.27
UBAP2L-209ENST00000437652 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa41.7■■■■■ 4.27
UBAP2L-209ENST00000437652 AGLP35573 1532 aa41.7■■■■■ 4.27
UBAP2L-209ENST00000437652 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP41.65■■■■■ 4.26
UBAP2L-209ENST00000437652 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa41.64■■■■■ 4.26
UBAP2L-209ENST00000437652 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP41.59■■■■■ 4.25
UBAP2L-209ENST00000437652 PREX1Q8TCU6 1659 aa41.58■■■■■ 4.25
UBAP2L-209ENST00000437652 TIAM1Q13009 1591 aa41.55■■■■■ 4.24
UBAP2L-209ENST00000437652 ATP7AQ04656 1500 aa41.54■■■■■ 4.24
UBAP2L-209ENST00000437652 FBXO41Q8TF61 875 aa41.53■■■■■ 4.24
UBAP2L-209ENST00000437652 CNTLNQ9NXG0 1405 aa41.51■■■■■ 4.24
UBAP2L-209ENST00000437652 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa41.5■■■■■ 4.23
UBAP2L-209ENST00000437652 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP41.49■■■■■ 4.23
UBAP2L-209ENST00000437652 C3P01024 1663 aa41.49■■■■■ 4.23
UBAP2L-209ENST00000437652 A2MP01023 1474 aa41.46■■■■■ 4.23
UBAP2L-209ENST00000437652 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP41.45■■■■■ 4.23
UBAP2L-209ENST00000437652 NCOA2Q15596 1464 aa41.43■■■■■ 4.22
UBAP2L-209ENST00000437652 MBD5Q9P267 1494 aa41.42■■■■■ 4.22
UBAP2L-209ENST00000437652 VPS8Q8N3P4 1428 aa41.42■■■■■ 4.22
UBAP2L-209ENST00000437652 GGT6Q6P531 493 aa41.41■■■■■ 4.22
UBAP2L-209ENST00000437652 DMRT2Q9Y5R5 561 aa41.4■■■■■ 4.22
UBAP2L-209ENST00000437652 RSPH4AQ5TD94 716 aa41.38■■■■■ 4.21
UBAP2L-209ENST00000437652 ZMYM3Q14202 1370 aa41.37■■■■■ 4.21
UBAP2L-209ENST00000437652 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa41.35■■■■■ 4.21
UBAP2L-209ENST00000437652 ADGBQ8N7X0 1667 aa41.34■■■■■ 4.21
UBAP2L-209ENST00000437652 PLXNC1O60486 1568 aa41.33■■■■■ 4.21
UBAP2L-209ENST00000437652 PPP6R1Q9UPN7 881 aa41.32■■■■■ 4.21
UBAP2L-209ENST00000437652 MROH2AA6NES4 1674 aa41.3■■■■■ 4.2
UBAP2L-209ENST00000437652 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa41.28■■■■■ 4.2
UBAP2L-209ENST00000437652 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa41.28■■■■■ 4.2
UBAP2L-209ENST00000437652 CERKQ8TCT0 537 aa41.26■■■■■ 4.2
UBAP2L-209ENST00000437652 STRCQ7RTU9 1775 aa41.26■■■■■ 4.2
UBAP2L-209ENST00000437652 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP41.25■■■■■ 4.19
UBAP2L-209ENST00000437652 TSPY4P0CV99 314 aa41.25■■■■■ 4.19
UBAP2L-209ENST00000437652 TSPY10P0CW01 314 aa41.25■■■■■ 4.19
UBAP2L-209ENST00000437652 CCDC141Q6ZP82 1450 aa41.25■■■■■ 4.19
UBAP2L-209ENST00000437652 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP41.25■■■■■ 4.19
UBAP2L-209ENST00000437652 NPATQ14207 1427 aa41.25■■■■■ 4.19
UBAP2L-209ENST00000437652 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP41.22■■■■■ 4.19
UBAP2L-209ENST00000437652 KIF3BO15066 747 aa41.19■■■■■ 4.18
UBAP2L-209ENST00000437652 MAP3K1Q13233 1512 aa41.18■■■■■ 4.18
UBAP2L-209ENST00000437652 APLP2Q06481 763 aa41.15■■■■■ 4.18
UBAP2L-209ENST00000437652 ARHGEF5Q12774 1597 aa41.1■■■■■ 4.17
UBAP2L-209ENST00000437652 PTPRTO14522 1441 aa41.1■■■■■ 4.17
UBAP2L-209ENST00000437652 PTPRKQ15262 1439 aa41.09■■■■■ 4.17
UBAP2L-209ENST00000437652 NCOA1Q15788 1441 aa41.04■■■■■ 4.16
UBAP2L-209ENST00000437652 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa41.02■■■■■ 4.16
UBAP2L-209ENST00000437652 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa41.01■■■■■ 4.16
UBAP2L-209ENST00000437652 MYOM3Q5VTT5 1437 aa41.01■■■■■ 4.15
UBAP2L-209ENST00000437652 MIA2Q96PC5 1412 aa41.01■■■■■ 4.15
UBAP2L-209ENST00000437652 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa40.96■■■■■ 4.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms