RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437028.5

SNHG11-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 11, humanhuman

TSL 3

Gene SNHG11, Length 1,169 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG11-208ENST00000437028 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.24■■□□□ 1.63
SNHG11-208ENST00000437028 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.24■■□□□ 1.63
SNHG11-208ENST00000437028 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
SNHG11-208ENST00000437028 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
SNHG11-208ENST00000437028 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
SNHG11-208ENST00000437028 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.19■■□□□ 1.62
SNHG11-208ENST00000437028 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.17■■□□□ 1.62
SNHG11-208ENST00000437028 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.16■■□□□ 1.62
SNHG11-208ENST00000437028 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.16■■□□□ 1.62
SNHG11-208ENST00000437028 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.15■■□□□ 1.62
SNHG11-208ENST00000437028 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.13■■□□□ 1.61
SNHG11-208ENST00000437028 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
SNHG11-208ENST00000437028 ATP10AO60312 1499 aa25.11■■□□□ 1.61
SNHG11-208ENST00000437028 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.1■■□□□ 1.61
SNHG11-208ENST00000437028 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.09■■□□□ 1.61
SNHG11-208ENST00000437028 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.08■■□□□ 1.6
SNHG11-208ENST00000437028 LMTK3Q96Q04 1460 aa25.07■■□□□ 1.6
SNHG11-208ENST00000437028 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.07■■□□□ 1.6
SNHG11-208ENST00000437028 MLECQ14165 292 aa25.06■■□□□ 1.6
SNHG11-208ENST00000437028 KDM5CP41229 1560 aa25.05■■□□□ 1.6
SNHG11-208ENST00000437028 PREX2Q70Z35 1606 aa25.05■■□□□ 1.6
SNHG11-208ENST00000437028 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.04■■□□□ 1.6
SNHG11-208ENST00000437028 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.03■■□□□ 1.6
SNHG11-208ENST00000437028 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.02■■□□□ 1.6
SNHG11-208ENST00000437028 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.01■■□□□ 1.59
SNHG11-208ENST00000437028 AFAP1Q8N556 730 aa25.01■■□□□ 1.59
SNHG11-208ENST00000437028 ABCC1P33527 1531 aa24.98■■□□□ 1.59
SNHG11-208ENST00000437028 MLH3Q9UHC1 1453 aa24.97■■□□□ 1.59
SNHG11-208ENST00000437028 REREQ9P2R6 1566 aa24.97■■□□□ 1.59
SNHG11-208ENST00000437028 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa24.96■■□□□ 1.59
SNHG11-208ENST00000437028 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.95■■□□□ 1.58
SNHG11-208ENST00000437028 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.95■■□□□ 1.58
SNHG11-208ENST00000437028 ABCA6Q8N139 1617 aa24.91■■□□□ 1.58
SNHG11-208ENST00000437028 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.91■■□□□ 1.58
SNHG11-208ENST00000437028 FBXO41Q8TF61 875 aa24.9■■□□□ 1.58
SNHG11-208ENST00000437028 HSPA2P54652 639 aa24.89■■□□□ 1.58
SNHG11-208ENST00000437028 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.88■■□□□ 1.57
SNHG11-208ENST00000437028 AGLP35573 1532 aa24.87■■□□□ 1.57
SNHG11-208ENST00000437028 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
SNHG11-208ENST00000437028 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
SNHG11-208ENST00000437028 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
SNHG11-208ENST00000437028 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.84■■□□□ 1.57
SNHG11-208ENST00000437028 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.83■■□□□ 1.57
SNHG11-208ENST00000437028 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.83■■□□□ 1.56
SNHG11-208ENST00000437028 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.82■■□□□ 1.56
SNHG11-208ENST00000437028 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.81■■□□□ 1.56
SNHG11-208ENST00000437028 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
SNHG11-208ENST00000437028 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.81■■□□□ 1.56
SNHG11-208ENST00000437028 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
SNHG11-208ENST00000437028 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.79■■□□□ 1.56
SNHG11-208ENST00000437028 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.78■■□□□ 1.56
SNHG11-208ENST00000437028 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
SNHG11-208ENST00000437028 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
SNHG11-208ENST00000437028 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.78■■□□□ 1.56
SNHG11-208ENST00000437028 C3P01024 1663 aa24.75■■□□□ 1.55
SNHG11-208ENST00000437028 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.74■■□□□ 1.55
SNHG11-208ENST00000437028 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.74■■□□□ 1.55
SNHG11-208ENST00000437028 ATP7AQ04656 1500 aa24.72■■□□□ 1.55
SNHG11-208ENST00000437028 CEP162Q5TB80 1403 aa24.72■■□□□ 1.55
SNHG11-208ENST00000437028 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.72■■□□□ 1.55
SNHG11-208ENST00000437028 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
SNHG11-208ENST00000437028 TIAM1Q13009 1591 aa24.68■■□□□ 1.54
SNHG11-208ENST00000437028 MROH2AA6NES4 1674 aa24.68■■□□□ 1.54
SNHG11-208ENST00000437028 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
SNHG11-208ENST00000437028 A2MP01023 1474 aa24.65■■□□□ 1.54
SNHG11-208ENST00000437028 PLXNC1O60486 1568 aa24.65■■□□□ 1.54
SNHG11-208ENST00000437028 CERKQ8TCT0 537 aa24.64■■□□□ 1.54
SNHG11-208ENST00000437028 STRCQ7RTU9 1775 aa24.63■■□□□ 1.53
SNHG11-208ENST00000437028 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.62■■□□□ 1.53
SNHG11-208ENST00000437028 NPATQ14207 1427 aa24.62■■□□□ 1.53
SNHG11-208ENST00000437028 ZMYM3Q14202 1370 aa24.59■■□□□ 1.53
SNHG11-208ENST00000437028 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.58■■□□□ 1.53
SNHG11-208ENST00000437028 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.52
SNHG11-208ENST00000437028 MBD5Q9P267 1494 aa24.58■■□□□ 1.52
SNHG11-208ENST00000437028 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
SNHG11-208ENST00000437028 PTPRTO14522 1441 aa24.57■■□□□ 1.52
SNHG11-208ENST00000437028 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.56■■□□□ 1.52
SNHG11-208ENST00000437028 GGT6Q6P531 493 aa24.55■■□□□ 1.52
SNHG11-208ENST00000437028 NCOA2Q15596 1464 aa24.55■■□□□ 1.52
SNHG11-208ENST00000437028 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.53■■□□□ 1.52
SNHG11-208ENST00000437028 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.52■■□□□ 1.52
SNHG11-208ENST00000437028 NCOA1Q15788 1441 aa24.52■■□□□ 1.52
SNHG11-208ENST00000437028 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.51■■□□□ 1.51
SNHG11-208ENST00000437028 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
SNHG11-208ENST00000437028 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.49■■□□□ 1.51
SNHG11-208ENST00000437028 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa24.48■■□□□ 1.51
SNHG11-208ENST00000437028 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.47■■□□□ 1.51
SNHG11-208ENST00000437028 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
SNHG11-208ENST00000437028 PTPRKQ15262 1439 aa24.46■■□□□ 1.51
SNHG11-208ENST00000437028 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.44■■□□□ 1.5
SNHG11-208ENST00000437028 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.43■■□□□ 1.5
SNHG11-208ENST00000437028 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.43■■□□□ 1.5
SNHG11-208ENST00000437028 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.43■■□□□ 1.5
SNHG11-208ENST00000437028 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
SNHG11-208ENST00000437028 TSPY4P0CV99 314 aa24.42■■□□□ 1.5
SNHG11-208ENST00000437028 TSPY10P0CW01 314 aa24.42■■□□□ 1.5
SNHG11-208ENST00000437028 PLA2R1Q13018 1463 aa24.4■■□□□ 1.5
SNHG11-208ENST00000437028 KIF3BO15066 747 aa24.4■■□□□ 1.5
SNHG11-208ENST00000437028 MAP3K1Q13233 1512 aa24.4■■□□□ 1.5
SNHG11-208ENST00000437028 PKD2Q13563 968 aa24.39■■□□□ 1.49
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