RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 GRIN2AQ12879 1464 aa20.57■□□□□ 0.88
TOP3B-206ENST00000436282 CNTLNQ9NXG0 1405 aa20.57■□□□□ 0.88
TOP3B-206ENST00000436282 DISP1Q96F81 1524 aa20.56■□□□□ 0.88
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
TOP3B-206ENST00000436282 GCC2Q8IWJ2 1684 aa20.55■□□□□ 0.88
TOP3B-206ENST00000436282 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
TOP3B-206ENST00000436282 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
TOP3B-206ENST00000436282 FOXD1Q16676 465 aa20.53■□□□□ 0.88
TOP3B-206ENST00000436282 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP20.53■□□□□ 0.88
TOP3B-206ENST00000436282 MIA2Q96PC5 1412 aa20.53■□□□□ 0.88
TOP3B-206ENST00000436282 KIAA0556O60303 1618 aa20.53■□□□□ 0.88
TOP3B-206ENST00000436282 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
TOP3B-206ENST00000436282 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
TOP3B-206ENST00000436282 MPHOSPH9Q99550 1183 aa20.5■□□□□ 0.87
TOP3B-206ENST00000436282 MYT1LQ9UL68 1186 aa20.5■□□□□ 0.87
TOP3B-206ENST00000436282 AKNAQ7Z591 1439 aa20.48■□□□□ 0.87
TOP3B-206ENST00000436282 CCDC184Q52MB2 194 aa20.48■□□□□ 0.87
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
TOP3B-206ENST00000436282 KDM6BO15054 1643 aa20.47■□□□□ 0.87
TOP3B-206ENST00000436282 NCOA1Q15788 1441 aa20.47■□□□□ 0.87
TOP3B-206ENST00000436282 ZBED9Q6R2W3 1325 aa20.47■□□□□ 0.87
TOP3B-206ENST00000436282 JPH4Q96JJ6 628 aa20.46■□□□□ 0.87
TOP3B-206ENST00000436282 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
TOP3B-206ENST00000436282 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
TOP3B-206ENST00000436282 CCDC7Q96M83 1385 aa20.45■□□□□ 0.86
TOP3B-206ENST00000436282 PLB1Q6P1J6 1458 aa20.44■□□□□ 0.86
TOP3B-206ENST00000436282 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
TOP3B-206ENST00000436282 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa20.44■□□□□ 0.86
TOP3B-206ENST00000436282 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
TOP3B-206ENST00000436282 DAPK1P53355 1430 aa20.43■□□□□ 0.86
TOP3B-206ENST00000436282 SYNJ2O15056 1496 aa20.43■□□□□ 0.86
TOP3B-206ENST00000436282 ABCC5O15440 1437 aa20.42■□□□□ 0.86
TOP3B-206ENST00000436282 CEP170Q5SW79 1584 aa20.41■□□□□ 0.86
TOP3B-206ENST00000436282 FAM9BQ8IZU0 186 aa20.41■□□□□ 0.86
TOP3B-206ENST00000436282 MRS2Q9HD23 443 aa20.41■□□□□ 0.86
TOP3B-206ENST00000436282 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
TOP3B-206ENST00000436282 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa20.4■□□□□ 0.86
TOP3B-206ENST00000436282 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
TOP3B-206ENST00000436282 L3MBTL2Q969R5 705 aa20.39■□□□□ 0.85
TOP3B-206ENST00000436282 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
TOP3B-206ENST00000436282 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
TOP3B-206ENST00000436282 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa20.38■□□□□ 0.85
TOP3B-206ENST00000436282 ROCK1Q13464 1354 aa20.34■□□□□ 0.85
TOP3B-206ENST00000436282 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
TOP3B-206ENST00000436282 PLEKHD1A6NEE1 506 aa20.32■□□□□ 0.84
TOP3B-206ENST00000436282 TEX14Q8IWB6 1497 aa20.31■□□□□ 0.84
TOP3B-206ENST00000436282 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
TOP3B-206ENST00000436282 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa20.31■□□□□ 0.84
TOP3B-206ENST00000436282 NUP160Q12769 1436 aa20.3■□□□□ 0.84
TOP3B-206ENST00000436282 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
TOP3B-206ENST00000436282 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
TOP3B-206ENST00000436282 KIF7Q2M1P5 1343 aa20.3■□□□□ 0.84
TOP3B-206ENST00000436282 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa20.29■□□□□ 0.84
TOP3B-206ENST00000436282 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
TOP3B-206ENST00000436282 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa20.29■□□□□ 0.84
TOP3B-206ENST00000436282 DEKP35659 375 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
TOP3B-206ENST00000436282 NBPF8Q3BBV2 869 aa20.28■□□□□ 0.84
TOP3B-206ENST00000436282 KIF14Q15058 1648 aa20.27■□□□□ 0.84
TOP3B-206ENST00000436282 RNF123Q5XPI4 1314 aa20.23■□□□□ 0.83
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
TOP3B-206ENST00000436282 NUDCQ9Y266 331 aa20.21■□□□□ 0.83
TOP3B-206ENST00000436282 PKD2Q13563 968 aa20.2■□□□□ 0.82
TOP3B-206ENST00000436282 ATP10BO94823 1461 aa20.2■□□□□ 0.82
TOP3B-206ENST00000436282 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
TOP3B-206ENST00000436282 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa20.19■□□□□ 0.82
TOP3B-206ENST00000436282 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
TOP3B-206ENST00000436282 ITSN2Q9NZM3 1697 aa20.17■□□□□ 0.82
TOP3B-206ENST00000436282 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP20.17■□□□□ 0.82
TOP3B-206ENST00000436282 PZPP20742 1482 aa20.17■□□□□ 0.82
TOP3B-206ENST00000436282 PTPRGP23470 1445 aa20.17■□□□□ 0.82
TOP3B-206ENST00000436282 TSPY4P0CV99 314 aa20.16■□□□□ 0.82
TOP3B-206ENST00000436282 TSPY10P0CW01 314 aa20.16■□□□□ 0.82
TOP3B-206ENST00000436282 CCDC136Q96JN2 1154 aa20.16■□□□□ 0.82
TOP3B-206ENST00000436282 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
TOP3B-206ENST00000436282 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa20.14■□□□□ 0.81
TOP3B-206ENST00000436282 ABCA8O94911 1581 aa20.14■□□□□ 0.81
TOP3B-206ENST00000436282 NBR1Q14596 966 aa20.14■□□□□ 0.81
TOP3B-206ENST00000436282 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
TOP3B-206ENST00000436282 MBD5Q9P267 1494 aa20.13■□□□□ 0.81
TOP3B-206ENST00000436282 BCORL1Q5H9F3 1711 aa20.13■□□□□ 0.81
TOP3B-206ENST00000436282 ADCY10Q96PN6 1610 aa20.12■□□□□ 0.81
TOP3B-206ENST00000436282 NUP155O75694 1391 aa20.12■□□□□ 0.81
TOP3B-206ENST00000436282 POLR3GLQ9BT43 218 aa20.12■□□□□ 0.81
TOP3B-206ENST00000436282 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
TOP3B-206ENST00000436282 C9orf84Q5VXU9 1444 aa20.1■□□□□ 0.81
TOP3B-206ENST00000436282 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa20.1■□□□□ 0.81
TOP3B-206ENST00000436282 ADGRL2O95490 1459 aa20.1■□□□□ 0.81
TOP3B-206ENST00000436282 ABCC10Q5T3U5 1492 aa20.1■□□□□ 0.81
TOP3B-206ENST00000436282 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
TOP3B-206ENST00000436282 USP47Q96K76 1375 aa20.08■□□□□ 0.81
TOP3B-206ENST00000436282 ADGBQ8N7X0 1667 aa20.07■□□□□ 0.8
TOP3B-206ENST00000436282 KDM5CP41229 1560 aa20.07■□□□□ 0.8
TOP3B-206ENST00000436282 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
TOP3B-206ENST00000436282 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa20.06■□□□□ 0.8
TOP3B-206ENST00000436282 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
TOP3B-206ENST00000436282 KIF15Q9NS87 1388 aa20.04■□□□□ 0.8
TOP3B-206ENST00000436282 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa20.04■□□□□ 0.8
TOP3B-206ENST00000436282 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
TOP3B-206ENST00000436282 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
TOP3B-206ENST00000436282 CROCC2H7BZ55 1655 aa20.02■□□□□ 0.8
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