RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427658.1

AFG3L1P-208, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, human

TSL 2

Gene AFG3L1P, Length 2,758 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		14.23	□□□□□ -0.13
AFG3L1P-208	ENST00000427658	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		14.22	□□□□□ -0.13
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	14.22	□□□□□ -0.13
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	14.22	□□□□□ -0.13
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FMN1	Q68DA7	1419 aa		14.2	□□□□□ -0.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GSE1	Q14687	1217 aa		14.2	□□□□□ -0.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		14.19	□□□□□ -0.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		14.19	□□□□□ -0.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	JPH4	Q96JJ6	628 aa		14.19	□□□□□ -0.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		14.19	□□□□□ -0.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		14.19	□□□□□ -0.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MAP3K1	Q13233	1512 aa		14.18	□□□□□ -0.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		14.18	□□□□□ -0.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	14.16	□□□□□ -0.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		14.15	□□□□□ -0.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HECW1	Q76N89	1606 aa		14.15	□□□□□ -0.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		14.15	□□□□□ -0.14
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		14.15	□□□□□ -0.15
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	14.14	□□□□□ -0.15
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		14.14	□□□□□ -0.15
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	14.13	□□□□□ -0.15
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ABCA8	O94911	1581 aa		14.13	□□□□□ -0.15
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TIAM1	Q13009	1591 aa		14.13	□□□□□ -0.15
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	14.12	□□□□□ -0.15
AFG3L1P-208	ENST00000427658	P3H3	Q8IVL6	736 aa		14.11	□□□□□ -0.15
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		14.11	□□□□□ -0.15
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		14.11	□□□□□ -0.15
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		14.11	□□□□□ -0.15
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		14.08	□□□□□ -0.16
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MAPKBP1	O60336	1514 aa		14.07	□□□□□ -0.16
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ARHGEF11	O15085	1522 aa		14.07	□□□□□ -0.16
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	14.06	□□□□□ -0.16
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		14.05	□□□□□ -0.16
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	14.04	□□□□□ -0.16
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		14.04	□□□□□ -0.16
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PTPRG	P23470	1445 aa		14.04	□□□□□ -0.16
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NFKBIB	Q15653	356 aa		14.04	□□□□□ -0.16
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	14.03	□□□□□ -0.16
AFG3L1P-208	ENST00000427658	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		14.03	□□□□□ -0.16
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	14.03	□□□□□ -0.16
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ABCC2	Q92887	1545 aa		14.02	□□□□□ -0.16
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		14.02	□□□□□ -0.17
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		14.01	□□□□□ -0.17
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCDC184	Q52MB2	194 aa		14	□□□□□ -0.17
AFG3L1P-208	ENST00000427658	UACA	Q9BZF9	1416 aa		14	□□□□□ -0.17
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		14	□□□□□ -0.17
AFG3L1P-208	ENST00000427658		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	14	□□□□□ -0.17
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		13.98	□□□□□ -0.17
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		13.98	□□□□□ -0.17
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		13.98	□□□□□ -0.17
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PDE4A	P27815	886 aa		13.97	□□□□□ -0.17
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		13.97	□□□□□ -0.17
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.18
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ATP10B	O94823	1461 aa		13.95	□□□□□ -0.18
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		13.94	□□□□□ -0.18
AFG3L1P-208	ENST00000427658	AKNA	Q7Z591	1439 aa		13.94	□□□□□ -0.18
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		13.94	□□□□□ -0.18
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BACH2	Q9BYV9	841 aa		13.94	□□□□□ -0.18
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
AFG3L1P-208	ENST00000427658	AAMP	Q13685	434 aa		13.92	□□□□□ -0.18
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		13.9	□□□□□ -0.18
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FGD1	P98174	961 aa		13.9	□□□□□ -0.18
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLC4A3	P48751	1232 aa		13.89	□□□□□ -0.19
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		13.88	□□□□□ -0.19
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		13.88	□□□□□ -0.19
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NCOA2	Q15596	1464 aa		13.87	□□□□□ -0.19
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MRS2	Q9HD23	443 aa		13.86	□□□□□ -0.19
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KIF14	Q15058	1648 aa		13.86	□□□□□ -0.19
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		13.86	□□□□□ -0.19
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		13.84	□□□□□ -0.19
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MS4A1	P11836	297 aa		13.83	□□□□□ -0.19
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NUDC	Q9Y266	331 aa		13.83	□□□□□ -0.19
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		13.83	□□□□□ -0.19
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PDE4C	Q08493	712 aa		13.83	□□□□□ -0.2
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		13.83	□□□□□ -0.2
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		13.82	□□□□□ -0.2
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		13.8	□□□□□ -0.2
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	13.79	□□□□□ -0.2
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		13.79	□□□□□ -0.2
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PREX2	Q70Z35	1606 aa		13.79	□□□□□ -0.2
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ARID3C	A6NKF2	412 aa		13.78	□□□□□ -0.2
AFG3L1P-208	ENST00000427658	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		13.78	□□□□□ -0.2
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		13.78	□□□□□ -0.2
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		13.78	□□□□□ -0.2
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CLCN1	P35523	988 aa		13.77	□□□□□ -0.2

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.2 ms