RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426677.6

TOMM40-203, Transcript of translocase of outer mitochondrial membrane 40, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOMM40, Length 1,725 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM40-203ENST00000426677 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP36.71■■■■□ 3.47
TOMM40-203ENST00000426677 PLCH2O75038 1416 aa36.71■■■■□ 3.47
TOMM40-203ENST00000426677 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP36.71■■■■□ 3.47
TOMM40-203ENST00000426677 ARHGAP5Q13017 1502 aa36.71■■■■□ 3.47
TOMM40-203ENST00000426677 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP36.71■■■■□ 3.47
TOMM40-203ENST00000426677 CD109Q6YHK3 1445 aa36.7■■■■□ 3.47
TOMM40-203ENST00000426677 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.67■■■■□ 3.46
TOMM40-203ENST00000426677 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP36.67■■■■□ 3.46
TOMM40-203ENST00000426677 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP36.65■■■■□ 3.46
TOMM40-203ENST00000426677 MIA2Q96PC5 1412 aa36.64■■■■□ 3.46
TOMM40-203ENST00000426677 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa36.62■■■■□ 3.45
TOMM40-203ENST00000426677 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP36.6■■■■□ 3.45
TOMM40-203ENST00000426677 ARAP3Q8WWN8 1544 aa36.6■■■■□ 3.45
TOMM40-203ENST00000426677 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP36.59■■■■□ 3.45
TOMM40-203ENST00000426677 FANCAO15360 1455 aa36.58■■■■□ 3.45
TOMM40-203ENST00000426677 HRCP23327 699 aa36.58■■■■□ 3.45
TOMM40-203ENST00000426677 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.55■■■■□ 3.44
TOMM40-203ENST00000426677 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa36.52■■■■□ 3.44
TOMM40-203ENST00000426677 SYCP2Q9BX26 1530 aa36.51■■■■□ 3.44
TOMM40-203ENST00000426677 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa36.5■■■■□ 3.43
TOMM40-203ENST00000426677 ABCC1P33527 1531 aa36.5■■■■□ 3.43
TOMM40-203ENST00000426677 ITGAEP38570 1179 aa36.45■■■■□ 3.43
TOMM40-203ENST00000426677 CFAP74Q9C0B2 1584 aa36.45■■■■□ 3.43
TOMM40-203ENST00000426677 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP36.45■■■■□ 3.437e-7■■■□□ 18.5
TOMM40-203ENST00000426677 AKNAQ7Z591 1439 aa36.45■■■■□ 3.42
TOMM40-203ENST00000426677 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP36.43■■■■□ 3.42
TOMM40-203ENST00000426677 MBD5Q9P267 1494 aa36.42■■■■□ 3.42
TOMM40-203ENST00000426677 PTPRKQ15262 1439 aa36.41■■■■□ 3.42
TOMM40-203ENST00000426677 ADGRL1O94910 1474 aa36.41■■■■□ 3.42
TOMM40-203ENST00000426677 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP36.41■■■■□ 3.42
TOMM40-203ENST00000426677 CROCC2H7BZ55 1655 aa36.39■■■■□ 3.42
TOMM40-203ENST00000426677 NEO1Q92859 1461 aa36.39■■■■□ 3.42
TOMM40-203ENST00000426677 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa36.37■■■■□ 3.41
TOMM40-203ENST00000426677 ABCC5O15440 1437 aa36.36■■■■□ 3.41
TOMM40-203ENST00000426677 DAPK1P53355 1430 aa36.35■■■■□ 3.41
TOMM40-203ENST00000426677 SCAPERQ9BY12 1400 aa36.35■■■■□ 3.41
TOMM40-203ENST00000426677 ARHGEF5Q12774 1597 aa36.35■■■■□ 3.41
TOMM40-203ENST00000426677 TEX14Q8IWB6 1497 aa36.34■■■■□ 3.41
TOMM40-203ENST00000426677 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa36.33■■■■□ 3.41
TOMM40-203ENST00000426677 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa36.33■■■■□ 3.41
TOMM40-203ENST00000426677 CCDC141Q6ZP82 1450 aa36.28■■■■□ 3.4
TOMM40-203ENST00000426677 RICTORQ6R327 1708 aa36.28■■■■□ 3.4
TOMM40-203ENST00000426677 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa36.27■■■■□ 3.4
TOMM40-203ENST00000426677 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP36.26■■■■□ 3.4
TOMM40-203ENST00000426677 AFAP1Q8N556 730 aa36.26■■■■□ 3.4
TOMM40-203ENST00000426677 CHIC2Q9UKJ5 165 aa36.25■■■■□ 3.39
TOMM40-203ENST00000426677 POGZQ7Z3K3 1410 aa36.22■■■■□ 3.39
TOMM40-203ENST00000426677 RAPGEF3O95398 923 aa36.22■■■■□ 3.39
TOMM40-203ENST00000426677 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP36.19■■■■□ 3.38
TOMM40-203ENST00000426677 ADGBQ8N7X0 1667 aa36.19■■■■□ 3.38
TOMM40-203ENST00000426677 C9orf84Q5VXU9 1444 aa36.17■■■■□ 3.38
TOMM40-203ENST00000426677 KDM5CP41229 1560 aa36.16■■■■□ 3.38
TOMM40-203ENST00000426677 SHANK2Q9UPX8 1470 aa36.15■■■■□ 3.38
TOMM40-203ENST00000426677 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa36.14■■■■□ 3.38
TOMM40-203ENST00000426677 MAST1Q9Y2H9 1570 aa36.14■■■■□ 3.38
TOMM40-203ENST00000426677 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP36.13■■■■□ 3.37
TOMM40-203ENST00000426677 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa36.12■■■■□ 3.37
TOMM40-203ENST00000426677 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa36.12■■■■□ 3.37
TOMM40-203ENST00000426677 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa36.08■■■■□ 3.37
TOMM40-203ENST00000426677 ATP7AQ04656 1500 aa36.07■■■■□ 3.36
TOMM40-203ENST00000426677 RSPH4AQ5TD94 716 aa36.07■■■■□ 3.36
TOMM40-203ENST00000426677 ADGRL2O95490 1459 aa36.07■■■■□ 3.36
TOMM40-203ENST00000426677 TSPY4P0CV99 314 aa36.06■■■■□ 3.36
TOMM40-203ENST00000426677 TSPY10P0CW01 314 aa36.06■■■■□ 3.36
TOMM40-203ENST00000426677 HECW2Q9P2P5 1572 aa36.06■■■■□ 3.36
TOMM40-203ENST00000426677 KDM6BO15054 1643 aa36.05■■■■□ 3.36
TOMM40-203ENST00000426677 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP36.05■■■■□ 3.36
TOMM40-203ENST00000426677 NCOA1Q15788 1441 aa36.04■■■■□ 3.36
TOMM40-203ENST00000426677 GCC2Q8IWJ2 1684 aa36.02■■■■□ 3.36
TOMM40-203ENST00000426677 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa36.01■■■■□ 3.36
TOMM40-203ENST00000426677 PLXNC1O60486 1568 aa36.01■■■■□ 3.36
TOMM40-203ENST00000426677 ABCA6Q8N139 1617 aa36.01■■■■□ 3.35
TOMM40-203ENST00000426677 NAIPQ13075 1403 aa35.99■■■■□ 3.35
TOMM40-203ENST00000426677 ROCK1Q13464 1354 aa35.99■■■■□ 3.35
TOMM40-203ENST00000426677 MLH3Q9UHC1 1453 aa35.98■■■■□ 3.35
TOMM40-203ENST00000426677 YEATS2Q9ULM3 1422 aa35.98■■■■□ 3.35
TOMM40-203ENST00000426677 HFM1A2PYH4 1435 aa35.96■■■■□ 3.35
TOMM40-203ENST00000426677 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa35.96■■■■□ 3.35
TOMM40-203ENST00000426677 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa35.95■■■■□ 3.35
TOMM40-203ENST00000426677 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP35.94■■■■□ 3.34
TOMM40-203ENST00000426677 MYT1LQ9UL68 1186 aa35.94■■■■□ 3.34
TOMM40-203ENST00000426677 KIF15Q9NS87 1388 aa35.93■■■■□ 3.34
TOMM40-203ENST00000426677 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa35.93■■■■□ 3.34
TOMM40-203ENST00000426677 SETD5Q9C0A6 1442 aa35.88■■■■□ 3.33
TOMM40-203ENST00000426677 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa35.86■■■■□ 3.33
TOMM40-203ENST00000426677 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa35.85■■■■□ 3.33
TOMM40-203ENST00000426677 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa35.82■■■■□ 3.32
TOMM40-203ENST00000426677 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.82■■■■□ 3.32
TOMM40-203ENST00000426677 MAGI2Q86UL8 1455 aa35.79■■■■□ 3.32
TOMM40-203ENST00000426677 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa35.79■■■■□ 3.32
TOMM40-203ENST00000426677 A2MP01023 1474 aa35.76■■■■□ 3.32
TOMM40-203ENST00000426677 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
TOMM40-203ENST00000426677 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP35.71■■■■□ 3.31
TOMM40-203ENST00000426677 ATP10AO60312 1499 aa35.7■■■■□ 3.31
TOMM40-203ENST00000426677 ERBINQ96RT1 1412 aa35.7■■■■□ 3.31
TOMM40-203ENST00000426677 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP35.65■■■■□ 3.3
TOMM40-203ENST00000426677 REREQ9P2R6 1566 aa35.63■■■■□ 3.29
TOMM40-203ENST00000426677 MROH1Q8NDA8 1641 aa35.63■■■■□ 3.29
TOMM40-203ENST00000426677 UNC13BO14795 1591 aa35.61■■■■□ 3.29
TOMM40-203ENST00000426677 BCORL1Q5H9F3 1711 aa35.6■■■■□ 3.29
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