RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424658.5

ARID4A-205, Transcript of AT-rich interaction domain 4A, humanhuman

TSL 2

Gene ARID4A, Length 582 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4A-205ENST00000424658 SCAPERQ9BY12 1400 aa40.98■■■■■ 4.15
ARID4A-205ENST00000424658 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP40.97■■■■■ 4.15
ARID4A-205ENST00000424658 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.93■■■■■ 4.14
ARID4A-205ENST00000424658 YEATS2Q9ULM3 1422 aa40.93■■■■■ 4.14
ARID4A-205ENST00000424658 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa40.93■■■■■ 4.14
ARID4A-205ENST00000424658 CLIP1P30622 1438 aa40.93■■■■■ 4.14
ARID4A-205ENST00000424658 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.91■■■■■ 4.14
ARID4A-205ENST00000424658 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa40.91■■■■■ 4.14
ARID4A-205ENST00000424658 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.89■■■■■ 4.14
ARID4A-205ENST00000424658 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP40.84■■■■■ 4.13
ARID4A-205ENST00000424658 ARHGAP5Q13017 1502 aa40.82■■■■■ 4.12
ARID4A-205ENST00000424658 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa40.81■■■■■ 4.12
ARID4A-205ENST00000424658 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa40.78■■■■■ 4.12
ARID4A-205ENST00000424658 FYCO1Q9BQS8 1478 aa40.78■■■■■ 4.12
ARID4A-205ENST00000424658 KDM5CP41229 1560 aa40.77■■■■■ 4.12
ARID4A-205ENST00000424658 ATP10AO60312 1499 aa40.75■■■■■ 4.11
ARID4A-205ENST00000424658 PREX2Q70Z35 1606 aa40.75■■■■■ 4.11
ARID4A-205ENST00000424658 C9orf84Q5VXU9 1444 aa40.71■■■■■ 4.11
ARID4A-205ENST00000424658 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP40.7■■■■■ 4.11
ARID4A-205ENST00000424658 LMTK3Q96Q04 1460 aa40.68■■■■■ 4.1
ARID4A-205ENST00000424658 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa40.67■■■■■ 4.1
ARID4A-205ENST00000424658 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa40.64■■■■■ 4.1
ARID4A-205ENST00000424658 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa40.64■■■■■ 4.1
ARID4A-205ENST00000424658 AFAP1Q8N556 730 aa40.63■■■■■ 4.09
ARID4A-205ENST00000424658 ABCC1P33527 1531 aa40.62■■■■■ 4.09
ARID4A-205ENST00000424658 MLH3Q9UHC1 1453 aa40.58■■■■■ 4.09
ARID4A-205ENST00000424658 REREQ9P2R6 1566 aa40.58■■■■■ 4.09
ARID4A-205ENST00000424658 ITSN2Q9NZM3 1697 aa40.58■■■■■ 4.09
ARID4A-205ENST00000424658 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa40.57■■■■■ 4.09
ARID4A-205ENST00000424658 MLECQ14165 292 aa40.56■■■■■ 4.08
ARID4A-205ENST00000424658 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa40.52■■■■■ 4.08
ARID4A-205ENST00000424658 ABCA6Q8N139 1617 aa40.52■■■■■ 4.08
ARID4A-205ENST00000424658 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP40.45■■■■■ 4.07
ARID4A-205ENST00000424658 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa40.43■■■■■ 4.06
ARID4A-205ENST00000424658 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa40.43■■■■■ 4.06
ARID4A-205ENST00000424658 AGLP35573 1532 aa40.42■■■■■ 4.06
ARID4A-205ENST00000424658 MYT1LQ9UL68 1186 aa40.4■■■■■ 4.06
ARID4A-205ENST00000424658 PLPPR3Q6T4P5 718 aa40.39■■■■■ 4.06
ARID4A-205ENST00000424658 PREX1Q8TCU6 1659 aa40.34■■■■■ 4.05
ARID4A-205ENST00000424658 SYCP2Q9BX26 1530 aa40.33■■■■■ 4.05
ARID4A-205ENST00000424658 HSPA2P54652 639 aa40.33■■■■■ 4.05
ARID4A-205ENST00000424658 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa40.31■■■■■ 4.04
ARID4A-205ENST00000424658 MTUS2Q5JR59 1369 aa40.29■■■■■ 4.04
ARID4A-205ENST00000424658 CEP162Q5TB80 1403 aa40.29■■■■■ 4.04
ARID4A-205ENST00000424658 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP40.28■■■■■ 4.04
ARID4A-205ENST00000424658 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP40.28■■■■■ 4.04
ARID4A-205ENST00000424658 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa40.27■■■■■ 4.04
ARID4A-205ENST00000424658 CCNB3Q8WWL7 1395 aa40.26■■■■■ 4.04
ARID4A-205ENST00000424658 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP40.26■■■■■ 4.04
ARID4A-205ENST00000424658 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP40.24■■■■■ 4.03
ARID4A-205ENST00000424658 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa40.24■■■■■ 4.03
ARID4A-205ENST00000424658 C3P01024 1663 aa40.21■■■■■ 4.03
ARID4A-205ENST00000424658 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP40.2■■■■■ 4.03
ARID4A-205ENST00000424658 FBXO41Q8TF61 875 aa40.2■■■■■ 4.03
ARID4A-205ENST00000424658 TIAM1Q13009 1591 aa40.19■■■■■ 4.02
ARID4A-205ENST00000424658 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP40.18■■■■■ 4.02
ARID4A-205ENST00000424658 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP40.18■■■■■ 4.02
ARID4A-205ENST00000424658 ATP7AQ04656 1500 aa40.17■■■■■ 4.02
ARID4A-205ENST00000424658 CNTLNQ9NXG0 1405 aa40.13■■■■■ 4.01
ARID4A-205ENST00000424658 PLXNC1O60486 1568 aa40.12■■■■■ 4.01
ARID4A-205ENST00000424658 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa40.11■■■■■ 4.01
ARID4A-205ENST00000424658 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP40.08■■■■■ 4.01
ARID4A-205ENST00000424658 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP40.08■■■■■ 4.01
ARID4A-205ENST00000424658 MROH2AA6NES4 1674 aa40.08■■■■■ 4.01
ARID4A-205ENST00000424658 MBD5Q9P267 1494 aa40.06■■■■■ 4
ARID4A-205ENST00000424658 STRCQ7RTU9 1775 aa40.05■■■■■ 4
ARID4A-205ENST00000424658 A2MP01023 1474 aa40.03■■■■■ 4
ARID4A-205ENST00000424658 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP40.01■■■■■ 4
ARID4A-205ENST00000424658 ADGBQ8N7X0 1667 aa40.01■■■■■ 4
ARID4A-205ENST00000424658 NCOA2Q15596 1464 aa39.96■■■■□ 3.99
ARID4A-205ENST00000424658 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa39.95■■■■□ 3.99
ARID4A-205ENST00000424658 NPATQ14207 1427 aa39.94■■■■□ 3.98
ARID4A-205ENST00000424658 DMRT2Q9Y5R5 561 aa39.91■■■■□ 3.98
ARID4A-205ENST00000424658 ZMYM3Q14202 1370 aa39.91■■■■□ 3.98
ARID4A-205ENST00000424658 VPS8Q8N3P4 1428 aa39.91■■■■□ 3.98
ARID4A-205ENST00000424658 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP39.9■■■■□ 3.98
ARID4A-205ENST00000424658 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.85■■■■□ 3.97
ARID4A-205ENST00000424658 CERKQ8TCT0 537 aa39.85■■■■□ 3.97
ARID4A-205ENST00000424658 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa39.85■■■■□ 3.97
ARID4A-205ENST00000424658 PPP6R1Q9UPN7 881 aa39.84■■■■□ 3.97
ARID4A-205ENST00000424658 CCDC141Q6ZP82 1450 aa39.83■■■■□ 3.97
ARID4A-205ENST00000424658 RSPH4AQ5TD94 716 aa39.81■■■■□ 3.96
ARID4A-205ENST00000424658 PTPRTO14522 1441 aa39.81■■■■□ 3.96
ARID4A-205ENST00000424658 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa39.81■■■■□ 3.96
ARID4A-205ENST00000424658 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP39.79■■■■□ 3.96
ARID4A-205ENST00000424658 GGT6Q6P531 493 aa39.78■■■■□ 3.96
ARID4A-205ENST00000424658 ARHGEF5Q12774 1597 aa39.77■■■■□ 3.96
ARID4A-205ENST00000424658 MAP3K1Q13233 1512 aa39.77■■■■□ 3.96
ARID4A-205ENST00000424658 NCOA1Q15788 1441 aa39.77■■■■□ 3.96
ARID4A-205ENST00000424658 PTPRKQ15262 1439 aa39.75■■■■□ 3.95
ARID4A-205ENST00000424658 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP39.73■■■■□ 3.95
ARID4A-205ENST00000424658 MYO3AQ8NEV4 1616 aa39.72■■■■□ 3.95
ARID4A-205ENST00000424658 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa39.69■■■■□ 3.94
ARID4A-205ENST00000424658 FAM135AQ9P2D6 1515 aa39.66■■■■□ 3.94
ARID4A-205ENST00000424658 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP39.63■■■■□ 3.94
ARID4A-205ENST00000424658 PLA2R1Q13018 1463 aa39.6■■■■□ 3.93
ARID4A-205ENST00000424658 KIF3BO15066 747 aa39.59■■■■□ 3.93
ARID4A-205ENST00000424658 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP39.59■■■■□ 3.93
ARID4A-205ENST00000424658 MAST1Q9Y2H9 1570 aa39.59■■■■□ 3.93
ARID4A-205ENST00000424658 KDM5DQ9BY66 1539 aa39.57■■■■□ 3.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms