RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417157.2

SLC13A3-205, Transcript of solute carrier family 13 member 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC13A3, Length 876 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3-205ENST00000417157 PREX2Q70Z35 1606 aa22.55■■□□□ 1.2
SLC13A3-205ENST00000417157 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.54■■□□□ 1.2
SLC13A3-205ENST00000417157 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.53■■□□□ 1.2
SLC13A3-205ENST00000417157 RICTORQ6R327 1708 aa22.53■■□□□ 1.2
SLC13A3-205ENST00000417157 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.52■■□□□ 1.19
SLC13A3-205ENST00000417157 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.5■■□□□ 1.19
SLC13A3-205ENST00000417157 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.48■■□□□ 1.19
SLC13A3-205ENST00000417157 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.48■■□□□ 1.19
SLC13A3-205ENST00000417157 TIAM1Q13009 1591 aa22.48■■□□□ 1.19
SLC13A3-205ENST00000417157 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.48■■□□□ 1.19
SLC13A3-205ENST00000417157 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.47■■□□□ 1.19
SLC13A3-205ENST00000417157 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.46■■□□□ 1.19
SLC13A3-205ENST00000417157 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.46■■□□□ 1.19
SLC13A3-205ENST00000417157 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.46■■□□□ 1.19
SLC13A3-205ENST00000417157 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
SLC13A3-205ENST00000417157 ABCC1P33527 1531 aa22.44■■□□□ 1.18
SLC13A3-205ENST00000417157 MAP3K1Q13233 1512 aa22.43■■□□□ 1.18
SLC13A3-205ENST00000417157 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
SLC13A3-205ENST00000417157 KDM5CP41229 1560 aa22.41■■□□□ 1.18
SLC13A3-205ENST00000417157 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.41■■□□□ 1.18
SLC13A3-205ENST00000417157 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
SLC13A3-205ENST00000417157 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.4■■□□□ 1.18
SLC13A3-205ENST00000417157 APLP2Q06481 763 aa22.38■■□□□ 1.17
SLC13A3-205ENST00000417157 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
SLC13A3-205ENST00000417157 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.38■■□□□ 1.17
SLC13A3-205ENST00000417157 NCOA2Q15596 1464 aa22.37■■□□□ 1.17
SLC13A3-205ENST00000417157 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.37■■□□□ 1.17
SLC13A3-205ENST00000417157 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
SLC13A3-205ENST00000417157 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.36■■□□□ 1.17
SLC13A3-205ENST00000417157 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.36■■□□□ 1.17
SLC13A3-205ENST00000417157 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.35■■□□□ 1.17
SLC13A3-205ENST00000417157 AFAP1Q8N556 730 aa22.34■■□□□ 1.17
SLC13A3-205ENST00000417157 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.34■■□□□ 1.17
SLC13A3-205ENST00000417157 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.34■■□□□ 1.17
SLC13A3-205ENST00000417157 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.33■■□□□ 1.17
SLC13A3-205ENST00000417157 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.33■■□□□ 1.17
SLC13A3-205ENST00000417157 ATP10AO60312 1499 aa22.33■■□□□ 1.16
SLC13A3-205ENST00000417157 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.32■■□□□ 1.16
SLC13A3-205ENST00000417157 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.32■■□□□ 1.16
SLC13A3-205ENST00000417157 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.28■■□□□ 1.16
SLC13A3-205ENST00000417157 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.26■■□□□ 1.15
SLC13A3-205ENST00000417157 REREQ9P2R6 1566 aa22.25■■□□□ 1.15
SLC13A3-205ENST00000417157 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.25■■□□□ 1.15
SLC13A3-205ENST00000417157 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.25■■□□□ 1.153e-6■■■■□ 21.2
SLC13A3-205ENST00000417157 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
SLC13A3-205ENST00000417157 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SLC13A3-205ENST00000417157 ABCA6Q8N139 1617 aa22.23■■□□□ 1.15
SLC13A3-205ENST00000417157 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.22■■□□□ 1.15
SLC13A3-205ENST00000417157 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.2■■□□□ 1.14
SLC13A3-205ENST00000417157 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.2■■□□□ 1.14
SLC13A3-205ENST00000417157 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SLC13A3-205ENST00000417157 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.2■■□□□ 1.14
SLC13A3-205ENST00000417157 ATP7AQ04656 1500 aa22.2■■□□□ 1.14
SLC13A3-205ENST00000417157 MADDQ8WXG6 1647 aa22.2■■□□□ 1.14
SLC13A3-205ENST00000417157 MIA2Q96PC5 1412 aa22.19■■□□□ 1.14
SLC13A3-205ENST00000417157 MBD5Q9P267 1494 aa22.19■■□□□ 1.14
SLC13A3-205ENST00000417157 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SLC13A3-205ENST00000417157 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.18■■□□□ 1.14
SLC13A3-205ENST00000417157 PTPRMP28827 1452 aa22.18■■□□□ 1.14
SLC13A3-205ENST00000417157 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.18■■□□□ 1.14
SLC13A3-205ENST00000417157 AGLP35573 1532 aa22.17■■□□□ 1.14
SLC13A3-205ENST00000417157 MLECQ14165 292 aa22.15■■□□□ 1.14
SLC13A3-205ENST00000417157 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.14■■□□□ 1.14
SLC13A3-205ENST00000417157 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.14■■□□□ 1.13
SLC13A3-205ENST00000417157 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SLC13A3-205ENST00000417157 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.1■■□□□ 1.13
SLC13A3-205ENST00000417157 A2MP01023 1474 aa22.09■■□□□ 1.13
SLC13A3-205ENST00000417157 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.08■■□□□ 1.13
SLC13A3-205ENST00000417157 TSPY4P0CV99 314 aa22.08■■□□□ 1.13
SLC13A3-205ENST00000417157 TSPY10P0CW01 314 aa22.08■■□□□ 1.13
SLC13A3-205ENST00000417157 PLXNC1O60486 1568 aa22.08■■□□□ 1.12
SLC13A3-205ENST00000417157 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SLC13A3-205ENST00000417157 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.05■■□□□ 1.12
SLC13A3-205ENST00000417157 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.02■■□□□ 1.12
SLC13A3-205ENST00000417157 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.02■■□□□ 1.12
SLC13A3-205ENST00000417157 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.02■■□□□ 1.12
SLC13A3-205ENST00000417157 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
SLC13A3-205ENST00000417157 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
SLC13A3-205ENST00000417157 SHANK2Q9UPX8 1470 aa21.98■■□□□ 1.11
SLC13A3-205ENST00000417157 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.96■■□□□ 1.11
SLC13A3-205ENST00000417157 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.95■■□□□ 1.1
SLC13A3-205ENST00000417157 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
SLC13A3-205ENST00000417157 DAPK1P53355 1430 aa21.93■■□□□ 1.1
SLC13A3-205ENST00000417157 CROCC2H7BZ55 1655 aa21.92■■□□□ 1.1
SLC13A3-205ENST00000417157 ABCC5O15440 1437 aa21.92■■□□□ 1.1
SLC13A3-205ENST00000417157 GGT6Q6P531 493 aa21.92■■□□□ 1.1
SLC13A3-205ENST00000417157 MROH2AA6NES4 1674 aa21.91■■□□□ 1.1
SLC13A3-205ENST00000417157 FAM135AQ9P2D6 1515 aa21.91■■□□□ 1.1
SLC13A3-205ENST00000417157 LMTK3Q96Q04 1460 aa21.9■■□□□ 1.1
SLC13A3-205ENST00000417157 KIF3BO15066 747 aa21.89■■□□□ 1.09
SLC13A3-205ENST00000417157 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
SLC13A3-205ENST00000417157 DUOX2Q9NRD8 1548 aa21.88■■□□□ 1.09
SLC13A3-205ENST00000417157 C3P01024 1663 aa21.88■■□□□ 1.09
SLC13A3-205ENST00000417157 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
SLC13A3-205ENST00000417157 PREX1Q8TCU6 1659 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC13A3-205ENST00000417157 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SLC13A3-205ENST00000417157 ZMYM3Q14202 1370 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC13A3-205ENST00000417157 KIF15Q9NS87 1388 aa21.86■■□□□ 1.09
SLC13A3-205ENST00000417157 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa21.85■■□□□ 1.09
SLC13A3-205ENST00000417157 KDM5DQ9BY66 1539 aa21.85■■□□□ 1.09
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