RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414620.1

ACTB-202, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-202ENST00000414620 CLIP1P30622 1438 aa25.35■■□□□ 1.65
ACTB-202ENST00000414620 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.35■■□□□ 1.65
ACTB-202ENST00000414620 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.33■■□□□ 1.65
ACTB-202ENST00000414620 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.33■■□□□ 1.65
ACTB-202ENST00000414620 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.33■■□□□ 1.65
ACTB-202ENST00000414620 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.32■■□□□ 1.64
ACTB-202ENST00000414620 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.32■■□□□ 1.64
ACTB-202ENST00000414620 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
ACTB-202ENST00000414620 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.31■■□□□ 1.64
ACTB-202ENST00000414620 PTPRMP28827 1452 aa25.3■■□□□ 1.64
ACTB-202ENST00000414620 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.28■■□□□ 1.64
ACTB-202ENST00000414620 PREX2Q70Z35 1606 aa25.28■■□□□ 1.64
ACTB-202ENST00000414620 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.27■■□□□ 1.64
ACTB-202ENST00000414620 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.26■■□□□ 1.63
ACTB-202ENST00000414620 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.25■■□□□ 1.63
ACTB-202ENST00000414620 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.21■■□□□ 1.63
ACTB-202ENST00000414620 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.2■■□□□ 1.63
ACTB-202ENST00000414620 KDM5CP41229 1560 aa25.18■■□□□ 1.62
ACTB-202ENST00000414620 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.18■■□□□ 1.62
ACTB-202ENST00000414620 ABCC1P33527 1531 aa25.17■■□□□ 1.62
ACTB-202ENST00000414620 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.15■■□□□ 1.62
ACTB-202ENST00000414620 MLECQ14165 292 aa25.15■■□□□ 1.62
ACTB-202ENST00000414620 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.14■■□□□ 1.62
ACTB-202ENST00000414620 ATP10AO60312 1499 aa25.14■■□□□ 1.61
ACTB-202ENST00000414620 ABCA6Q8N139 1617 aa25.12■■□□□ 1.61
ACTB-202ENST00000414620 AFAP1Q8N556 730 aa25.12■■□□□ 1.61
ACTB-202ENST00000414620 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.12■■□□□ 1.61
ACTB-202ENST00000414620 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.12■■□□□ 1.61
ACTB-202ENST00000414620 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.12■■□□□ 1.61
ACTB-202ENST00000414620 CEP162Q5TB80 1403 aa25.09■■□□□ 1.61
ACTB-202ENST00000414620 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.09■■□□□ 1.61
ACTB-202ENST00000414620 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.08■■□□□ 1.61
ACTB-202ENST00000414620 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.05■■□□□ 1.6
ACTB-202ENST00000414620 LMTK3Q96Q04 1460 aa25.04■■□□□ 1.6
ACTB-202ENST00000414620 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
ACTB-202ENST00000414620 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.03■■□□□ 1.6
ACTB-202ENST00000414620 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
ACTB-202ENST00000414620 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.02■■□□□ 1.6
ACTB-202ENST00000414620 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.02■■□□□ 1.6
ACTB-202ENST00000414620 REREQ9P2R6 1566 aa25.01■■□□□ 1.59
ACTB-202ENST00000414620 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25■■□□□ 1.59
ACTB-202ENST00000414620 TIAM1Q13009 1591 aa24.97■■□□□ 1.59
ACTB-202ENST00000414620 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.96■■□□□ 1.59
ACTB-202ENST00000414620 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
ACTB-202ENST00000414620 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.93■■□□□ 1.58
ACTB-202ENST00000414620 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
ACTB-202ENST00000414620 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.92■■□□□ 1.58
ACTB-202ENST00000414620 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
ACTB-202ENST00000414620 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.91■■□□□ 1.58
ACTB-202ENST00000414620 HSPA2P54652 639 aa24.91■■□□□ 1.58
ACTB-202ENST00000414620 AGLP35573 1532 aa24.91■■□□□ 1.58
ACTB-202ENST00000414620 C3P01024 1663 aa24.91■■□□□ 1.58
ACTB-202ENST00000414620 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
ACTB-202ENST00000414620 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
ACTB-202ENST00000414620 ATP7AQ04656 1500 aa24.89■■□□□ 1.57
ACTB-202ENST00000414620 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.89■■□□□ 1.57
ACTB-202ENST00000414620 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
ACTB-202ENST00000414620 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.86■■□□□ 1.57
ACTB-202ENST00000414620 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.56
ACTB-202ENST00000414620 NCOA2Q15596 1464 aa24.81■■□□□ 1.56
ACTB-202ENST00000414620 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.81■■□□□ 1.56
ACTB-202ENST00000414620 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
ACTB-202ENST00000414620 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.8■■□□□ 1.56
ACTB-202ENST00000414620 PLXNC1O60486 1568 aa24.8■■□□□ 1.56
ACTB-202ENST00000414620 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
ACTB-202ENST00000414620 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
ACTB-202ENST00000414620 MROH2AA6NES4 1674 aa24.77■■□□□ 1.56
ACTB-202ENST00000414620 A2MP01023 1474 aa24.77■■□□□ 1.56
ACTB-202ENST00000414620 MBD5Q9P267 1494 aa24.76■■□□□ 1.55
ACTB-202ENST00000414620 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.75■■□□□ 1.55
ACTB-202ENST00000414620 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.75■■□□□ 1.55
ACTB-202ENST00000414620 STRCQ7RTU9 1775 aa24.72■■□□□ 1.55
ACTB-202ENST00000414620 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.72■■□□□ 1.55
ACTB-202ENST00000414620 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.71■■□□□ 1.55
ACTB-202ENST00000414620 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.69■■□□□ 1.54
ACTB-202ENST00000414620 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.64■■□□□ 1.54
ACTB-202ENST00000414620 GGT6Q6P531 493 aa24.64■■□□□ 1.54
ACTB-202ENST00000414620 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.63■■□□□ 1.53
ACTB-202ENST00000414620 MAP3K1Q13233 1512 aa24.62■■□□□ 1.53
ACTB-202ENST00000414620 ZMYM3Q14202 1370 aa24.62■■□□□ 1.53
ACTB-202ENST00000414620 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
ACTB-202ENST00000414620 FBXO41Q8TF61 875 aa24.61■■□□□ 1.53
ACTB-202ENST00000414620 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.61■■□□□ 1.53
ACTB-202ENST00000414620 NPATQ14207 1427 aa24.58■■□□□ 1.53
ACTB-202ENST00000414620 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
ACTB-202ENST00000414620 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
ACTB-202ENST00000414620 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa24.53■■□□□ 1.52
ACTB-202ENST00000414620 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.53■■□□□ 1.52
ACTB-202ENST00000414620 PTPRKQ15262 1439 aa24.52■■□□□ 1.52
ACTB-202ENST00000414620 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.52■■□□□ 1.52
ACTB-202ENST00000414620 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.52■■□□□ 1.52
ACTB-202ENST00000414620 KIF3BO15066 747 aa24.51■■□□□ 1.51
ACTB-202ENST00000414620 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
ACTB-202ENST00000414620 NCOA1Q15788 1441 aa24.5■■□□□ 1.51
ACTB-202ENST00000414620 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.5■■□□□ 1.51
ACTB-202ENST00000414620 TSPY4P0CV99 314 aa24.49■■□□□ 1.51
ACTB-202ENST00000414620 TSPY10P0CW01 314 aa24.49■■□□□ 1.51
ACTB-202ENST00000414620 CERKQ8TCT0 537 aa24.49■■□□□ 1.51
ACTB-202ENST00000414620 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.49■■□□□ 1.51
ACTB-202ENST00000414620 CROCC2H7BZ55 1655 aa24.48■■□□□ 1.51
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