RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414510.5

PTPA-210, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPA, Length 1,153 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPA-210ENST00000414510 MTUS2Q5JR59 1369 aa38.82■■■■□ 3.8
PTPA-210ENST00000414510 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa38.8■■■■□ 3.8
PTPA-210ENST00000414510 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa38.77■■■■□ 3.8
PTPA-210ENST00000414510 TIAM1Q13009 1591 aa38.77■■■■□ 3.8
PTPA-210ENST00000414510 SCAPERQ9BY12 1400 aa38.76■■■■□ 3.8
PTPA-210ENST00000414510 POGZQ7Z3K3 1410 aa38.72■■■■□ 3.79
PTPA-210ENST00000414510 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa38.7■■■■□ 3.79
PTPA-210ENST00000414510 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa38.7■■■■□ 3.79
PTPA-210ENST00000414510 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa38.68■■■■□ 3.78
PTPA-210ENST00000414510 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP38.68■■■■□ 3.78
PTPA-210ENST00000414510 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP38.67■■■■□ 3.78
PTPA-210ENST00000414510 ABCC1P33527 1531 aa38.65■■■■□ 3.78
PTPA-210ENST00000414510 ITSN2Q9NZM3 1697 aa38.63■■■■□ 3.77
PTPA-210ENST00000414510 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa38.61■■■■□ 3.77
PTPA-210ENST00000414510 CCNB3Q8WWL7 1395 aa38.61■■■■□ 3.77
PTPA-210ENST00000414510 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP38.6■■■■□ 3.77
PTPA-210ENST00000414510 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa38.59■■■■□ 3.77
PTPA-210ENST00000414510 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa38.59■■■■□ 3.77
PTPA-210ENST00000414510 YEATS2Q9ULM3 1422 aa38.57■■■■□ 3.77
PTPA-210ENST00000414510 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa38.56■■■■□ 3.76
PTPA-210ENST00000414510 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa38.56■■■■□ 3.76
PTPA-210ENST00000414510 KDM5CP41229 1560 aa38.55■■■■□ 3.76
PTPA-210ENST00000414510 NCOA2Q15596 1464 aa38.54■■■■□ 3.76
PTPA-210ENST00000414510 MAP3K1Q13233 1512 aa38.54■■■■□ 3.76
PTPA-210ENST00000414510 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP38.54■■■■□ 3.76
PTPA-210ENST00000414510 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa38.51■■■■□ 3.76
PTPA-210ENST00000414510 MAGI2Q86UL8 1455 aa38.51■■■■□ 3.76
PTPA-210ENST00000414510 SYCP2Q9BX26 1530 aa38.51■■■■□ 3.76
PTPA-210ENST00000414510 AFAP1Q8N556 730 aa38.5■■■■□ 3.75
PTPA-210ENST00000414510 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa38.49■■■■□ 3.75
PTPA-210ENST00000414510 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP38.48■■■■□ 3.75
PTPA-210ENST00000414510 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP38.48■■■■□ 3.75
PTPA-210ENST00000414510 HECW2Q9P2P5 1572 aa38.48■■■■□ 3.75
PTPA-210ENST00000414510 BCORL1Q5H9F3 1711 aa38.41■■■■□ 3.74
PTPA-210ENST00000414510 ABCA6Q8N139 1617 aa38.38■■■■□ 3.73
PTPA-210ENST00000414510 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa38.37■■■■□ 3.73
PTPA-210ENST00000414510 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa38.37■■■■□ 3.73
PTPA-210ENST00000414510 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP38.37■■■■□ 3.73
PTPA-210ENST00000414510 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP38.37■■■■□ 3.73
PTPA-210ENST00000414510 ADAMTSL3P82987 1691 aa38.36■■■■□ 3.73
PTPA-210ENST00000414510 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP38.36■■■■□ 3.73
PTPA-210ENST00000414510 MLH3Q9UHC1 1453 aa38.35■■■■□ 3.73
PTPA-210ENST00000414510 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa38.34■■■■□ 3.73
PTPA-210ENST00000414510 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa38.34■■■■□ 3.73
PTPA-210ENST00000414510 ATP10AO60312 1499 aa38.34■■■■□ 3.73
PTPA-210ENST00000414510 MYT1LQ9UL68 1186 aa38.33■■■■□ 3.73
PTPA-210ENST00000414510 C9orf84Q5VXU9 1444 aa38.32■■■■□ 3.73
PTPA-210ENST00000414510 APLP2Q06481 763 aa38.32■■■■□ 3.72
PTPA-210ENST00000414510 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa38.28■■■■□ 3.72
PTPA-210ENST00000414510 MADDQ8WXG6 1647 aa38.28■■■■□ 3.72
PTPA-210ENST00000414510 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP38.24■■■■□ 3.71
PTPA-210ENST00000414510 MBD5Q9P267 1494 aa38.24■■■■□ 3.71
PTPA-210ENST00000414510 ATP7AQ04656 1500 aa38.22■■■■□ 3.71
PTPA-210ENST00000414510 REREQ9P2R6 1566 aa38.2■■■■□ 3.71
PTPA-210ENST00000414510 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP38.19■■■■□ 3.7
PTPA-210ENST00000414510 MYOM3Q5VTT5 1437 aa38.19■■■■□ 3.7
PTPA-210ENST00000414510 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP38.18■■■■□ 3.7
PTPA-210ENST00000414510 MLECQ14165 292 aa38.15■■■■□ 3.7
PTPA-210ENST00000414510 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa38.12■■■■□ 3.69
PTPA-210ENST00000414510 PTPRMP28827 1452 aa38.12■■■■□ 3.69
PTPA-210ENST00000414510 CCDC141Q6ZP82 1450 aa38.12■■■■□ 3.69
PTPA-210ENST00000414510 MIA2Q96PC5 1412 aa38.09■■■■□ 3.69
PTPA-210ENST00000414510 ARHGEF5Q12774 1597 aa38.09■■■■□ 3.69
PTPA-210ENST00000414510 AGLP35573 1532 aa38.06■■■■□ 3.68
PTPA-210ENST00000414510 PTPN23Q9H3S7 1636 aa38.02■■■■□ 3.68
PTPA-210ENST00000414510 ADGBQ8N7X0 1667 aa38.02■■■■□ 3.68
PTPA-210ENST00000414510 PLXNC1O60486 1568 aa38.02■■■■□ 3.68
PTPA-210ENST00000414510 A2MP01023 1474 aa37.99■■■■□ 3.67
PTPA-210ENST00000414510 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa37.99■■■■□ 3.67
PTPA-210ENST00000414510 FGD6Q6ZV73 1430 aa37.96■■■■□ 3.67
PTPA-210ENST00000414510 RSPH4AQ5TD94 716 aa37.93■■■■□ 3.66
PTPA-210ENST00000414510 MAST1Q9Y2H9 1570 aa37.9■■■■□ 3.66
PTPA-210ENST00000414510 PLPPR3Q6T4P5 718 aa37.9■■■■□ 3.66
PTPA-210ENST00000414510 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP37.9■■■■□ 3.66
PTPA-210ENST00000414510 CROCC2H7BZ55 1655 aa37.89■■■■□ 3.66
PTPA-210ENST00000414510 TSPY4P0CV99 314 aa37.84■■■■□ 3.65
PTPA-210ENST00000414510 TSPY10P0CW01 314 aa37.84■■■■□ 3.65
PTPA-210ENST00000414510 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP37.83■■■■□ 3.65
PTPA-210ENST00000414510 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP37.82■■■■□ 3.64
PTPA-210ENST00000414510 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP37.8■■■■□ 3.64
PTPA-210ENST00000414510 ABCC5O15440 1437 aa37.79■■■■□ 3.64
PTPA-210ENST00000414510 C3P01024 1663 aa37.77■■■■□ 3.64
PTPA-210ENST00000414510 DAPK1P53355 1430 aa37.77■■■■□ 3.64
PTPA-210ENST00000414510 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP37.75■■■■□ 3.63
PTPA-210ENST00000414510 SHANK2Q9UPX8 1470 aa37.75■■■■□ 3.63
PTPA-210ENST00000414510 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP37.73■■■■□ 3.63
PTPA-210ENST00000414510 GGT6Q6P531 493 aa37.7■■■■□ 3.63
PTPA-210ENST00000414510 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP37.7■■■■□ 3.63
PTPA-210ENST00000414510 MROH2AA6NES4 1674 aa37.69■■■■□ 3.62
PTPA-210ENST00000414510 CNTLNQ9NXG0 1405 aa37.68■■■■□ 3.62
PTPA-210ENST00000414510 LMTK3Q96Q04 1460 aa37.67■■■■□ 3.62
PTPA-210ENST00000414510 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP37.67■■■■□ 3.62
PTPA-210ENST00000414510 KIF3BO15066 747 aa37.65■■■■□ 3.62
PTPA-210ENST00000414510 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP37.61■■■■□ 3.61
PTPA-210ENST00000414510 DUOX2Q9NRD8 1548 aa37.61■■■■□ 3.61
PTPA-210ENST00000414510 PREX1Q8TCU6 1659 aa37.6■■■■□ 3.61
PTPA-210ENST00000414510 KIF15Q9NS87 1388 aa37.59■■■■□ 3.61
PTPA-210ENST00000414510 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP37.58■■■■□ 3.61
PTPA-210ENST00000414510 CHIC2Q9UKJ5 165 aa37.58■■■■□ 3.61
PTPA-210ENST00000414510 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa37.55■■■■□ 3.6
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