RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412476.5

PHYHD1-204, Transcript of phytanoyl-CoA dioxygenase domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene PHYHD1, Length 1,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1-204ENST00000412476 PLCH2O75038 1416 aa25.15■■□□□ 1.62
PHYHD1-204ENST00000412476 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.13■■□□□ 1.61
PHYHD1-204ENST00000412476 GLI2P10070 1586 aa25.13■■□□□ 1.61
PHYHD1-204ENST00000412476 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
PHYHD1-204ENST00000412476 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
PHYHD1-204ENST00000412476 DIP2BQ9P265 1576 aa25.12■■□□□ 1.61
PHYHD1-204ENST00000412476 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.11■■□□□ 1.61
PHYHD1-204ENST00000412476 ARAP3Q8WWN8 1544 aa25.1■■□□□ 1.61
PHYHD1-204ENST00000412476 CD109Q6YHK3 1445 aa25.08■■□□□ 1.61
PHYHD1-204ENST00000412476 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.08■■□□□ 1.6
PHYHD1-204ENST00000412476 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.07■■□□□ 1.6
PHYHD1-204ENST00000412476 ITGAEP38570 1179 aa25.07■■□□□ 1.6
PHYHD1-204ENST00000412476 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.07■■□□□ 1.6
PHYHD1-204ENST00000412476 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.06■■□□□ 1.6
PHYHD1-204ENST00000412476 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.05■■□□□ 1.6
PHYHD1-204ENST00000412476 FANCAO15360 1455 aa25.01■■□□□ 1.59
PHYHD1-204ENST00000412476 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
PHYHD1-204ENST00000412476 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.98■■□□□ 1.59
PHYHD1-204ENST00000412476 PTPRKQ15262 1439 aa24.98■■□□□ 1.59
PHYHD1-204ENST00000412476 DAPK1P53355 1430 aa24.97■■□□□ 1.59
PHYHD1-204ENST00000412476 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.97■■□□□ 1.59
PHYHD1-204ENST00000412476 ABCC5O15440 1437 aa24.97■■□□□ 1.59
PHYHD1-204ENST00000412476 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.96■■□□□ 1.59
PHYHD1-204ENST00000412476 CFAP74Q9C0B2 1584 aa24.96■■□□□ 1.59
PHYHD1-204ENST00000412476 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.96■■□□□ 1.59
PHYHD1-204ENST00000412476 MBD5Q9P267 1494 aa24.96■■□□□ 1.59
PHYHD1-204ENST00000412476 ABCC1P33527 1531 aa24.96■■□□□ 1.59
PHYHD1-204ENST00000412476 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.96■■□□□ 1.59
PHYHD1-204ENST00000412476 TSPOAP1O95153 1857 aa24.96■■□□□ 1.59
PHYHD1-204ENST00000412476 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.94■■□□□ 1.58
PHYHD1-204ENST00000412476 CROCC2H7BZ55 1655 aa24.93■■□□□ 1.58
PHYHD1-204ENST00000412476 AKNAQ7Z591 1439 aa24.93■■□□□ 1.58
PHYHD1-204ENST00000412476 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
PHYHD1-204ENST00000412476 NEO1Q92859 1461 aa24.9■■□□□ 1.58
PHYHD1-204ENST00000412476 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.9■■□□□ 1.58
PHYHD1-204ENST00000412476 ADGRL1O94910 1474 aa24.9■■□□□ 1.58
PHYHD1-204ENST00000412476 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.89■■□□□ 1.58
PHYHD1-204ENST00000412476 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.89■■□□□ 1.57
PHYHD1-204ENST00000412476 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.87■■□□□ 1.57
PHYHD1-204ENST00000412476 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.85■■□□□ 1.57
PHYHD1-204ENST00000412476 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.85■■□□□ 1.57
PHYHD1-204ENST00000412476 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.85■■□□□ 1.57
PHYHD1-204ENST00000412476 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.85■■□□□ 1.57
PHYHD1-204ENST00000412476 TSPY4P0CV99 314 aa24.84■■□□□ 1.57
PHYHD1-204ENST00000412476 TSPY10P0CW01 314 aa24.84■■□□□ 1.57
PHYHD1-204ENST00000412476 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.82■■□□□ 1.56
PHYHD1-204ENST00000412476 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
PHYHD1-204ENST00000412476 ROCK1Q13464 1354 aa24.81■■□□□ 1.56
PHYHD1-204ENST00000412476 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.81■■□□□ 1.56
PHYHD1-204ENST00000412476 ADGRL2O95490 1459 aa24.8■■□□□ 1.56
PHYHD1-204ENST00000412476 AFAP1Q8N556 730 aa24.79■■□□□ 1.56
PHYHD1-204ENST00000412476 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.79■■□□□ 1.56
PHYHD1-204ENST00000412476 HFM1A2PYH4 1435 aa24.78■■□□□ 1.56
PHYHD1-204ENST00000412476 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.78■■□□□ 1.56
PHYHD1-204ENST00000412476 NAIPQ13075 1403 aa24.77■■□□□ 1.56
PHYHD1-204ENST00000412476 NCOA1Q15788 1441 aa24.77■■□□□ 1.56
PHYHD1-204ENST00000412476 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.77■■□□□ 1.56
PHYHD1-204ENST00000412476 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.76■■□□□ 1.55
PHYHD1-204ENST00000412476 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.76■■□□□ 1.55
PHYHD1-204ENST00000412476 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
PHYHD1-204ENST00000412476 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.75■■□□□ 1.55
PHYHD1-204ENST00000412476 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
PHYHD1-204ENST00000412476 RICTORQ6R327 1708 aa24.72■■□□□ 1.55
PHYHD1-204ENST00000412476 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.72■■□□□ 1.55
PHYHD1-204ENST00000412476 KDM5CP41229 1560 aa24.71■■□□□ 1.55
PHYHD1-204ENST00000412476 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.71■■□□□ 1.55
PHYHD1-204ENST00000412476 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.55
PHYHD1-204ENST00000412476 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa24.7■■□□□ 1.54
PHYHD1-204ENST00000412476 PLXNC1O60486 1568 aa24.7■■□□□ 1.54
PHYHD1-204ENST00000412476 RAPGEF3O95398 923 aa24.7■■□□□ 1.54
PHYHD1-204ENST00000412476 ATP7AQ04656 1500 aa24.68■■□□□ 1.54
PHYHD1-204ENST00000412476 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa24.67■■□□□ 1.54
PHYHD1-204ENST00000412476 KIF15Q9NS87 1388 aa24.67■■□□□ 1.54
PHYHD1-204ENST00000412476 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.67■■□□□ 1.54
PHYHD1-204ENST00000412476 KDM6BO15054 1643 aa24.66■■□□□ 1.54
PHYHD1-204ENST00000412476 HRCP23327 699 aa24.65■■□□□ 1.54
PHYHD1-204ENST00000412476 HECW2Q9P2P5 1572 aa24.64■■□□□ 1.54
PHYHD1-204ENST00000412476 MLH3Q9UHC1 1453 aa24.64■■□□□ 1.53
PHYHD1-204ENST00000412476 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.63■■□□□ 1.53
PHYHD1-204ENST00000412476 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
PHYHD1-204ENST00000412476 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.6■■□□□ 1.53
PHYHD1-204ENST00000412476 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa24.6■■□□□ 1.53
PHYHD1-204ENST00000412476 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.6■■□□□ 1.53
PHYHD1-204ENST00000412476 ABCA6Q8N139 1617 aa24.55■■□□□ 1.52
PHYHD1-204ENST00000412476 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.52■■□□□ 1.52
PHYHD1-204ENST00000412476 ERBINQ96RT1 1412 aa24.52■■□□□ 1.52
PHYHD1-204ENST00000412476 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa24.52■■□□□ 1.52
PHYHD1-204ENST00000412476 YEATS2Q9ULM3 1422 aa24.51■■□□□ 1.51
PHYHD1-204ENST00000412476 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
PHYHD1-204ENST00000412476 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
PHYHD1-204ENST00000412476 A2MP01023 1474 aa24.49■■□□□ 1.51
PHYHD1-204ENST00000412476 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
PHYHD1-204ENST00000412476 TRIM52Q96A61 297 aa24.49■■□□□ 1.51
PHYHD1-204ENST00000412476 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
PHYHD1-204ENST00000412476 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.51
PHYHD1-204ENST00000412476 UNC13BO14795 1591 aa24.43■■□□□ 1.5
PHYHD1-204ENST00000412476 ATP10AO60312 1499 aa24.42■■□□□ 1.5
PHYHD1-204ENST00000412476 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa24.42■■□□□ 1.5
PHYHD1-204ENST00000412476 KIF3BO15066 747 aa24.4■■□□□ 1.5
PHYHD1-204ENST00000412476 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms