RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412161.1

SYNE1-AS1-201, SYNE1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SYNE1-AS1, Length 553 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 AKNAQ7Z591 1439 aa13.65□□□□□ -0.22
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MTUS2Q5JR59 1369 aa13.63□□□□□ -0.23
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa13.63□□□□□ -0.23
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa13.62□□□□□ -0.23
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ADGRL1O94910 1474 aa13.62□□□□□ -0.23
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa13.62□□□□□ -0.23
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa13.62□□□□□ -0.23
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ARHGAP5Q13017 1502 aa13.62□□□□□ -0.23
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TIAM1Q13009 1591 aa13.62□□□□□ -0.23
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa13.61□□□□□ -0.23
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MAGI2Q86UL8 1455 aa13.61□□□□□ -0.23
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ITSN2Q9NZM3 1697 aa13.61□□□□□ -0.23
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa13.58□□□□□ -0.24
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KDM5CP41229 1560 aa13.56□□□□□ -0.24
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CCNB3Q8WWL7 1395 aa13.55□□□□□ -0.24
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa13.54□□□□□ -0.24
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa13.54□□□□□ -0.24
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RAPGEF3O95398 923 aa13.53□□□□□ -0.24
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa13.53□□□□□ -0.24
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HECW2Q9P2P5 1572 aa13.53□□□□□ -0.24
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa13.51□□□□□ -0.25
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NCOA2Q15596 1464 aa13.51□□□□□ -0.25
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MLH3Q9UHC1 1453 aa13.5□□□□□ -0.25
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 APLP2Q06481 763 aa13.5□□□□□ -0.25
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SYCP2Q9BX26 1530 aa13.48□□□□□ -0.25
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C9orf84Q5VXU9 1444 aa13.47□□□□□ -0.25
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BCORL1Q5H9F3 1711 aa13.46□□□□□ -0.25
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ATP10AO60312 1499 aa13.46□□□□□ -0.25
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MIA2Q96PC5 1412 aa13.45□□□□□ -0.26
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa13.44□□□□□ -0.26
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ADAMTSL3P82987 1691 aa13.44□□□□□ -0.26
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa13.44□□□□□ -0.26
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 YEATS2Q9ULM3 1422 aa13.44□□□□□ -0.26
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa13.44□□□□□ -0.26
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa13.44□□□□□ -0.26
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa13.43□□□□□ -0.26
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ABCA6Q8N139 1617 aa13.42□□□□□ -0.26
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MYOM3Q5VTT5 1437 aa13.42□□□□□ -0.26
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 AGLP35573 1532 aa13.42□□□□□ -0.26
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ATP7AQ04656 1500 aa13.42□□□□□ -0.26
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa13.42□□□□□ -0.26
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 AFAP1Q8N556 730 aa13.41□□□□□ -0.26
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CCDC141Q6ZP82 1450 aa13.41□□□□□ -0.26
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa13.4□□□□□ -0.26
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MBD5Q9P267 1494 aa13.4□□□□□ -0.26
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ADGBQ8N7X0 1667 aa13.4□□□□□ -0.26
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MYT1LQ9UL68 1186 aa13.37□□□□□ -0.27
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MADDQ8WXG6 1647 aa13.37□□□□□ -0.27
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa13.37□□□□□ -0.27
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PLXNC1O60486 1568 aa13.37□□□□□ -0.27
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa13.36□□□□□ -0.27
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MAST1Q9Y2H9 1570 aa13.36□□□□□ -0.27
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP13.35□□□□□ -0.27
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PTPRMP28827 1452 aa13.35□□□□□ -0.27
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM135AQ9P2D6 1515 aa13.34□□□□□ -0.27
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FGD6Q6ZV73 1430 aa13.33□□□□□ -0.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PTPN23Q9H3S7 1636 aa13.33□□□□□ -0.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 A2MP01023 1474 aa13.33□□□□□ -0.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SHANK2Q9UPX8 1470 aa13.33□□□□□ -0.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CNTLNQ9NXG0 1405 aa13.32□□□□□ -0.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CROCC2H7BZ55 1655 aa13.31□□□□□ -0.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TSPY4P0CV99 314 aa13.31□□□□□ -0.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TSPY10P0CW01 314 aa13.31□□□□□ -0.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MROH2AA6NES4 1674 aa13.3□□□□□ -0.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DUOX2Q9NRD8 1548 aa13.24□□□□□ -0.29
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DAPK1P53355 1430 aa13.24□□□□□ -0.29
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP13.23□□□□□ -0.29
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MLECQ14165 292 aa13.23□□□□□ -0.29
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ABCC5O15440 1437 aa13.22□□□□□ -0.29
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PREX1Q8TCU6 1659 aa13.22□□□□□ -0.29
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