RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 ADGRD1Q6QNK2 874 aa2.16□□□□□ -2.06
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RNU6-172P-201ENST00000411000 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
RNU6-172P-201ENST00000411000 PTPN5P54829 565 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-172P-201ENST00000411000 KCTD17Q8N5Z5 321 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-172P-201ENST00000411000 POTECB2RU33 542 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-172P-201ENST00000411000 GPR153Q6NV75 609 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-172P-201ENST00000411000 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
RNU6-172P-201ENST00000411000 HRO43593 1189 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-172P-201ENST00000411000 POTEEQ6S8J3 1075 aa2.12□□□□□ -2.07
RNU6-172P-201ENST00000411000 TK2O00142 265 aa2.11□□□□□ -2.07
RNU6-172P-201ENST00000411000 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP2.11□□□□□ -2.07
RNU6-172P-201ENST00000411000 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
RNU6-172P-201ENST00000411000 AXIN2Q9Y2T1 843 aa2.1□□□□□ -2.07
RNU6-172P-201ENST00000411000 IFNL1Q8IU54 200 aa2.09□□□□□ -2.07
RNU6-172P-201ENST00000411000 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa2.07□□□□□ -2.08
RNU6-172P-201ENST00000411000 STAC3Q96MF2 364 aa2.07□□□□□ -2.08
RNU6-172P-201ENST00000411000 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa2.07□□□□□ -2.08
RNU6-172P-201ENST00000411000 MYT1Q01538 1121 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-172P-201ENST00000411000 KCNMA1Q12791 1236 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-172P-201ENST00000411000 THSD4Q6ZMP0 1018 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa2.06□□□□□ -2.08
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARHGAP33O14559 1287 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-172P-201ENST00000411000 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa2.05□□□□□ -2.08
RNU6-172P-201ENST00000411000 GSK3AP49840 483 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARSIQ5FYB1 569 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-172P-201ENST00000411000 LCE2CQ5TA81 110 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRKD2Q9BZL6 878 aa2.04□□□□□ -2.08
RNU6-172P-201ENST00000411000 V9GY48 417 aaPredicted RBP2.04□□□□□ -2.08
RNU6-172P-201ENST00000411000 G3V3G9 751 aa2.03□□□□□ -2.08
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RNU6-172P-201ENST00000411000 DCAF8Q5TAQ9 597 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-172P-201ENST00000411000 Q8N3U1 123 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM151AQ8N4L1 468 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-172P-201ENST00000411000 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.03□□□□□ -2.08
RNU6-172P-201ENST00000411000 DGAT1O75907 488 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-172P-201ENST00000411000 PKDCCQ504Y2 493 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-172P-201ENST00000411000 EHMT2Q96KQ7 1210 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-172P-201ENST00000411000 BOLA1Q9Y3E2 137 aa2.02□□□□□ -2.09
RNU6-172P-201ENST00000411000 ADAM23O75077 832 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-172P-201ENST00000411000 KCNC4Q03721 635 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-172P-201ENST00000411000 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa2.01□□□□□ -2.09
RNU6-172P-201ENST00000411000 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP2.01□□□□□ -2.09
RNU6-172P-201ENST00000411000 ATXN8OSP0DMR3 200 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-172P-201ENST00000411000 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
RNU6-172P-201ENST00000411000 LAMC2Q13753 1193 aa2□□□□□ -2.09
RNU6-172P-201ENST00000411000 RASEFQ8IZ41 740 aa2□□□□□ -2.09
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RNU6-172P-201ENST00000411000 DPY19L2Q6NUT2 758 aa1.96□□□□□ -2.1
RNU6-172P-201ENST00000411000 WNT2BQ93097 391 aa1.96□□□□□ -2.1
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RNU6-172P-201ENST00000411000 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP1.94□□□□□ -2.1
RNU6-172P-201ENST00000411000 ST8SIA5O15466 376 aa1.94□□□□□ -2.1
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RNU6-172P-201ENST00000411000 PRR20CP86479 221 aa1.9□□□□□ -2.11
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRR20DP86480 221 aa1.9□□□□□ -2.11
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRR20BP86481 221 aa1.9□□□□□ -2.11
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRR20AP86496 221 aa1.9□□□□□ -2.11
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RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC16A10Q8TF71 515 aa1.9□□□□□ -2.11
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RNU6-172P-201ENST00000411000 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP1.89□□□□□ -2.11
RNU6-172P-201ENST00000411000 KCNH8Q96L42 1107 aa1.89□□□□□ -2.11
RNU6-172P-201ENST00000411000 IRF7Q92985 503 aa1.88□□□□□ -2.11
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC4A5Q9BY07 1137 aa1.88□□□□□ -2.11
RNU6-172P-201ENST00000411000 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP1.87□□□□□ -2.11
RNU6-172P-201ENST00000411000 PPP1R18Q6NYC8 613 aa1.87□□□□□ -2.11
RNU6-172P-201ENST00000411000 DACH1Q9UI36 760 aa1.86□□□□□ -2.11
RNU6-172P-201ENST00000411000 PCDHB8Q9UN66 801 aa1.86□□□□□ -2.11
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP1.86□□□□□ -2.11
RNU6-172P-201ENST00000411000 MSTNO14793 375 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-172P-201ENST00000411000 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP1.85□□□□□ -2.11
RNU6-172P-201ENST00000411000 ANKK1Q8NFD2 765 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-172P-201ENST00000411000 KCNK17Q96T54 332 aa1.85□□□□□ -2.11
RNU6-172P-201ENST00000411000 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP1.85□□□□□ -2.11
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