RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410499.1

RNU6-141P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 141, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-141P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-141P-201ENST00000410499 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-141P-201ENST00000410499 RIMBP2O15034 1052 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-141P-201ENST00000410499 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
RNU6-141P-201ENST00000410499 PBX2P40425 430 aa4.08□□□□□ -1.76
RNU6-141P-201ENST00000410499 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
RNU6-141P-201ENST00000410499 LCE2CQ5TA81 110 aa4.08□□□□□ -1.76
RNU6-141P-201ENST00000410499 GPR153Q6NV75 609 aa4.07□□□□□ -1.76
RNU6-141P-201ENST00000410499 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa4.07□□□□□ -1.76
RNU6-141P-201ENST00000410499 AXIN2Q9Y2T1 843 aa4.07□□□□□ -1.76
RNU6-141P-201ENST00000410499 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
RNU6-141P-201ENST00000410499 HRO43593 1189 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-141P-201ENST00000410499 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa4.04□□□□□ -1.76
RNU6-141P-201ENST00000410499 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.02□□□□□ -1.77
RNU6-141P-201ENST00000410499 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
RNU6-141P-201ENST00000410499 SGIP1Q9BQI5 828 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-141P-201ENST00000410499 GSK3AP49840 483 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-141P-201ENST00000410499 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-141P-201ENST00000410499 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
RNU6-141P-201ENST00000410499 IFNL1Q8IU54 200 aa3.96□□□□□ -1.78
RNU6-141P-201ENST00000410499 STAG3Q9UJ98 1225 aa3.96□□□□□ -1.78
RNU6-141P-201ENST00000410499 MYT1Q01538 1121 aa3.95□□□□□ -1.78
RNU6-141P-201ENST00000410499 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa3.95□□□□□ -1.78
RNU6-141P-201ENST00000410499 KCNMA1Q12791 1236 aa3.93□□□□□ -1.78
RNU6-141P-201ENST00000410499 Q8N3U1 123 aa3.93□□□□□ -1.78
RNU6-141P-201ENST00000410499 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa3.93□□□□□ -1.78
RNU6-141P-201ENST00000410499 TK2O00142 265 aa3.92□□□□□ -1.78
RNU6-141P-201ENST00000410499 ARSIQ5FYB1 569 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-141P-201ENST00000410499 THSD4Q6ZMP0 1018 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-141P-201ENST00000410499 PRKD2Q9BZL6 878 aa3.9□□□□□ -1.79
RNU6-141P-201ENST00000410499 LAMC2Q13753 1193 aa3.89□□□□□ -1.79
RNU6-141P-201ENST00000410499 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP3.87□□□□□ -1.79
RNU6-141P-201ENST00000410499 ADAM23O75077 832 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-141P-201ENST00000410499 TMEM151AQ8N4L1 468 aa3.86□□□□□ -1.79
RNU6-141P-201ENST00000410499 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa3.85□□□□□ -1.79
RNU6-141P-201ENST00000410499 ARHGAP33O14559 1287 aa3.84□□□□□ -1.79
RNU6-141P-201ENST00000410499 DMRTA1Q5VZB9 504 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-141P-201ENST00000410499 EHMT2Q96KQ7 1210 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-141P-201ENST00000410499 STAC3Q96MF2 364 aa3.83□□□□□ -1.8
RNU6-141P-201ENST00000410499 GDF11O95390 407 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-141P-201ENST00000410499 V9GY48 417 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
RNU6-141P-201ENST00000410499 PKDCCQ504Y2 493 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-141P-201ENST00000410499 GPAT2Q6NUI2 795 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-141P-201ENST00000410499 RASEFQ8IZ41 740 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-141P-201ENST00000410499 DGAT1O75907 488 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-141P-201ENST00000410499 RASSF7Q02833 373 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-141P-201ENST00000410499 DPY19L2Q6NUT2 758 aa3.78□□□□□ -1.8
RNU6-141P-201ENST00000410499 TERTO14746 1132 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
RNU6-141P-201ENST00000410499 IGHA1P01876 353 aa3.77□□□□□ -1.81
RNU6-141P-201ENST00000410499 ST8SIA5O15466 376 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-141P-201ENST00000410499 KCNC4Q03721 635 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-141P-201ENST00000410499 BOLA1Q9Y3E2 137 aa3.76□□□□□ -1.81
RNU6-141P-201ENST00000410499 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP3.75□□□□□ -1.81
RNU6-141P-201ENST00000410499 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
RNU6-141P-201ENST00000410499 AAASQ9NRG9 546 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-141P-201ENST00000410499 PSEN2P49810 448 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-141P-201ENST00000410499 LHX6Q9UPM6 363 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-141P-201ENST00000410499 COBLO75128 1261 aa3.72□□□□□ -1.81
RNU6-141P-201ENST00000410499 GMPRP36959 345 aa3.72□□□□□ -1.81
RNU6-141P-201ENST00000410499 TRIM67Q6ZTA4 783 aa3.72□□□□□ -1.81
RNU6-141P-201ENST00000410499 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
RNU6-141P-201ENST00000410499 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
RNU6-141P-201ENST00000410499 WNT2BQ93097 391 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-141P-201ENST00000410499 G3V3G9 751 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-141P-201ENST00000410499 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
RNU6-141P-201ENST00000410499 DCAF8Q5TAQ9 597 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-141P-201ENST00000410499 TMEM92Q6UXU6 159 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-141P-201ENST00000410499 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
RNU6-141P-201ENST00000410499 DACH1Q9UI36 760 aa3.68□□□□□ -1.82
RNU6-141P-201ENST00000410499 NUDT7P0C024 238 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-141P-201ENST00000410499 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-141P-201ENST00000410499 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-141P-201ENST00000410499 FAM187AA6NFU0 413 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-141P-201ENST00000410499 GOLGA8CPA6NN73 597 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-141P-201ENST00000410499 GOLGA2Q08379 1002 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-141P-201ENST00000410499 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-141P-201ENST00000410499 FOXK2Q01167 660 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-141P-201ENST00000410499 PPP1R18Q6NYC8 613 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-141P-201ENST00000410499 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-141P-201ENST00000410499 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-141P-201ENST00000410499 ATXN8OSP0DMR3 200 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-141P-201ENST00000410499 PRR20EP86478 221 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-141P-201ENST00000410499 PRR20CP86479 221 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-141P-201ENST00000410499 PRR20DP86480 221 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-141P-201ENST00000410499 PRR20BP86481 221 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-141P-201ENST00000410499 PRR20AP86496 221 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-141P-201ENST00000410499 KRTAP1-1Q07627 177 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-141P-201ENST00000410499 CRIPAKQ8N1N5 446 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-141P-201ENST00000410499 SLC16A10Q8TF71 515 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-141P-201ENST00000410499 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-141P-201ENST00000410499 FOXD4L1Q9NU39 408 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-141P-201ENST00000410499 PCDHB8Q9UN66 801 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-141P-201ENST00000410499 NYAP1Q6ZVC0 841 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-141P-201ENST00000410499 IRF7Q92985 503 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-141P-201ENST00000410499 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-141P-201ENST00000410499 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-141P-201ENST00000410499 MSTNO14793 375 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-141P-201ENST00000410499 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
RNU6-141P-201ENST00000410499 KCNK17Q96T54 332 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-141P-201ENST00000410499 SPOCK3Q9BQ16 436 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-141P-201ENST00000410499 BCAMP50895 628 aa3.46□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.8 ms