RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410323.1

RNU6-101P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 101, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-101P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-101P-201ENST00000410323 MMRN1Q13201 1228 aa8.43□□□□□ -1.06
RNU6-101P-201ENST00000410323 MFRPQ9BY79 579 aa8.42□□□□□ -1.06
RNU6-101P-201ENST00000410323 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
RNU6-101P-201ENST00000410323 ZNF710Q8N1W2 664 aa8.4□□□□□ -1.06
RNU6-101P-201ENST00000410323 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa8.4□□□□□ -1.06
RNU6-101P-201ENST00000410323 STK24Q9Y6E0 443 aa8.39□□□□□ -1.07
RNU6-101P-201ENST00000410323 RGL2O15211 777 aa8.38□□□□□ -1.07
RNU6-101P-201ENST00000410323 GPR153Q6NV75 609 aa8.38□□□□□ -1.07
RNU6-101P-201ENST00000410323 STK25O00506 426 aa8.37□□□□□ -1.07
RNU6-101P-201ENST00000410323 RIMBP2O15034 1052 aa8.36□□□□□ -1.07
RNU6-101P-201ENST00000410323 KIF3CO14782 793 aa8.35□□□□□ -1.07
RNU6-101P-201ENST00000410323 ERBB3P21860 1342 aa8.34□□□□□ -1.07
RNU6-101P-201ENST00000410323 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RNU6-101P-201ENST00000410323 C2orf72A6NCS6 295 aa8.29□□□□□ -1.08
RNU6-101P-201ENST00000410323 ZNF687Q8N1G0 1237 aa8.29□□□□□ -1.08
RNU6-101P-201ENST00000410323 ARSIQ5FYB1 569 aa8.28□□□□□ -1.08
RNU6-101P-201ENST00000410323 PPP1R37O75864 691 aa8.26□□□□□ -1.09
RNU6-101P-201ENST00000410323 SLC34A2O95436 690 aa8.25□□□□□ -1.09
RNU6-101P-201ENST00000410323 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP8.25□□□□□ -1.09
RNU6-101P-201ENST00000410323 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
RNU6-101P-201ENST00000410323 HS6ST3Q8IZP7 471 aa8.23□□□□□ -1.09
RNU6-101P-201ENST00000410323 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa8.21□□□□□ -1.1
RNU6-101P-201ENST00000410323 TMC2Q8TDI7 906 aa8.19□□□□□ -1.1
RNU6-101P-201ENST00000410323 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa8.19□□□□□ -1.1
RNU6-101P-201ENST00000410323 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa8.18□□□□□ -1.1
RNU6-101P-201ENST00000410323 NUDT7P0C024 238 aa8.17□□□□□ -1.1
RNU6-101P-201ENST00000410323 POTEEQ6S8J3 1075 aa8.16□□□□□ -1.1
RNU6-101P-201ENST00000410323 FOXK1P85037 733 aa8.15□□□□□ -1.1
RNU6-101P-201ENST00000410323 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
RNU6-101P-201ENST00000410323 PTGER2P43116 358 aa8.14□□□□□ -1.11
RNU6-101P-201ENST00000410323 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
RNU6-101P-201ENST00000410323 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
RNU6-101P-201ENST00000410323 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
RNU6-101P-201ENST00000410323 MYT1LQ9UL68 1186 aa8.14□□□□□ -1.11
RNU6-101P-201ENST00000410323 LHX6Q9UPM6 363 aa8.14□□□□□ -1.11
RNU6-101P-201ENST00000410323 PBX2P40425 430 aa8.13□□□□□ -1.11
RNU6-101P-201ENST00000410323 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP8.13□□□□□ -1.11
RNU6-101P-201ENST00000410323 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa8.13□□□□□ -1.11
RNU6-101P-201ENST00000410323 CHGAP10645 457 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
RNU6-101P-201ENST00000410323 PLPP6Q8IY26 295 aa8.1□□□□□ -1.11
RNU6-101P-201ENST00000410323 DSG2Q14126 1118 aa8.09□□□□□ -1.11
RNU6-101P-201ENST00000410323 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
RNU6-101P-201ENST00000410323 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa8.06□□□□□ -1.12
RNU6-101P-201ENST00000410323 AXIN2Q9Y2T1 843 aa8.06□□□□□ -1.12
RNU6-101P-201ENST00000410323 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
RNU6-101P-201ENST00000410323 ARHGAP33O14559 1287 aa8.03□□□□□ -1.12
RNU6-101P-201ENST00000410323 OXER1Q8TDS5 423 aa8.03□□□□□ -1.12
RNU6-101P-201ENST00000410323 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa8.01□□□□□ -1.13
RNU6-101P-201ENST00000410323 TK2O00142 265 aa8□□□□□ -1.13
RNU6-101P-201ENST00000410323 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
RNU6-101P-201ENST00000410323 TBC1D12O60347 775 aa8□□□□□ -1.13
RNU6-101P-201ENST00000410323 ADGRD1Q6QNK2 874 aa8□□□□□ -1.13
RNU6-101P-201ENST00000410323 HRO43593 1189 aa7.99□□□□□ -1.13
RNU6-101P-201ENST00000410323 DMRTA1Q5VZB9 504 aa7.98□□□□□ -1.13
RNU6-101P-201ENST00000410323 PSEN2P49810 448 aa7.97□□□□□ -1.13
RNU6-101P-201ENST00000410323 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa7.97□□□□□ -1.13
RNU6-101P-201ENST00000410323 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa7.97□□□□□ -1.13
RNU6-101P-201ENST00000410323 PDE4AP27815 886 aa7.95□□□□□ -1.14
RNU6-101P-201ENST00000410323 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
RNU6-101P-201ENST00000410323 MFSD10Q14728 455 aa7.93□□□□□ -1.14
RNU6-101P-201ENST00000410323 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP7.93□□□□□ -1.14
RNU6-101P-201ENST00000410323 FOSBP53539 338 aa7.92□□□□□ -1.14
RNU6-101P-201ENST00000410323 BCL2L12Q9HB09 334 aa7.92□□□□□ -1.14
RNU6-101P-201ENST00000410323 HCSTQ9UBK5 93 aa7.91□□□□□ -1.14
RNU6-101P-201ENST00000410323 KCNK17Q96T54 332 aa7.9□□□□□ -1.14
RNU6-101P-201ENST00000410323 SLC4A5Q9BY07 1137 aa7.9□□□□□ -1.14
RNU6-101P-201ENST00000410323 ZNF454Q8N9F8 522 aa7.89□□□□□ -1.15
RNU6-101P-201ENST00000410323 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
RNU6-101P-201ENST00000410323 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa7.89□□□□□ -1.15
RNU6-101P-201ENST00000410323 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
RNU6-101P-201ENST00000410323 JPH4Q96JJ6 628 aa7.88□□□□□ -1.15
RNU6-101P-201ENST00000410323 EVI5O60447 810 aa7.87□□□□□ -1.15
RNU6-101P-201ENST00000410323 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
RNU6-101P-201ENST00000410323 CADPS2Q86UW7 1296 aa7.86□□□□□ -1.15
RNU6-101P-201ENST00000410323 KCNH8Q96L42 1107 aa7.86□□□□□ -1.15
RNU6-101P-201ENST00000410323 EMILIN3Q9NT22 766 aa7.86□□□□□ -1.15
RNU6-101P-201ENST00000410323 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa7.85□□□□□ -1.15
RNU6-101P-201ENST00000410323 ZBED2Q9BTP6 218 aa7.84□□□□□ -1.15
RNU6-101P-201ENST00000410323 PTPREP23469 700 aa7.83□□□□□ -1.16
RNU6-101P-201ENST00000410323 ZDHHC16Q969W1 377 aa7.83□□□□□ -1.16
RNU6-101P-201ENST00000410323 ADAM33Q9BZ11 813 aa7.83□□□□□ -1.16
RNU6-101P-201ENST00000410323 CAMK2BQ13554 666 aa7.82□□□□□ -1.16
RNU6-101P-201ENST00000410323 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
RNU6-101P-201ENST00000410323 STAC3Q96MF2 364 aa7.82□□□□□ -1.16
RNU6-101P-201ENST00000410323 MAP3K9P80192 1104 aa7.81□□□□□ -1.16
RNU6-101P-201ENST00000410323 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa7.8□□□□□ -1.16
RNU6-101P-201ENST00000410323 DCAF8L2P0C7V8 631 aa7.78□□□□□ -1.16
RNU6-101P-201ENST00000410323 PTPN5P54829 565 aa7.77□□□□□ -1.17
RNU6-101P-201ENST00000410323 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa7.76□□□□□ -1.17
RNU6-101P-201ENST00000410323 PHF14O94880 888 aa7.76□□□□□ -1.17
RNU6-101P-201ENST00000410323 THSD4Q6ZMP0 1018 aa7.76□□□□□ -1.17
RNU6-101P-201ENST00000410323 IFFO2Q5TF58 517 aa7.75□□□□□ -1.17
RNU6-101P-201ENST00000410323 FBXW7Q969H0 707 aa7.75□□□□□ -1.17
RNU6-101P-201ENST00000410323 TYW1BQ6NUM6 668 aa7.74□□□□□ -1.17
RNU6-101P-201ENST00000410323 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
RNU6-101P-201ENST00000410323 COL9A1P20849 921 aa7.73□□□□□ -1.17
RNU6-101P-201ENST00000410323 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
RNU6-101P-201ENST00000410323 NBPF3Q9H094 633 aa7.73□□□□□ -1.17
RNU6-101P-201ENST00000410323 RABGEF1Q9UJ41 708 aa7.73□□□□□ -1.17
RNU6-101P-201ENST00000410323 WNT2BQ93097 391 aa7.72□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10 ms