RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403904.5

CSNK1E-204, Transcript of casein kinase 1 epsilon, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CSNK1E, Length 1,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1E-204ENST00000403904 ARHGAP5Q13017 1502 aa51.34■■■■■ 5.81
CSNK1E-204ENST00000403904 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP51.33■■■■■ 5.81
CSNK1E-204ENST00000403904 ARAP3Q8WWN8 1544 aa51.32■■■■■ 5.81
CSNK1E-204ENST00000403904 FANCAO15360 1455 aa51.27■■■■■ 5.8
CSNK1E-204ENST00000403904 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa51.26■■■■■ 5.8
CSNK1E-204ENST00000403904 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP51.23■■■■■ 5.79
CSNK1E-204ENST00000403904 TEX14Q8IWB6 1497 aa51.23■■■■■ 5.79
CSNK1E-204ENST00000403904 FGD6Q6ZV73 1430 aa51.19■■■■■ 5.78
CSNK1E-204ENST00000403904 MIA2Q96PC5 1412 aa51.19■■■■■ 5.78
CSNK1E-204ENST00000403904 CFAP74Q9C0B2 1584 aa51.16■■■■■ 5.78
CSNK1E-204ENST00000403904 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP51.15■■■■■ 5.78
CSNK1E-204ENST00000403904 NEO1Q92859 1461 aa51.14■■■■■ 5.78
CSNK1E-204ENST00000403904 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa51.12■■■■■ 5.77
CSNK1E-204ENST00000403904 AKNAQ7Z591 1439 aa51.11■■■■■ 5.77
CSNK1E-204ENST00000403904 PTPN23Q9H3S7 1636 aa51.08■■■■■ 5.77
CSNK1E-204ENST00000403904 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa51.05■■■■■ 5.76
CSNK1E-204ENST00000403904 ADGRL1O94910 1474 aa51.02■■■■■ 5.76
CSNK1E-204ENST00000403904 ABCC1P33527 1531 aa50.98■■■■■ 5.75
CSNK1E-204ENST00000403904 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP50.97■■■■■ 5.75
CSNK1E-204ENST00000403904 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP50.97■■■■■ 5.75
CSNK1E-204ENST00000403904 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP50.96■■■■■ 5.75
CSNK1E-204ENST00000403904 SCAPERQ9BY12 1400 aa50.96■■■■■ 5.75
CSNK1E-204ENST00000403904 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa50.95■■■■■ 5.75
CSNK1E-204ENST00000403904 SYCP2Q9BX26 1530 aa50.94■■■■■ 5.74
CSNK1E-204ENST00000403904 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa50.94■■■■■ 5.74
CSNK1E-204ENST00000403904 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP50.94■■■■■ 5.74
CSNK1E-204ENST00000403904 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa50.91■■■■■ 5.74
CSNK1E-204ENST00000403904 MBD5Q9P267 1494 aa50.84■■■■■ 5.73
CSNK1E-204ENST00000403904 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP50.84■■■■■ 5.73
CSNK1E-204ENST00000403904 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP50.82■■■■■ 5.73
CSNK1E-204ENST00000403904 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa50.81■■■■■ 5.72
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CSNK1E-204ENST00000403904 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP50.78■■■■■ 5.728e-8■■■■□ 24.8
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CSNK1E-204ENST00000403904 KDM6BO15054 1643 aa50.76■■■■■ 5.72
CSNK1E-204ENST00000403904 POGZQ7Z3K3 1410 aa50.76■■■■■ 5.72
CSNK1E-204ENST00000403904 ARHGEF5Q12774 1597 aa50.75■■■■■ 5.71
CSNK1E-204ENST00000403904 RICTORQ6R327 1708 aa50.74■■■■■ 5.71
CSNK1E-204ENST00000403904 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa50.7■■■■■ 5.71
CSNK1E-204ENST00000403904 CCDC141Q6ZP82 1450 aa50.7■■■■■ 5.71
CSNK1E-204ENST00000403904 RSPH4AQ5TD94 716 aa50.7■■■■■ 5.71
CSNK1E-204ENST00000403904 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa50.7■■■■■ 5.71
CSNK1E-204ENST00000403904 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP50.69■■■■■ 5.71
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CSNK1E-204ENST00000403904 DAPK1P53355 1430 aa50.66■■■■■ 5.7
CSNK1E-204ENST00000403904 ITGAEP38570 1179 aa50.65■■■■■ 5.7
CSNK1E-204ENST00000403904 KDM5CP41229 1560 aa50.6■■■■■ 5.69
CSNK1E-204ENST00000403904 CROCC2H7BZ55 1655 aa50.58■■■■■ 5.69
CSNK1E-204ENST00000403904 TSPY4P0CV99 314 aa50.58■■■■■ 5.69
CSNK1E-204ENST00000403904 TSPY10P0CW01 314 aa50.58■■■■■ 5.69
CSNK1E-204ENST00000403904 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP50.55■■■■■ 5.68
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CSNK1E-204ENST00000403904 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa50.5■■■■■ 5.68
CSNK1E-204ENST00000403904 CHIC2Q9UKJ5 165 aa50.5■■■■■ 5.67
CSNK1E-204ENST00000403904 MYT1LQ9UL68 1186 aa50.5■■■■■ 5.67
CSNK1E-204ENST00000403904 C9orf84Q5VXU9 1444 aa50.49■■■■■ 5.67
CSNK1E-204ENST00000403904 SHANK2Q9UPX8 1470 aa50.48■■■■■ 5.67
CSNK1E-204ENST00000403904 HECW2Q9P2P5 1572 aa50.47■■■■■ 5.67
CSNK1E-204ENST00000403904 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP50.47■■■■■ 5.67
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CSNK1E-204ENST00000403904 MAST1Q9Y2H9 1570 aa50.44■■■■■ 5.67
CSNK1E-204ENST00000403904 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa50.44■■■■■ 5.66
CSNK1E-204ENST00000403904 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa50.43■■■■■ 5.66
CSNK1E-204ENST00000403904 ATP7AQ04656 1500 aa50.43■■■■■ 5.66
CSNK1E-204ENST00000403904 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa50.4■■■■■ 5.66
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CSNK1E-204ENST00000403904 YEATS2Q9ULM3 1422 aa50.35■■■■■ 5.65
CSNK1E-204ENST00000403904 ADGBQ8N7X0 1667 aa50.33■■■■■ 5.65
CSNK1E-204ENST00000403904 ABCA6Q8N139 1617 aa50.29■■■■■ 5.64
CSNK1E-204ENST00000403904 ADGRL2O95490 1459 aa50.28■■■■■ 5.64
CSNK1E-204ENST00000403904 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa50.28■■■■■ 5.64
CSNK1E-204ENST00000403904 NCOA1Q15788 1441 aa50.27■■■■■ 5.64
CSNK1E-204ENST00000403904 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa50.26■■■■■ 5.64
CSNK1E-204ENST00000403904 PLXNC1O60486 1568 aa50.25■■■■■ 5.63
CSNK1E-204ENST00000403904 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa50.24■■■■■ 5.63
CSNK1E-204ENST00000403904 ROCK1Q13464 1354 aa50.23■■■■■ 5.63
CSNK1E-204ENST00000403904 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa50.23■■■■■ 5.63
CSNK1E-204ENST00000403904 KIF15Q9NS87 1388 aa50.19■■■■■ 5.62
CSNK1E-204ENST00000403904 ATP10AO60312 1499 aa50.14■■■■■ 5.62
CSNK1E-204ENST00000403904 A2MP01023 1474 aa50.09■■■■■ 5.61
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CSNK1E-204ENST00000403904 REREQ9P2R6 1566 aa50■■■■■ 5.59
CSNK1E-204ENST00000403904 GCC2Q8IWJ2 1684 aa49.99■■■■■ 5.59
CSNK1E-204ENST00000403904 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa49.98■■■■■ 5.59
CSNK1E-204ENST00000403904 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa49.96■■■■■ 5.59
CSNK1E-204ENST00000403904 ERBINQ96RT1 1412 aa49.93■■■■■ 5.58
CSNK1E-204ENST00000403904 SETD5Q9C0A6 1442 aa49.86■■■■■ 5.57
CSNK1E-204ENST00000403904 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP49.85■■■■■ 5.57
CSNK1E-204ENST00000403904 KIF3BO15066 747 aa49.85■■■■■ 5.57
CSNK1E-204ENST00000403904 AGLP35573 1532 aa49.84■■■■■ 5.57
CSNK1E-204ENST00000403904 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP49.84■■■■■ 5.57
CSNK1E-204ENST00000403904 BCORL1Q5H9F3 1711 aa49.77■■■■■ 5.56
CSNK1E-204ENST00000403904 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa49.75■■■■■ 5.55
CSNK1E-204ENST00000403904 MLECQ14165 292 aa49.71■■■■■ 5.55
CSNK1E-204ENST00000403904 GGT6Q6P531 493 aa49.71■■■■■ 5.55
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