RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398245.8

GUCD1-201, Transcript of guanylyl cyclase domain containing 1, humanhuman

TSL 5

Gene GUCD1, Length 1,593 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GUCD1-201ENST00000398245 AKNAQ7Z591 1439 aa37.06■■■■□ 3.52
GUCD1-201ENST00000398245 ARAP3Q8WWN8 1544 aa37.06■■■■□ 3.52
GUCD1-201ENST00000398245 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa37.04■■■■□ 3.52
GUCD1-201ENST00000398245 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP37.04■■■■□ 3.52
GUCD1-201ENST00000398245 NCOA2Q15596 1464 aa37.03■■■■□ 3.52
GUCD1-201ENST00000398245 PHLDB1Q86UU1 1377 aa37.02■■■■□ 3.52
GUCD1-201ENST00000398245 CCNB3Q8WWL7 1395 aa37.02■■■■□ 3.52
GUCD1-201ENST00000398245 RAPGEF3O95398 923 aa36.95■■■■□ 3.51
GUCD1-201ENST00000398245 ADGRL1O94910 1474 aa36.94■■■■□ 3.5
GUCD1-201ENST00000398245 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP36.92■■■■□ 3.5
GUCD1-201ENST00000398245 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP36.91■■■■□ 3.5
GUCD1-201ENST00000398245 ITSN2Q9NZM3 1697 aa36.91■■■■□ 3.5
GUCD1-201ENST00000398245 SCAPERQ9BY12 1400 aa36.9■■■■□ 3.5
GUCD1-201ENST00000398245 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP36.88■■■■□ 3.5
GUCD1-201ENST00000398245 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa36.88■■■■□ 3.49
GUCD1-201ENST00000398245 RICTORQ6R327 1708 aa36.86■■■■□ 3.49
GUCD1-201ENST00000398245 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.86■■■■□ 3.49
GUCD1-201ENST00000398245 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP36.83■■■■□ 3.49
GUCD1-201ENST00000398245 ABCC1P33527 1531 aa36.81■■■■□ 3.48
GUCD1-201ENST00000398245 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa36.81■■■■□ 3.48
GUCD1-201ENST00000398245 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP36.8■■■■□ 3.48
GUCD1-201ENST00000398245 POGZQ7Z3K3 1410 aa36.77■■■■□ 3.48
GUCD1-201ENST00000398245 SYCP2Q9BX26 1530 aa36.74■■■■□ 3.47
GUCD1-201ENST00000398245 MYOM3Q5VTT5 1437 aa36.74■■■■□ 3.47
GUCD1-201ENST00000398245 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP36.74■■■■□ 3.47
GUCD1-201ENST00000398245 AFAP1Q8N556 730 aa36.74■■■■□ 3.47
GUCD1-201ENST00000398245 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa36.72■■■■□ 3.47
GUCD1-201ENST00000398245 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa36.68■■■■□ 3.46
GUCD1-201ENST00000398245 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa36.67■■■■□ 3.46
GUCD1-201ENST00000398245 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa36.67■■■■□ 3.46
GUCD1-201ENST00000398245 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa36.66■■■■□ 3.46
GUCD1-201ENST00000398245 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa36.66■■■■□ 3.46
GUCD1-201ENST00000398245 KDM5CP41229 1560 aa36.63■■■■□ 3.45
GUCD1-201ENST00000398245 MIA2Q96PC5 1412 aa36.63■■■■□ 3.45
GUCD1-201ENST00000398245 YEATS2Q9ULM3 1422 aa36.6■■■■□ 3.45
GUCD1-201ENST00000398245 MBD5Q9P267 1494 aa36.59■■■■□ 3.45
GUCD1-201ENST00000398245 MYT1LQ9UL68 1186 aa36.57■■■■□ 3.45
GUCD1-201ENST00000398245 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa36.57■■■■□ 3.44
GUCD1-201ENST00000398245 FGD6Q6ZV73 1430 aa36.56■■■■□ 3.44
GUCD1-201ENST00000398245 MAGI2Q86UL8 1455 aa36.56■■■■□ 3.44
GUCD1-201ENST00000398245 HECW2Q9P2P5 1572 aa36.55■■■■□ 3.44
GUCD1-201ENST00000398245 PTPN23Q9H3S7 1636 aa36.55■■■■□ 3.44
GUCD1-201ENST00000398245 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa36.55■■■■□ 3.44
GUCD1-201ENST00000398245 MLH3Q9UHC1 1453 aa36.51■■■■□ 3.43
GUCD1-201ENST00000398245 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa36.5■■■■□ 3.43
GUCD1-201ENST00000398245 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP36.49■■■■□ 3.43
GUCD1-201ENST00000398245 CCDC141Q6ZP82 1450 aa36.46■■■■□ 3.43
GUCD1-201ENST00000398245 ARHGEF5Q12774 1597 aa36.46■■■■□ 3.43
GUCD1-201ENST00000398245 ABCA6Q8N139 1617 aa36.45■■■■□ 3.42
GUCD1-201ENST00000398245 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP36.44■■■■□ 3.42
GUCD1-201ENST00000398245 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa36.43■■■■□ 3.42
GUCD1-201ENST00000398245 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP36.42■■■■□ 3.42
GUCD1-201ENST00000398245 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa36.42■■■■□ 3.42
GUCD1-201ENST00000398245 ATP7AQ04656 1500 aa36.41■■■■□ 3.42
GUCD1-201ENST00000398245 RSPH4AQ5TD94 716 aa36.41■■■■□ 3.42
GUCD1-201ENST00000398245 ATP10AO60312 1499 aa36.4■■■■□ 3.42
GUCD1-201ENST00000398245 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP36.39■■■■□ 3.42
GUCD1-201ENST00000398245 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP36.35■■■■□ 3.41
GUCD1-201ENST00000398245 TSPY4P0CV99 314 aa36.35■■■■□ 3.41
GUCD1-201ENST00000398245 TSPY10P0CW01 314 aa36.35■■■■□ 3.41
GUCD1-201ENST00000398245 C9orf84Q5VXU9 1444 aa36.35■■■■□ 3.41
GUCD1-201ENST00000398245 ABCC5O15440 1437 aa36.32■■■■□ 3.4
GUCD1-201ENST00000398245 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP36.31■■■■□ 3.4
GUCD1-201ENST00000398245 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa36.31■■■■□ 3.4
GUCD1-201ENST00000398245 CROCC2H7BZ55 1655 aa36.29■■■■□ 3.4
GUCD1-201ENST00000398245 DAPK1P53355 1430 aa36.29■■■■□ 3.4
GUCD1-201ENST00000398245 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa36.27■■■■□ 3.4
GUCD1-201ENST00000398245 MAST1Q9Y2H9 1570 aa36.26■■■■□ 3.4
GUCD1-201ENST00000398245 REREQ9P2R6 1566 aa36.25■■■■□ 3.39
GUCD1-201ENST00000398245 ADGBQ8N7X0 1667 aa36.24■■■■□ 3.39
GUCD1-201ENST00000398245 BCORL1Q5H9F3 1711 aa36.22■■■■□ 3.39
GUCD1-201ENST00000398245 MLECQ14165 292 aa36.21■■■■□ 3.39
GUCD1-201ENST00000398245 CHIC2Q9UKJ5 165 aa36.2■■■■□ 3.39
GUCD1-201ENST00000398245 A2MP01023 1474 aa36.2■■■■□ 3.39
GUCD1-201ENST00000398245 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP36.19■■■■□ 3.38
GUCD1-201ENST00000398245 SHANK2Q9UPX8 1470 aa36.18■■■■□ 3.38
GUCD1-201ENST00000398245 PLXNC1O60486 1568 aa36.15■■■■□ 3.38
GUCD1-201ENST00000398245 AGLP35573 1532 aa36.14■■■■□ 3.38
GUCD1-201ENST00000398245 ADAMTSL3P82987 1691 aa36.13■■■■□ 3.38
GUCD1-201ENST00000398245 ITGAEP38570 1179 aa36.13■■■■□ 3.37
GUCD1-201ENST00000398245 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP36.12■■■■□ 3.37
GUCD1-201ENST00000398245 PTPRKQ15262 1439 aa36.11■■■■□ 3.37
GUCD1-201ENST00000398245 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP36.11■■■■□ 3.37
GUCD1-201ENST00000398245 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa36.09■■■■□ 3.37
GUCD1-201ENST00000398245 MADDQ8WXG6 1647 aa36.08■■■■□ 3.37
GUCD1-201ENST00000398245 KIF15Q9NS87 1388 aa36.04■■■■□ 3.36
GUCD1-201ENST00000398245 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa36.03■■■■□ 3.36
GUCD1-201ENST00000398245 NCOA1Q15788 1441 aa36.02■■■■□ 3.36
GUCD1-201ENST00000398245 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa36.01■■■■□ 3.36
GUCD1-201ENST00000398245 ADGRL2O95490 1459 aa36.01■■■■□ 3.36
GUCD1-201ENST00000398245 KIF3BO15066 747 aa36■■■■□ 3.35
GUCD1-201ENST00000398245 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP36■■■■□ 3.35
GUCD1-201ENST00000398245 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.99■■■■□ 3.35
GUCD1-201ENST00000398245 GGT6Q6P531 493 aa35.99■■■■□ 3.35
GUCD1-201ENST00000398245 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP35.95■■■■□ 3.35
GUCD1-201ENST00000398245 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP35.9■■■■□ 3.34
GUCD1-201ENST00000398245 PTPRMP28827 1452 aa35.9■■■■□ 3.34
GUCD1-201ENST00000398245 PLPPR3Q6T4P5 718 aa35.88■■■■□ 3.33
GUCD1-201ENST00000398245 ROCK1Q13464 1354 aa35.87■■■■□ 3.33
GUCD1-201ENST00000398245 ERBINQ96RT1 1412 aa35.87■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms